{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[520.5815471400721, 1221.681792053189, 0, 1, 0.2987961322661605, 0, 0.0008185437537866347, 0.003816345967488568, 0.7012038677338395, 1, 0.0005660867966126747],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5277891831129, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987741443091586, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012258556908414, 1, 0.0005553808382664476],
[521.0567528625193, 1220.783929463753, 0, 1, 0.2991414531475031, 0, 0.000819145776631631, 0.003819152814949329, 0.7008585468524969, 1, 0.0005555411741090794],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.8722482688956, 1221.249183840831, 0, 1, 0.2989873373167301, 0, 0.0008188337099681805, 0.003817697847701534, 0.7010126626832699, 1, 0.0005554962194175968],
[520.648584474408, 1221.593642926613, 0, 1, 0.298838230577778, 0, 0.0008186028191864736, 0.003816621351668645, 0.701161769422222, 1, 0.0005555534214773481],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.0567528625193, 1220.865565554184, 0, 0, 0.2991274337285757, 0, 0, 0, 1, 1, 7.114040072538832e-05],
[520.8722482688958, 1221.210024639967, 0, 1, 0.2989940580700378, 0, 0.0008188599666096067, 0.003817820265626248, 0.7010059419299622, 1, 0.000484119724082299],
[520.6145078532094, 1221.627719547812, 0, 1, 0.2988186715172395, 0, 0.0008185799847192007, 0.003816514889153118, 0.7011813284827606, 1, 0.0005555729490773695],
[521.148584474408, 1221.093642926613, 0, 1, 0.2991252170783554, 0, 0.0008189380116690192, 0.003818184139819159, 0.7008747829216446, 1, 0.0005554924697738782],
[520.2656351894846, 1222.058897303691, 0, 2, 0.2986043216902947, 0, 0.001636582332007673, 0.007630336624434822, 0.4919558975515316, 1, 0.001111198675576537],
[520.566948383977, 1221.554483725749, 1, 0, 0.298812091275156, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.298812091275156, 0.0005555276736663185],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553938474266351],
[520.527789183113, 1221.714438217908, 0, 1, 0.298768897341908, 0, 0.0008185218809877381, 0.003816243988617578, 0.701231102658092, 1, 0.0005555600143000238],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553809836951445],
[520.6877436752721, 1221.556746474072, 1, 0, 0.2988603187550554, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988603187550554, 0.0005553882499311208],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.000555639672931413],
[520.4114074697598, 1221.670865439102, 1, 0, 0.2987295236067105, 0.001921556648540815, 0, -0.008958989587343581, 1, 0.2987295236067105, 0.0005555940330224576],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.000555533090545745],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 0, 0.2988607069018208, 0, 0, 0, 1, 1, 8.989019337649977e-05],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.000465468040631299],
[519.9988255037066, 1222.243401897315, 0, 0, 0.2984652864713373, 0, 0, 0, 1, 1, 8.98898784608444e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3432845894894, 1221.898942811532, 0, 1, 0.298662996686579, 0, 0.000818398285621761, 0.003815667742480014, 0.701337003313421, 1, 0.000465468040631299],
[519.9988255037066, 1222.243401897315, 0, 0, 0.2984652864713373, 0, 0, 0, 1, 1, 8.988987848413586e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3432845894894, 1221.898942811532, 0, 1, 0.298662996686579, 0, 0.000818398285621761, 0.003815667742480014, 0.701337003313421, 1, 0.000465468040631299],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 0, 0.2988607069018208, 0, 0, 0, 1, 1, 9.176619856976222e-05],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0004636084663193027],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 0, 0.2988607069018208, 0, 0, 0, 1, 1, 8.988987875252836e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.000465468040631299],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.9988255037066, 1222.243401897315, 0, 0, 0.2984652864713373, 0, 0, 0, 1, 1, 8.98898783929891e-05],
[520.3432845894894, 1221.898942811532, 0, 1, 0.298662996686579, 0, 0.0008183982856217611, 0.003815667742480015, 0.701337003313421, 1, 0.000465468040631299],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.609425273544, 1220.632802127477, 0, 0, 0.2993897272548901, 0, 0, 0, 1, 1, 8.988987832165449e-05],
[521.1485844744082, 1221.093642926613, 0, 1, 0.2991252170783555, 0, 0.0008189380116690192, 0.003818184139819159, 0.7008747829216445, 1, 0.000465468040631299],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.4316230222861, 1219.818389472987, 1, 0.5, 0.2986526487224607, 0.001925181208994461, 0.0004098970832994419, -0.007064800673078023, 0.9625203815639588, 0.4126462555917592, 0.0005565917701421112],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5583858330705, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987864589929095, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012135410070905, 1, 0.0005553295953433621],
[520.566948383977, 1221.675279017044, 1, 0, 0.2987913736659508, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987913736659508, 0.0005556276786692315],
[521.0583858330705, 1221.183841567951, 0, 1, 0.2990734454934869, 0, 0.0008188775235643801, 0.003817902122476589, 0.7009265545065131, 1, 0.0005553899461511389],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.39452923359, 0, 1, 0.2988881476911235, 0, 0.0008187362691295889, 0.003817243543396226, 0.7011118523088765, 1, 0.0005553901192366671],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.0094161920711, 1219.240383070438, 0, 1.5, 0.2989848936090547, 0, 0.001230274210752862, 0.005735981737557456, 0.5869364287269664, 1, 0.0005561738757193911],
[520.8432845894894, 1221.398942811532, 0, 1, 0.2989499831871565, 0, 0.0008187333105906453, 0.003817229749621471, 0.7010500168128435, 1, 0.0005555879524752818],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.8148387691506, 1221.427388631871, 1, 0, 0.2989336560542863, 0.001920068180782473, 0, -0.008952049814239202, 1, 0.2989336560542863, 0.0005554673217154908],
[520.5669483839771, 1221.675279017044, 1, 0, 0.2987913736659508, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527369, 1, 0.2987913736659509, 0.0005555989641152911],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.1877436752721, 1222.054483725749, 0, 1, 0.2985737204012434, 0, 0.0008182941213482081, 0.003815182091097921, 0.7014262795987566, 1, 0.000555597120458027],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555920936308091],
[520.1877436752721, 1222.054483725749, 0, 1, 0.2985737204012434, 0, 0.0008182941213482081, 0.003815182091097921, 0.7014262795987566, 1, 0.0005555846748469656],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555006144149928],
[520.4461530926818, 1221.79607430834, 0, 1, 0.2987220404300807, 0, 0.0008184671902519423, 0.003815989000697815, 0.7012779595699192, 1, 0.0005554668971978123],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.566948383977, 1221.675279017044, 1, 0, 0.2987913736659508, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987913736659508, 0.0005556038847004255],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.8388710115473, 1222.403356389474, 0, 2, 0.2983734769114245, 0, 0.001636121162091094, 0.007628186484087016, 0.4922797779013634, 1, 0.001111578563705909],
[520.3432845894894, 1221.898942811532, 0, 1, 0.298662996686579, 0, 0.000818398285621761, 0.003815667742480014, 0.701337003313421, 1, 0.0005553696421377709],
[520.527789183113, 1221.714438217908, 0, 1, 0.298768897341908, 0, 0.0008185218809877381, 0.003816243988617578, 0.701231102658092, 1, 0.0005554166465337554],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553363620642821],
[520.527789183113, 1221.714438217908, 0, 1, 0.298768897341908, 0, 0.0008185218809877381, 0.003816243988617578, 0.701231102658092, 1, 0.000555256870856082],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005553938478467752],
[520.8041253886254, 1221.898942811532, 0, 1, 0.298848458404624, 0, 0.000818398285621761, 0.003815667742480014, 0.701151541595376, 1, 0.0005555584857235128],
[520.6900064235954, 1221.552220977426, 0, 1, 0.2988620056582668, 0, 0.0008186305774139145, 0.003816750770528502, 0.7011379943417333, 1, 0.0005554239555913625],
[521.5022638129316, 1220.73996358809, 0, 1, 0.2993282194697343, 0, 0.0008191752787880601, 0.003819290364634608, 0.7006717805302658, 1, 0.000555266217278997],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.0583858330705, 1221.183841567951, 0, 1, 0.2990734454934869, 0, 0.0008188775235643801, 0.003817902122476589, 0.7009265545065131, 1, 0.0005554390386165421],
[520.7269028761363, 1221.515324524885, 0, 1, 0.2988831832258637, 0, 0.0008186553045406576, 0.003816866057304557, 0.7011168167741364, 1, 0.0005554086301781638],
[520.3432845894894, 1221.898942811532, 0, 1, 0.298662996686579, 0, 0.000818398285621761, 0.003815667742480014, 0.701337003313421, 1, 0.0005554818216466836],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553803937915501],
[520.6877436752721, 1221.39452923359, 0, 1, 0.2988881476911235, 0, 0.0008187362691295889, 0.003817243543396226, 0.7011118523088765, 1, 0.0005555600143035138],
[520.6877436752721, 1221.556746474072, 1, 0, 0.2988603187550554, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988603187550554, 0.0005553938477202064],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005554239555802157],
[520.527789183113, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987741443091586, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012258556908414, 1, 0.0005555600137012096],
[520.1877436752721, 1222.054483725749, 0, 1, 0.2985737204012434, 0, 0.0008182941213482081, 0.003815182091097921, 0.7014262795987566, 1, 0.0005555531406867368],
[520.5669483839771, 1221.554483725749, 1, 0, 0.298812091275156, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527369, 1, 0.298812091275156, 0.0005555380614968938],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553557547132054],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005558336337443104],
[520.6877436752721, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2988385187667002, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7011614812332998, 1, 0.0005553937880234137],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555884509864162],
[520.2269028761363, 1222.015324524885, 1, 0, 0.2985961967252862, 0.001922238151220902, 0, -0.00896216699843853, 1, 0.2985961967252861, 0.0005555603198177122],
[520.3432845894894, 1221.898942811532, 0, 1, 0.298662996686579, 0, 0.000818398285621761, 0.003815667742480014, 0.701337003313421, 1, 0.000555557861494511],
[520.4255896816438, 1221.898942811532, 0, 1, 0.2986961269132461, 0, 0.000818398285621761, 0.003815667742480014, 0.7013038730867539, 1, 0.0005555600143035138],
[520.6877436752721, 1221.804133119107, 1, 0, 0.2988178886854663, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988178886854662, 0.0005554239487452812],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.000555481821922775],
[520.8476981674314, 1221.39452923359, 0, 1, 0.2989525164617337, 0, 0.0008187362691295889, 0.003817243543396226, 0.7010474835382663, 1, 0.0005558125944649431],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.000555512002356033],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.1284479508859, 1221.113779450135, 1, 0, 0.2991136592575167, 0.001918912705556703, 0, -0.008946662572325742, 1, 0.2991136592575167, 0.0005553819687612605],
[520.8476981674314, 1221.39452923359, 0, 1, 0.2989525164617337, 0, 0.0008187362691295889, 0.003817243543396226, 0.7010474835382663, 1, 0.0005554703663190239],
[520.6877436752721, 1221.593642926613, 0, 1, 0.2988539897627054, 0, 0.0008186028191864736, 0.003816621351668645, 0.7011460102372946, 1, 0.0005554600275895403],
[520.527789183113, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987741443091586, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012258556908414, 1, 0.0005554824091672208],
[520.8085389665673, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2989093157875957, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989093157875957, 0.0005553809241855599],
[520.6877436752721, 1221.515324524885, 0, 1, 0.2988674243428962, 0, 0.0008186553045406576, 0.003816866057304557, 0.7011325756571039, 1, 0.000555560429713678],
[520.590412939507, 1221.734119553669, 1, 0, 0.2987907265442502, 0.001920895919603116, 0, -0.008955909030922096, 1, 0.2987907265442502, 0.0005553937884451629],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005555600136803227],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005554239487579037],
[520.5669483839771, 1221.675279017044, 1, 0, 0.2987913736659508, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527369, 1, 0.2987913736659509, 0.0005554823497908031],
[520.6877436752721, 1221.515324524885, 0, 1, 0.2988674243428962, 0, 0.0008186553045406576, 0.003816866057304557, 0.7011325756571039, 1, 0.000555823327719668],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005552942571114091],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005552470381779173],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005556014416377418],
[520.8476981674314, 1221.39452923359, 0, 1, 0.2989525164617337, 0, 0.0008187362691295889, 0.003817243543396226, 0.7010474835382663, 1, 0.0005553932668618282],
[520.6877436752721, 1221.593642926613, 1, 0, 0.2988539897627054, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988539897627054, 0.0005558126011112886],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555120044035839],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553437093282966],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 0, 0.2988607069018208, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000126287997350033],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0004290530405322142],
[520.4461530926818, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2987634689061988, 0.001921428363064331, 0, -0.008958391474220609, 1, 0.2987634689061989, 0.000555485459726958],
[520.3297713793286, 1221.421216045744, 0, 1, 0.2987394725973779, 0, 0.0008187183805742475, 0.003817160140504536, 0.701260527402622, 1, 0.0005558381083867902],
[520.3253578013866, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2987148397935466, 0.001921874429156132, 0, -0.008960471195094175, 1, 0.2987148397935466, 0.0005555192682381078],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.4461530926818, 1221.554483725749, 0, 0, 0.2987634689061988, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001489066074801963],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.566948383977, 1221.554483725749, 1, 0, 0.298812091275156, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.298812091275156, 0.0004064410918576326],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005556032864256125],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 0, 0.2988607069018208, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002673884452226283],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0002879584974008934],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005551725411014323],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 0, 1, 0.2988163339259357, 0, 0.0008184557185032574, 0.00381593551527125, 0.7011836660740642, 1, 0.0005551917330275546],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005552835426112238],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 0, 1, 0.2988163339259357, 0, 0.0008184557185032574, 0.00381593551527125, 0.7011836660740642, 1, 0.0005552835410001526],
[520.566948383977, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2987677224416382, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987677224416382, 0.0005554693001471347],
[520.6877436752721, 1221.774040209288, 0, 1, 0.2988230493724091, 0, 0.0008184819509086159, 0.003816057820198683, 0.7011769506275909, 1, 0.0005554602365011809],
[520.5606485813937, 1221.940294504031, 1, 0, 0.2987433956045059, 0.00192100575163557, 0, -0.008956421107438739, 1, 0.2987433956045059, 0.0005553629323058687],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005553807440045088],
[520.566948383977, 1221.933994701448, 1, 0, 0.2987470109842326, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987470109842325, 0.0005553665982397021],
[521.609425273544, 1220.891517811881, 0, 0, 0.2993452757333587, 0, 0, 0, 1, 1, 7.457559312560952e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.1485844744082, 1221.352358611017, 0, 1, 0.2990808048296472, 0, 0.0008187645383001924, 0.003817375344457242, 0.7009191951703528, 1, 0.0004806764580783988],
[520.4114074697598, 1221.929581123506, 1, 0, 0.2986851660362593, 0.001921556648540815, 0, -0.008958989587343581, 1, 0.2986851660362593, 0.0005554638616999133],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005553993031894132],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 0, 1, 0.2988163339259357, 0, 0.0008184557185032574, 0.00381593551527125, 0.7011836660740642, 1, 0.0005554552064173174],
[520.3432845894894, 1222.157658495935, 0, 1, 0.298618653065475, 0, 0.0008182250408107439, 0.003814860012736974, 0.701381346934525, 1, 0.0005553629323705272],
[520.527789183113, 1221.942557252354, 0, 1, 0.2987297834066129, 0, 0.0008183690747694296, 0.003815531550959419, 0.7012702165933871, 1, 0.0005554730727123665],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005553034710652139],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005553229361140427],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 0, 1, 0.2988163339259357, 0, 0.0008184557185032574, 0.00381593551527125, 0.7011836660740642, 1, 0.0005555200654825495],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005554493924196939],
[520.5583858330705, 1221.942557252354, 0, 1, 0.2987420970408912, 0, 0.0008183690747694296, 0.003815531550959419, 0.7012579029591088, 1, 0.0005554688794415473],
[520.566948383977, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2987677224416382, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987677224416382, 0.0005554049154219211],
[520.8722482688958, 1221.507899525234, 0, 1, 0.298942942461968, 0, 0.0008186602807797414, 0.003816889258324506, 0.701057057538032, 1, 0.0005554652073113357],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005553590903619332],
[520.566948383977, 1221.933994701448, 1, 0, 0.2987470109842326, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987470109842325, 0.0005552311328148919],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 0, 2, 0.2988163339259357, 0, 0.001636911437006515, 0.0076318710305425, 0.4916585335690648, 1, 0.00111085977488438],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005553079504095245],
[520.527789183113, 1221.973153902312, 0, 1, 0.2987245379973344, 0, 0.0008183485838510844, 0.003815436014913564, 0.7012754620026656, 1, 0.0005551924091431823],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.00055517534254207],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005553948549909406],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.527789183113, 1221.973153902312, 0, 1, 0.2987245379973344, 0, 0.0008183485838510843, 0.003815436014913563, 0.7012754620026656, 1, 0.0005551610433826316],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5277891831129, 1221.973153902312, 0, 1, 0.2987245379973343, 0, 0.0008183485838510843, 0.003815436014913563, 0.7012754620026657, 1, 0.00055536113037582],
[520.3140767339945, 1222.156269701473, 1, 0, 0.2986071342897683, 0.001921916097824968, 0, -0.008960665469444871, 1, 0.2986071342897683, 0.0005555149782671256],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1222.191735117134, 0, 1, 0.2987514340555794, 0, 0.0008182022274141469, 0.003814753648460532, 0.7012485659444205, 1, 0.0005557886382826837],
[520.648584474408, 1221.852358611017, 0, 1, 0.2987938609390375, 0, 0.000818429487779346, 0.003815813218183329, 0.7012061390609625, 1, 0.0005553724183602559],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005553875683499144],
[520.8722482688956, 1221.46874032437, 0, 1, 0.2989496612195517, 0, 0.0008186865262998402, 0.003817011624397584, 0.7010503387804483, 1, 0.0005554127208026505],
[520.527789183113, 1221.973153902312, 0, 1, 0.2987245379973344, 0, 0.0008183485838510844, 0.003815436014913564, 0.7012754620026656, 1, 0.000555467452826083],
[521.2558665555425, 1221.124281238587, 1, 0, 0.2991631115720973, 0.001918443636151277, 0, -0.008944475601714108, 1, 0.2991631115720973, 0.0005553532426856963],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.0322027610549, 1221.46874032437, 0, 1, 0.2990140147863964, 0, 0.0008186865262998402, 0.003817011624397584, 0.7009859852136036, 1, 0.0005552581722587621],
[520.7749175331305, 1221.695428902337, 0, 1, 0.2988716098374174, 0, 0.0008185346170104568, 0.00381630336854531, 0.7011283901625827, 1, 0.0005553037413037104],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005553022837494058],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005553073064720949],
[520.527789183113, 1221.973153902312, 0, 1, 0.2987245379973344, 0, 0.0008183485838510844, 0.003815436014913564, 0.7012754620026656, 1, 0.0005554393598931668],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005553073061572726],
[520.566948383977, 1221.933994701448, 1, 0, 0.2987470109842326, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987470109842326, 0.000555444377704601],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 0, 1, 0.2988163339259357, 0, 0.0008184557185032574, 0.00381593551527125, 0.7011836660740642, 1, 0.0005555247673155997],
[520.7609794973349, 1221.822268680244, 0, 1, 0.2988442474940322, 0, 0.0008184496433185438, 0.003815907190570736, 0.7011557525059678, 1, 0.0005552810103612434],
[520.5904129395069, 1221.910530145918, 1, 0, 0.2987604770059429, 0.001920895919603116, 0, -0.0089559090309221, 1, 0.2987604770059429, 0.0005553113126164735],
[519.8824437903535, 1222.618499295071, 0, 2, 0.2983541821617635, 0, 0.001635833255552035, 0.007626844160045975, 0.4923068536898878, 1, 0.0011117033800193],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 0, 1, 0.2988163339259357, 0, 0.0008184557185032574, 0.00381593551527125, 0.7011836660740642, 1, 0.0005553408981169445],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005553839977580923],
[520.5669483839771, 1221.933994701448, 1, 1, 0.2987470109842326, 0.001920982503987915, 0.0008183748093892157, -0.005140754430703861, 0.9107502234279867, 0.5082442453964521, 0.001111310022134993],
[520.594826517449, 1221.44527576884, 0, 2, 0.298842044930085, 0, 0.001637404507329318, 0.007634169902080415, 0.4916224779578249, 1, 0.001111376325795468],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 0, 0, 0.2988163339259357, 0, 0, 0, 1, 1, 4.138583690671235e-06],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 0, 1, 0.2988163339259357, 0, 0.0008184557185032574, 0.00381593551527125, 0.7011836660740642, 1, 0.0005510063821089302],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2988385187667003, 0, 0.000818542380585607, 0.003816339565130502, 0.7011614812332998, 1, 0.0005554803011881889],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005550519763030629],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005554370334415276],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.000555464146510338],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.000555440877034796],
[521.0567528625193, 1220.943883955912, 1, 0, 0.2991139852934676, 0.001919176739398001, 0, -0.008947893593246565, 1, 0.2991139852934676, 0.0005552795785847372],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.8722482688956, 1221.249183840831, 0, 1, 0.2989873373167301, 0, 0.0008188337099681805, 0.003817697847701534, 0.7010126626832699, 1, 0.0005553683227701637],
[520.3678346909537, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2986875786760256, 0.001921717549267625, 0, -0.008959739764517477, 1, 0.2986875786760256, 0.000555312839083833],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.527789183113, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987741443091586, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012258556908414, 1, 0.0005554648000127299],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005557208791440404],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.648584474408, 1221.593642926613, 0, 1, 0.298838230577778, 0, 0.0008186028191864736, 0.003816621351668645, 0.701161769422222, 1, 0.0005553371092902763],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005552884558692209],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005553709249243271],
[520.8085389665673, 1221.433688434454, 1, 0, 0.2989300401376909, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989300401376909, 0.0005553639672783067],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.0501295491576, 1221.433688434454, 1, 0, 0.2990272415568901, 0.001919201134956548, 0, -0.008948007334132198, 1, 0.2990272415568902, 0.0005551342479793418],
[520.8085389665673, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2989093157875957, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989093157875957, 0.0005552356014983034],
[520.0094133876695, 1219.719823194707, 0, 1.5, 0.2989024972697508, 0, 0.001229790621973478, 0.005733727072391929, 0.5870399133032881, 1, 0.0005552894378841295],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005552529902775385],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.9464593596756, 1221.295768041346, 1, 0, 0.2990092027196437, 0.001919583062776078, 0, -0.008949788019266245, 1, 0.2990092027196437, 0.0005551962882822194],
[520.8171015174739, 1221.425125883547, 0, 1, 0.2989349548107323, 0, 0.0008187157598191913, 0.003817147921599994, 0.7010650451892677, 1, 0.0005554601001979395],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553932668300698],
[520.7749175331305, 1221.436713217933, 0, 1, 0.2989159918009648, 0, 0.0008187079929548312, 0.003817111709679319, 0.7010840081990353, 1, 0.0005555605442840911],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553809241926963],
[520.724640127813, 1221.517587273208, 1, 0, 0.2988818844694177, 0.00192040077026996, 0, -0.008953600466288686, 1, 0.2988818844694177, 0.0005552975433361142],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005554924094359399],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555165393525762],
[520.8722482688956, 1221.136231734885, 0, 1, 0.2990067237030702, 0, 0.000818909450077725, 0.003818050975387501, 0.7009932762969298, 1, 0.0005555466468416308],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.517587273208, 0, 1, 0.298867036178682, 0, 0.0008186537880574428, 0.003816858986913298, 0.701132963821318, 1, 0.000555368905357492],
[520.3432845894894, 1221.898942811532, 0, 1, 0.298662996686579, 0, 0.0008183982856217611, 0.003815667742480015, 0.701337003313421, 1, 0.0005553819648792057],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.8722482688956, 1221.210024639966, 0, 1, 0.2989940580700378, 0, 0.0008188599666096068, 0.003817820265626249, 0.7010059419299622, 1, 0.00055543338405069],
[520.6306576863053, 1221.464214827723, 0, 1, 0.2988532174111618, 0, 0.0008186895595144726, 0.003817025766337312, 0.7011467825888382, 1, 0.0005553856392144362],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.566948383977, 1221.681578819627, 1, 0, 0.2987902932651709, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987902932651709, 0.0005555130588511264],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553225873174448],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005553682053720314],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.4335534875153, 1221.808673913506, 1, 0, 0.2987148085968899, 0.001921474880508428, 0, -0.008958608355308975, 1, 0.2987148085968899, 0.0005554053970022477],
[520.5606485813937, 1221.681578819628, 1, 0, 0.2987877577493554, 0.00192100575163557, 0, -0.008956421107438739, 1, 0.2987877577493554, 0.0005553951351158624],
[520.3455473378126, 1221.896680063209, 1, 0, 0.298664295443025, 0.001921799859951126, 0, -0.008960123526587135, 1, 0.298664295443025, 0.0005556743274823071],
[521.4290279908688, 1220.813199410152, 1, 0, 0.2992861840851528, 0.001917806539948735, 0, -0.008941505229620705, 1, 0.2992861840851528, 0.0005552753928820761],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.0583858330705, 1221.183841567951, 0, 1, 0.2990734454934869, 0, 0.0008188775235643802, 0.003817902122476589, 0.7009265545065131, 1, 0.0005553067130724509],
[520.8432845894894, 1221.398942811532, 0, 1, 0.2989499831871565, 0, 0.0008187333105906455, 0.003817229749621472, 0.7010500168128435, 1, 0.0005556379518753142],
[519.6877436752721, 1222.515324524885, 0, 1, 0.2982934384406483, 0, 0.0008179856562441352, 0.003813743915617877, 0.7017065615593517, 1, 0.0005554556247468414],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.6877436752721, 1222.554483725749, 1, 0, 0.298286733900666, 0.001924232411039603, 0, -0.008971464956405974, 1, 0.2982867339006661, 0.0005555051987645184],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.6877436752721, 1222.554483725749, 0, 0, 0.298286733900666, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000169163071051821],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.1877436752721, 1222.054483725749, 0, 1, 0.2985737204012434, 0, 0.0008182941213482081, 0.003815182091097921, 0.7014262795987566, 1, 0.0003862168656508986],
[521.0567528625193, 1220.904724755048, 0, 1, 0.2991207093598616, 0, 0.0008190647310343007, 0.003818774951167309, 0.7008792906401384, 1, 0.0005554940977585017],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.8722482688958, 1221.249183840831, 0, 1, 0.2989873373167302, 0, 0.0008188337099681805, 0.003817697847701534, 0.7010126626832698, 1, 0.0005554006854608467],
[520.6877436752721, 1221.515324524885, 0, 1, 0.2988674243428962, 0, 0.0008186553045406576, 0.003816866057304557, 0.7011325756571039, 1, 0.0005555399682566822],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.6946483748003, 1219.305714295564, 0, 1.75, 0.2988467740034112, 0, 0.001435243007132987, 0.006691620133070984, 0.5372453175041249, 1, 0.0005565609165827412],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553919742016684],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.1485844744082, 1221.093642926613, 0, 1, 0.2991252170783555, 0, 0.0008189380116690192, 0.003818184139819159, 0.7008747829216445, 1, 0.0005552778992568848],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.527789183113, 1221.714438217908, 0, 1, 0.298768897341908, 0, 0.0008185218809877381, 0.003816243988617578, 0.701231102658092, 1, 0.0005557348370407992],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005555258238483608],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3678346909537, 1221.835233509204, 0, 1, 0.298683801095895, 0, 0.0008184409587927204, 0.003815866700181612, 0.701316198904105, 1, 0.0005556077105154962],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.527789183113, 1221.714438217908, 0, 1, 0.298768897341908, 0, 0.0008185218809877381, 0.003816243988617578, 0.701231102658092, 1, 0.0005553180471160531],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2690734987095, 1221.973153902312, 0, 1, 0.2986204015240852, 0, 0.0008183485838510843, 0.003815436014913563, 0.7013795984759148, 1, 0.0005555844079433511],
[520.5583858330705, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987864589929095, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012135410070905, 1, 0.0005554186169016173],
[520.6877436752721, 1221.593642926613, 0, 1, 0.2988539897627054, 0, 0.0008186028191864736, 0.003816621351668645, 0.7011460102372946, 1, 0.0005554399548767609],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.566948383977, 1221.675279017044, 1, 0, 0.2987913736659508, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987913736659509, 0.0005555380613543644],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 0, 0.2988607069018208, 0, 0, 0, 1, 1, 6.758364312884877e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.000487773589112892],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.593642926613, 0, 1, 0.2988539897627054, 0, 0.0008186028191864736, 0.003816621351668645, 0.7011460102372946, 1, 0.0005556073301241428],
[520.3082326995736, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2986635851609237, 0.001921937684536698, 0, -0.008960766114474389, 1, 0.2986635851609237, 0.0005556904252483349],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.4290279908688, 1221.813199410152, 1, 0, 0.298712211083998, 0.001921491589084738, 0, -0.008958686256713179, 1, 0.298712211083998, 0.0005555537009426287],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5583858330705, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987864589929095, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012135410070905, 1, 0.0005555931783958985],
[520.566948383977, 1221.554483725749, 1, 0, 0.298812091275156, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.298812091275156, 0.0005555413890461083],
[520.4461530926818, 1221.79607430834, 0, 0, 0.2987220404300807, 0, 0, 0, 1, 1, 7.168689443405325e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.566948383977, 1221.675279017044, 1, 0, 0.2987913736659508, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987913736659508, 0.000483653697091413],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.4461530926818, 1221.796074308339, 0, 0, 0.2987220404300807, 0, 0, 0, 1, 1, 9.22715910396081e-05],
[520.566948383977, 1221.675279017044, 1, 0, 0.2987913736659508, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987913736659509, 0.0004631061145864022],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 0, 0.2988607069018208, 0, 0, 0, 1, 1, 7.513886442125435e-05],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0004801874294611267],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005553823573599476],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005555101283595483],
[520.6877436752721, 1221.304834332391, 1, 0, 0.2989035373909507, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2989035373909507, 0.0005553715741676012],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005561815802483774],
[519.4794979764133, 1219.672349783585, 0, 2.75, 0.2986970336405618, 0, 0.002254703896901453, 0.01051224211902491, 0.3769125589616738, 1, 0.00116226444371911],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005554339257592761],
[520.3432845894894, 1221.898942811532, 0, 1, 0.298662996686579, 0, 0.000818398285621761, 0.003815667742480014, 0.701337003313421, 1, 0.0005553616310231328],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005555580348350664],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005555426807310631],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.566948383977, 1221.554483725749, 1, 0, 0.298812091275156, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.298812091275156, 0.0005555716773135223],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555958253570197],
[520.6877436752721, 1221.234574741431, 0, 1, 0.2989155935200051, 0, 0.0008188435053206118, 0.003817743517164624, 0.7010844064799948, 1, 0.0005553286382717198],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.39452923359, 0, 1, 0.2988881476911235, 0, 0.0008187362691295889, 0.003817243543396226, 0.7011118523088765, 1, 0.0005558699596907895],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 0, 0.2988607069018208, 0, 0, 0, 1, 1, 6.880028969730968e-05],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0004864166538102966],
[521.0076526595907, 1221.234574741431, 0, 0, 0.2990443260216465, 0, 0, 0, 1, 1, 6.880028985709853e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.8476981674314, 1221.39452923359, 0, 1, 0.2989525164617337, 0, 0.0008187362691295889, 0.003817243543396226, 0.7010474835382663, 1, 0.0004864166538102966],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.9293342578625, 1221.312893143159, 0, 0, 0.298999373373561, 0, 0, 0, 1, 1, 9.063920028494824e-05],
[520.8085389665673, 1221.433688434454, 1, 0, 0.2989300401376909, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989300401376909, 0.0004646026888901155],
[521.1877436752721, 1221.093642926613, 0, 2, 0.2991409698130262, 0, 0.001637876023338038, 0.007636368279638319, 0.4912033801946253, 1, 0.001112326586383998],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005554449719175326],
[520.6877436752721, 1221.515324524885, 0, 1, 0.2988674243428962, 0, 0.0008186553045406576, 0.003816866057304557, 0.7011325756571039, 1, 0.0005555600130471463],
[520.8085389665673, 1221.433688434454, 1, 0, 0.2989300401376909, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989300401376909, 0.0005553803944194651],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 0, 0.2988607069018208, 0, 0, 0, 1, 1, 8.988987796276273e-05],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.000465468040631299],
[520.4290279908688, 1221.813199410152, 0, 0, 0.298712211083998, 0, 0, 0, 1, 1, 8.989008483644968e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5583858330705, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987864589929095, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012135410070905, 1, 0.000465468040631299],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 0, 0.2988607069018208, 0, 0, 0, 1, 1, 8.98901933504513e-05],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.000465468040631299],
[519.9988255037066, 1222.243401897315, 0, 0, 0.2984652864713373, 0, 0, 0, 1, 1, 8.988987843753462e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3432845894894, 1221.898942811532, 0, 1, 0.298662996686579, 0, 0.0008183982856217611, 0.003815667742480015, 0.701337003313421, 1, 0.000465468040631299],
[520.6877436752721, 1221.234574741431, 0, 0, 0.2989155935200051, 0, 0, 0, 1, 1, 8.988987841903745e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.39452923359, 0, 1, 0.2988881476911235, 0, 0.0008187362691295889, 0.003817243543396226, 0.7011118523088765, 1, 0.000465468040631299],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.476165324021, 1, 0, 0.2988741420859519, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.298874142085952, 0.0005553778299784083],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.515324524885, 0, 1, 0.2988674243428962, 0, 0.0008186553045406576, 0.003816866057304557, 0.7011325756571039, 1, 0.0005553227117129781],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553495090351627],
[520.6877436752721, 1221.515324524885, 0, 2, 0.2988674243428962, 0, 0.001637310609081315, 0.007633732114609114, 0.4915868886475644, 1, 0.001111369272256624],
[521.0583858330705, 1221.183841567951, 0, 1, 0.2990734454934869, 0, 0.0008188775235643801, 0.003817902122476589, 0.7009265545065131, 1, 0.0005555821168119897],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005554773794828593],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.609425273544, 1220.632802127477, 0, 0, 0.2993897272548901, 0, 0, 0, 1, 1, 4.92243409029617e-05],
[521.1485844744082, 1221.093642926613, 1, 0, 0.2991252170783555, 0.001918838561191768, 0, -0.008946316884576221, 1, 0.2991252170783555, 0.0005073559248251234],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005554969158988804],
[520.566948383977, 1221.675279017044, 1, 0, 0.2987913736659508, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987913736659509, 0.0005554818216449202],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3678346909537, 1221.874392710068, 0, 0, 0.2986770877819952, 0, 0, 0, 1, 1, 7.114040146296572e-05],
[520.527789183113, 1221.714438217908, 0, 1, 0.298768897341908, 0, 0.0008185218809877381, 0.003816243988617578, 0.701231102658092, 1, 0.0004841197270123638],
[520.7850744110374, 1221.457152989984, 1, 0, 0.2989165721163327, 0.001920177918176539, 0, -0.008952561449517574, 1, 0.2989165721163327, 0.0005555735392801096],
[520.1587799958659, 1222.114044055113, 1, 2, 0.2985518529678025, 0.001922489898195985, 0.00163650848276301, -0.00133334842091874, 0.7858221426308721, 0.6548668168530808, 0.001670302326556436],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005553337070791057],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5583858330705, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987864589929095, 0, 0.000818542380585607, 0.003816339565130502, 0.7012135410070905, 1, 0.0005556668055021546],
[520.5277891831129, 1221.714438217908, 0, 1, 0.298768897341908, 0, 0.0008185218809877381, 0.003816243988617578, 0.701231102658092, 1, 0.000555438548415156],
[520.5583858330705, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987864589929095, 0, 0.000818542380585607, 0.003816339565130502, 0.7012135410070905, 1, 0.0005554823495139221],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005554974961673539],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 0, 0.2988607069018208, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001976173061345863],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0003577183663895261],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.7806608330955, 1221.711215961284, 0, 1, 0.2988712129844548, 0, 0.000818524039834705, 0.003816254053940145, 0.7011287870155452, 1, 0.0005553987893894601],
[520.8476981674314, 1221.39452923359, 0, 1, 0.2989525164617337, 0, 0.0008187362691295889, 0.003817243543396226, 0.7010474835382663, 1, 0.0005553888300481201],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555825318505058],
[520.8722482688958, 1221.249183840831, 0, 2, 0.2989873373167302, 0, 0.001637667419936361, 0.007635395695403068, 0.4914187532422878, 1, 0.00111163696139198],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.7806608330955, 1221.711215961284, 0, 1, 0.2988712129844548, 0, 0.000818524039834705, 0.003816254053940145, 0.7011287870155452, 1, 0.0005555043896992625],
[520.7850744110374, 1221.457152989984, 1, 0, 0.2989165721163326, 0.001920177918176539, 0, -0.008952561449517574, 1, 0.2989165721163326, 0.0005555763259371127],
[520.8722482688956, 1221.249183840831, 0, 1, 0.2989873373167301, 0, 0.0008188337099681805, 0.003817697847701534, 0.7010126626832699, 1, 0.0005554818282713948],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005558130175282996],
[520.5583858330705, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987864589929095, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012135410070905, 1, 0.000555512004069637],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005554405450688382],
[520.7609794973349, 1221.563552995841, 0, 1, 0.2988886225186493, 0, 0.0008186229832639781, 0.003816715363864714, 0.7011113774813507, 1, 0.000555408905717288],
[520.7806608330955, 1221.922407367062, 0, 1, 0.2988349939447524, 0, 0.0008183825699331848, 0.003815594470276242, 0.7011650060552476, 1, 0.0005555328590887829],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005554038222406805],
[520.5277891831129, 1221.714438217909, 1, 1, 0.298768897341908, 0.001921127019115241, 0.000818521880987738, -0.005140742511513839, 0.9107371459811004, 0.5082749406649165, 0.001111986053005099],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005554010175336244],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005553938552988405],
[520.6877436752721, 1221.39452923359, 0, 1, 0.2988881476911235, 0, 0.0008187362691295889, 0.003817243543396226, 0.7011118523088765, 1, 0.0005555125853783535],
[520.4406153252546, 1221.832208725724, 0, 1, 0.2987136159968173, 0, 0.00081844298493565, 0.003815876146790133, 0.7012863840031827, 1, 0.0005555605442989735],
[520.8085389665673, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2989093157875957, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989093157875957, 0.0005554455614900335],
[520.724640127813, 1221.517587273208, 0, 1, 0.2988818844694177, 0, 0.0008186537880574429, 0.003816858986913299, 0.7011181155305823, 1, 0.0005555606037167973],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005554239474857964],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005554455021110418],
[520.5032390816486, 1221.898942811532, 0, 1, 0.2987273802171802, 0, 0.000818398285621761, 0.003815667742480014, 0.7012726197828199, 1, 0.0005555922398411577],
[520.590412939507, 1221.651814461515, 1, 0, 0.2988048416873091, 0.001920895919603116, 0, -0.008955909030922096, 1, 0.2988048416873091, 0.0005554236808635993],
[520.8801810420302, 1221.362046358991, 0, 1, 0.2989711607547533, 0, 0.0008187580439240809, 0.003817345065335363, 0.7010288392452466, 1, 0.0005553938552988405],
[520.7806608330955, 1221.54387166008, 0, 1, 0.2988999185403682, 0, 0.0008186361727974601, 0.00381677685822306, 0.7011000814596318, 1, 0.0005555423867673082],
[520.7850744110374, 1221.457152989984, 1, 0, 0.2989165721163326, 0.001920177918176539, 0, -0.008952561449517574, 1, 0.2989165721163326, 0.000555602925249909],
[520.3432845894894, 1221.898942811532, 0, 1, 0.298662996686579, 0, 0.000818398285621761, 0.003815667742480014, 0.701337003313421, 1, 0.0005554767988107655],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555578601436415],
[520.7806608330955, 1221.54387166008, 0, 1, 0.2988999185403682, 0, 0.0008186361727974601, 0.00381677685822306, 0.7011000814596318, 1, 0.000555560429642426],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555125847949337],
[520.527789183113, 1221.714438217908, 0, 1, 0.298768897341908, 0, 0.0008185218809877381, 0.003816243988617578, 0.701231102658092, 1, 0.0005555584519504549],
[520.7850744110374, 1221.457152989984, 1, 0, 0.2989165721163327, 0.001920177918176539, 0, -0.008952561449517574, 1, 0.2989165721163327, 0.0005556074015750601],
[520.7806608330955, 1221.54387166008, 0, 1, 0.2988999185403682, 0, 0.0008186361727974601, 0.00381677685822306, 0.7011000814596318, 1, 0.0005555423822552709],
[520.3678346909537, 1221.874392710068, 1, 0, 0.2986770877819951, 0.001921717549267625, 0, -0.008959739764517477, 1, 0.2986770877819951, 0.0005553547729168507],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5277891831129, 1221.714438217909, 0, 1, 0.298768897341908, 0, 0.000818521880987738, 0.003816243988617578, 0.701231102658092, 1, 0.000555356278820856],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.000555612418155189],
[520.566948383977, 1221.681578819627, 1, 0, 0.2987902932651709, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987902932651709, 0.0005554824090374393],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005556073814211879],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555429719423418],
[520.5583858330705, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987864589929095, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012135410070905, 1, 0.0005555584525399335],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555605443029205],
[520.5583858330705, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987864589929095, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012135410070905, 1, 0.0005555120042002485],
[520.566948383977, 1221.554483725749, 1, 0, 0.298812091275156, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.298812091275156, 0.0005554824084203837],
[520.527789183113, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2987963297014415, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7012036702985585, 1, 0.0005557023393523637],
[521.1485844744082, 1221.093642926613, 0, 1, 0.2991252170783555, 0, 0.0008189380116690192, 0.003818184139819159, 0.7008747829216445, 1, 0.000555512002103742],
[520.8722482688958, 1221.24918384083, 0, 1, 0.2989873373167302, 0, 0.0008188337099681807, 0.003817697847701535, 0.7010126626832698, 1, 0.000555482409024409],
[520.8085389665673, 1221.433688434454, 1, 0, 0.2989300401376909, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989300401376909, 0.0005553809832957514],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555600142832264],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555584519193303],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553809837085156],
[521.1485844744082, 1221.093642926613, 1, 0, 0.2991252170783555, 0.001918838561191768, 0, -0.008946316884576221, 1, 0.2991252170783555, 0.0005557017592197653],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005554455618608843],
[520.527789183113, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987741443091586, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012258556908414, 1, 0.0005555600131294131],
[520.566948383977, 1221.554483725749, 1, 0, 0.298812091275156, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.298812091275156, 0.0005555120040720135],
[521.0322027610549, 1221.210024639966, 0, 1, 0.2990584171170626, 0, 0.0008188599666096068, 0.003817820265626249, 0.7009415828829374, 1, 0.0005553938478296473],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555605442924323],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553809833046577],
[520.6877436752721, 1221.714438217909, 0, 1, 0.2988332711507092, 0, 0.000818521880987738, 0.003816243988617578, 0.7011667288492909, 1, 0.0005554455616206922],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553809839902141],
[520.6485844744082, 1221.593642926613, 0, 1, 0.2988382305777781, 0, 0.0008186028191864736, 0.003816621351668645, 0.7011617694222219, 1, 0.0005559559805468406],
[520.5277891831129, 1221.714438217909, 0, 1, 0.298768897341908, 0, 0.000818521880987738, 0.003816243988617578, 0.701231102658092, 1, 0.0005554818277543831],
[520.8085389665673, 1221.433688434454, 1, 0, 0.2989300401376909, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989300401376909, 0.00055538098359921],
[520.7269028761363, 1221.515324524885, 0, 1, 0.2988831832258637, 0, 0.0008186553045406576, 0.003816866057304557, 0.7011168167741364, 1, 0.0005558130197347719],
[521.5611664404612, 1220.521106468401, 0, 1, 0.2993895148072303, 0, 0.0008193221687853619, 0.003819975218738343, 0.7006104851927697, 1, 0.0005553591321696304],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.0322027610549, 1221.210024639967, 0, 1, 0.2990584171170626, 0, 0.0008188599666096067, 0.003817820265626248, 0.7009415828829374, 1, 0.0005554496488302587],
[520.6485844744082, 1221.593642926613, 0, 1, 0.2988382305777781, 0, 0.0008186028191864736, 0.003816621351668645, 0.7011617694222219, 1, 0.000555482409024409],
[520.7609794973349, 1221.481247903687, 0, 1, 0.2989027422864022, 0, 0.000818678143210308, 0.003816972539413082, 0.7010972577135978, 1, 0.0005553938477252434],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005555600143062849],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005555120044127329],
[520.566948383977, 1221.554483725749, 1, 0, 0.298812091275156, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.298812091275156, 0.0005554818220969436],
[520.8041253886253, 1221.687751405754, 0, 1, 0.2988846790762297, 0, 0.0008185397609571958, 0.003816327351478785, 0.7011153209237704, 1, 0.0005555417806895642],
[520.5904129395069, 1221.651814461514, 1, 0, 0.2988048416873091, 0.001920895919603116, 0, -0.0089559090309221, 1, 0.298804841687309, 0.0005554018623769111],
[520.566948383977, 1221.681578819628, 1, 0, 0.2987902932651708, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987902932651708, 0.0005554824092070082],
[520.8085389665673, 1221.433688434454, 1, 0, 0.2989300401376909, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989300401376909, 0.0005554455020835067],
[520.8085389665673, 1221.433688434454, 1, 0, 0.2989300401376909, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989300401376909, 0.0005553804003309176],
[520.6877436752721, 1221.515324524885, 0, 1, 0.2988674243428962, 0, 0.0008186553045406576, 0.003816866057304557, 0.7011325756571039, 1, 0.0005555603204333563],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555584504457147],
[520.5583858330705, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987864589929095, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012135410070905, 1, 0.000555512585096459],
[520.6854809269489, 1221.556746474072, 0, 1, 0.2988594081453749, 0, 0.0008186275446363186, 0.003816736630626396, 0.7011405918546252, 1, 0.0005557023416032559],
[520.7806608330955, 1221.711215961284, 0, 1, 0.2988712129844548, 0, 0.000818524039834705, 0.003816254053940145, 0.7011287870155452, 1, 0.0005555600137107324],
[520.8085389665673, 1221.433688434454, 1, 0, 0.2989300401376909, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989300401376909, 0.0005553803997075853],
[520.3432845894894, 1221.898942811532, 0, 1, 0.298662996686579, 0, 0.000818398285621761, 0.003815667742480014, 0.701337003313421, 1, 0.0005555578591718699],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555120044591143],
[520.8432845894895, 1221.64859220489, 0, 1, 0.2989071521800563, 0, 0.0008185659987502231, 0.003816449681525472, 0.7010928478199437, 1, 0.0005555584795756006],
[520.8085389665673, 1221.433688434454, 1, 0, 0.2989300401376909, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989300401376909, 0.000555445561487999],
[521.0583858330705, 1221.183841567951, 0, 1, 0.2990734454934869, 0, 0.0008188775235643801, 0.003817902122476589, 0.7009265545065131, 1, 0.0005555600139698419],
[520.566948383977, 1221.675279017044, 1, 0, 0.2987913736659508, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987913736659509, 0.0005555120035200966],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005554821298826583],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.000555560014330427],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.000555512002103742],
[520.3140767339945, 1221.897554017069, 1, 0, 0.2986514769791132, 0.001921916097824968, 0, -0.008960665469444871, 1, 0.2986514769791131, 0.000555481828222685],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005554233687629549],
[520.7749175331305, 1221.436713217933, 0, 1, 0.2989159918009648, 0, 0.0008187079929548312, 0.003817111709679319, 0.7010840081990353, 1, 0.0005555600145866567],
[520.590412939507, 1221.781172303716, 1, 0, 0.2987826576997559, 0.001920895919603116, 0, -0.008955909030922096, 1, 0.2987826576997559, 0.0005553932732851875],
[520.8085389665673, 1221.433688434454, 1, 0, 0.2989300401376909, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989300401376909, 0.000555380701211673],
[520.6833300973301, 1222.019738102827, 0, 1, 0.2987791435032507, 0, 0.0008183173878619094, 0.003815290567969598, 0.7012208564967493, 1, 0.0005558125963788368],
[520.1877436752721, 1222.054483725749, 0, 1, 0.2985737204012434, 0, 0.0008182941213482081, 0.003815182091097921, 0.7014262795987566, 1, 0.0005555578608957031],
[521.1877436752721, 1221.054483725749, 0, 1, 0.2991476934023982, 0, 0.0008189642750000348, 0.003818306588933151, 0.7008523065976018, 1, 0.0005554233732413333],
[520.6508472227313, 1221.59138017829, 1, 0, 0.298839529334224, 0.001920672952582762, 0, -0.008954869478320209, 1, 0.298839529334224, 0.0005555600142969416],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553938552988405],
[520.8722482688958, 1221.249183840831, 0, 1, 0.2989873373167302, 0, 0.0008188337099681805, 0.003817697847701534, 0.7010126626832698, 1, 0.0005555123158848893],
[520.4406153252546, 1221.832208725725, 0, 1, 0.2987136159968173, 0, 0.0008184429849356499, 0.003815876146790132, 0.7012863840031827, 1, 0.0005555606037316807],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.000555455596771393],
[520.8620913909888, 1221.318942710118, 0, 1, 0.2989712786419651, 0, 0.0008187869401100019, 0.003817479789767753, 0.7010287213580348, 1, 0.0005553422245747113],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.7749175331305, 1221.436713217933, 0, 1, 0.2989159918009648, 0, 0.0008187079929548312, 0.003817111709679319, 0.7010840081990353, 1, 0.000555454263708982],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.000555517615808791],
[520.8085389665673, 1221.427388631871, 1, 0, 0.2989311210476924, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989311210476924, 0.0005554455616254506],
[520.590412939507, 1221.781172303716, 1, 0, 0.298782657699756, 0.001920895919603116, 0, -0.008955909030922096, 1, 0.298782657699756, 0.0005553938478508438],
[520.7183403252297, 1221.523887075792, 0, 1, 0.2988782685528223, 0, 0.0008186495659891693, 0.003816839302109456, 0.7011217314471777, 1, 0.0005559558013283409],
[521.0322027610549, 1221.210024639967, 0, 1, 0.2990584171170626, 0, 0.0008188599666096067, 0.003817820265626248, 0.7009415828829374, 1, 0.0005553809835792142],
[520.8476981674314, 1221.39452923359, 0, 1, 0.2989525164617337, 0, 0.0008187362691295889, 0.003817243543396226, 0.7010474835382663, 1, 0.0005553932668071],
[520.6485844744082, 1221.593642926613, 0, 1, 0.2988382305777781, 0, 0.0008186028191864736, 0.003816621351668645, 0.7011617694222219, 1, 0.0005559558018170399],
[520.566948383977, 1221.681578819627, 1, 0, 0.2987902932651709, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987902932651709, 0.0005555125849098635],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005555600140646779],
[520.5606485813937, 1221.681578819628, 1, 0, 0.2987877577493554, 0.00192100575163557, 0, -0.008956421107438739, 1, 0.2987877577493554, 0.000555512002103742]
],
"NAMES": [
["epi_isl_420328_Alken_20200306_null_1"],
["epi_isl_430037_Utah_20200314_null_69"],
["Node1"],
["epi_isl_421955_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_423675_England_20200320_null_3"],
["Node973"],
["epi_isl_418697_England_20200316_null_1"],
["epi_isl_423312_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_4"],
["Node192"],
["epi_isl_434517_Louisiana_20200323_null_1"],
["epi_isl_429780_Luxembourg_20200326_null_2"],
["epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1"],
["epi_isl_430379_New_York_20200407_null_2"],
["epi_isl_427172_Idaho_20200329_null_1"],
["epi_isl_433771_England_20200405_null_1"],
["epi_isl_425435_England_20200401_null_4"],
["epi_isl_427690_New_South_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_426952_Victoria_20200328_null_1"],
["epi_isl_430479_Victoria_20200331_null_1"],
["Node215"],
["epi_isl_428380_Connecticut_20200331_null_32"],
["epi_isl_422372_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_430601_Victoria_20200408_null_1"],
["epi_isl_432013_Wales_20200331_null_1"],
["epi_isl_430976_Washington_20200403_null_7"],
["Node229"],
["epi_isl_423958_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_1"],
["Node232"],
["epi_isl_413523_Kerala_20200131_null_1"],
["epi_isl_417261_England_20200306_null_1"],
["Node731"],
["epi_isl_423404_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_2"],
["Node728"],
["epi_isl_422932_Zuid_Holland_20200323_null_8"],
["epi_isl_423409_England_20200330_null_1"],
["Node712"],
["epi_isl_420700_England_20200327_null_3"],
["epi_isl_425693_Scotland_20200316_null_5"],
["Node709"],
["epi_isl_417530_Luxembourg_20200318_null_1"],
["epi_isl_421575_KZN_20200401_null_4"],
["Node706"],
["epi_isl_431970_Wales_20200301_null_1"],
["epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1"],
["epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1"],
["epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1"],
["epi_isl_430671_Victoria_20200404_null_1"],
["epi_isl_430665_Victoria_20200402_null_1"],
["epi_isl_430613_Victoria_20200410_null_1"],
["epi_isl_430592_Victoria_20200408_null_1"],
["epi_isl_430577_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1"],
["epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1"],
["epi_isl_429233_Abruzzo_20200324_null_3"],
["epi_isl_429177_Bangkok_20200328_null_1"],
["epi_isl_428836_Singapore_20200408_null_1"],
["epi_isl_427417_Doha_20200323_null_5"],
["epi_isl_426780_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_2"],
["epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_2"],
["epi_isl_424154_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_424142_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_424131_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_424026_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_423967_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_423814_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423593_England_20200402_null_1"],
["epi_isl_423549_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_423531_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_423282_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_423247_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_1"],
["epi_isl_422304_Wales_20200324_null_1"],
["epi_isl_422265_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_422119_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_422043_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_421892_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_421860_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_421827_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_420980_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_420917_Wales_20200315_null_1"],
["epi_isl_420634_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_420528_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1"],
["epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1"],
["epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1"],
["epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1"],
["epi_isl_430477_Victoria_20200331_null_1"],
["epi_isl_423569_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_430403_New_York_20200410_null_7"],
["Node565"],
["epi_isl_423907_England_20200318_null_3"],
["epi_isl_423736_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423656_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_10"],
["Node333"],
["epi_isl_420789_Illinois_20200301_null_1"],
["epi_isl_423155_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_422148_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1"],
["epi_isl_430366_New_York_20200408_null_117"],
["epi_isl_431950_Wales_20200326_null_1"],
["epi_isl_421866_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_432999_England_20200402_null_1"],
["epi_isl_433922_England_20200411_null_1"],
["epi_isl_433391_Scotland_20200407_null_1"],
["epi_isl_433908_England_20200411_null_2"],
["Node315"],
["epi_isl_433904_England_20200410_null_1"],
["Node299"],
["epi_isl_432016_Wales_20200401_null_1"],
["epi_isl_431782_Fujian_20200322_null_7"],
["Node320"],
["epi_isl_419820_Victoria_20200317_null_1"],
["epi_isl_425953_Scotland_20200326_null_2"],
["Node329"],
["epi_isl_433673_England_20200403_null_2"],
["epi_isl_425231_England_20200330_null_3"],
["Node325"],
["epi_isl_416671_Washington_20200312_null_3"],
["epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1"],
["epi_isl_418368_Ontario_20200312_null_1"],
["epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1"],
["epi_isl_420540_Estonia_20200301_null_1"],
["epi_isl_428271_Wisconsin_20200320_null_1"],
["Node112"],
["epi_isl_420300_New_York_20200318_null_2"],
["epi_isl_428695_Madrid_20200312_null_1"],
["epi_isl_423147_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_429785_Luxembourg_20200409_null_13"],
["epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1"],
["epi_isl_433303_Scotland_20200323_null_1"],
["epi_isl_422178_Wales_20200330_null_2"],
["epi_isl_419473_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_2"],
["epi_isl_428848_Singapore_20200415_null_10"],
["Node130"],
["epi_isl_426697_Victoria_20200324_null_1"],
["epi_isl_428461_Guangdong_20200124_null_4"],
["epi_isl_423304_England_20200325_null_2"],
["epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1"],
["epi_isl_434241_Washington_20200402_null_2"],
["epi_isl_434946_Texas_20200329_null_1"],
["epi_isl_435017_Texas_20200402_null_1"],
["epi_isl_417231_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_2"],
["epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1"],
["epi_isl_417238_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1"],
["Node155"],
["epi_isl_420623_ARA_20200324_null_2"],
["epi_isl_428706_Madrid_20200321_null_2"],
["epi_isl_422908_Zuid_Holland_20200317_null_4"],
["epi_isl_429621_Washington_20200328_null_4"],
["epi_isl_420932_Wales_20200321_null_3"],
["epi_isl_424597_Reykjavik_20200327_null_4"],
["epi_isl_428301_Wisconsin_20200325_null_2"],
["epi_isl_430483_Victoria_20200331_null_4"],
["epi_isl_431974_Wales_20200404_null_1"],
["epi_isl_425190_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2"],
["epi_isl_429708_Luxembourg_20200330_null_28"],
["Node173"],
["epi_isl_419704_New_York_20200318_null_2"],
["epi_isl_429103_Guangzhou_20200209_null_1"],
["epi_isl_413749_China_20200201_null_1"],
["epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_1"],
["epi_isl_422114_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1"],
["Node541"],
["epi_isl_415149_England_20200301_null_1"],
["Node540"],
["epi_isl_423779_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_429001_California_20200325_null_1"],
["epi_isl_425163_Wisconsin_20200330_null_1"],
["epi_isl_429799_Luxembourg_20200330_null_49"],
["Node527"],
["epi_isl_423954_England_20200320_null_2"],
["Node526"],
["epi_isl_435052_Gujarat_20200413_null_1"],
["epi_isl_419496_Wales_20200320_null_2"],
["Node517"],
["epi_isl_424846_Massachusetts_20200306_null_2"],
["Node516"],
["epi_isl_419848_Victoria_20200317_null_1"],
["epi_isl_418830_British_Columbia_20200309_null_1"],
["epi_isl_422968_USA_20200301_null_2"],
["epi_isl_430280_Washington_20200301_null_1"],
["Node507"],
["epi_isl_426869_Victoria_20200326_null_1"],
["Node506"],
["epi_isl_430129_Washington_20200306_null_4"],
["epi_isl_434119_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_426667_Victoria_20200322_null_2"],
["epi_isl_430153_Washington_20200331_null_4"],
["epi_isl_418333_Ontario_20200310_null_1"],
["epi_isl_417107_Washington_20200305_null_2"],
["epi_isl_424863_Georgia_20200301_null_1"],
["Node498"],
["epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_1"],
["epi_isl_426120_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_430152_Washington_20200305_null_1"],
["epi_isl_418883_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_424851_Illinois_20200307_null_1"],
["epi_isl_430200_Washington_20200304_null_2"],
["epi_isl_415592_Washington_20200309_null_1"],
["epi_isl_430137_Washington_20200321_null_1"],
["epi_isl_416682_USA_20200309_null_1"],
["epi_isl_417368_USA_20200313_null_2"],
["epi_isl_418890_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_421317_Wisconsin_20200324_null_1"],
["epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2"],
["epi_isl_417150_Washington_20200228_null_1"],
["Node483"],
["epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1"],
["epi_isl_429650_Washington_20200402_null_6"],
["Node480"],
["epi_isl_426082_Washington_20200325_null_2"],
["epi_isl_413931_California_20200305_null_2"],
["epi_isl_426426_Minnesota_20200305_null_5"],
["Node476"],
["epi_isl_434085_Washington_20200403_null_1"],
["epi_isl_430966_Washington_20200402_null_1062"],
["epi_isl_434084_Washington_20200401_null_1"],
["epi_isl_434226_Washington_20200401_null_9"],
["Node471"],
["epi_isl_429061_California_20200408_null_1"],
["epi_isl_424852_District_of_Columbia_20200306_null_1"],
["epi_isl_416679_Washington_20200311_null_1"],
["epi_isl_426444_Washington_20200319_null_1"],
["epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1"],
["epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_429041_California_20200328_null_1"],
["epi_isl_417577_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_9"],
["Node461"],
["epi_isl_427204_Washington_20200327_null_1"],
["epi_isl_434170_Washington_20200329_null_1"],
["epi_isl_417117_Washington_20200303_null_1"],
["epi_isl_417324_California_20200304_null_1"],
["epi_isl_430290_Washington_20200302_null_1"],
["epi_isl_423017_Washington_20200319_null_1"],
["epi_isl_416689_Washington_20200314_null_2"],
["epi_isl_424848_Arizona_20200309_null_1"],
["epi_isl_424199_Washington_20200320_null_1"],
["epi_isl_416670_Washington_20200312_null_1"],
["epi_isl_424213_Washington_20200320_null_1"],
["epi_isl_418939_Washington_20200317_null_1"],
["epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1"],
["epi_isl_418342_Ontario_20200311_null_1"],
["Node400"],
["epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_4"],
["Node399"],
["epi_isl_426877_Victoria_20200328_null_18"],
["Node397"],
["epi_isl_425821_Scotland_20200311_null_2"],
["epi_isl_427725_New_South_Wales_20200319_null_18"],
["Node391"],
["epi_isl_433853_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_420078_Thies_20200320_null_1"],
["Node388"],
["epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_2"],
["epi_isl_430045_Utah_20200331_null_11"],
["Node385"],
["epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1"],
["epi_isl_430810_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200407_null_5"],
["Node382"],
["epi_isl_423061_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_433625_Scotland_20200405_null_8"],
["epi_isl_423091_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_422606_Netherlands_20200401_null_2"],
["epi_isl_431014_Alaska_20200317_null_486"],
["epi_isl_422003_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_423062_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1"],
["epi_isl_423743_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_425255_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1"],
["epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_7"],
["epi_isl_424548_Reykjavik_20200301_null_2"],
["Node363"],
["epi_isl_421939_England_20200401_null_2"],
["Node350"],
["epi_isl_419253_Hong_Kong_20200226_null_1"],
["epi_isl_423121_England_20200324_null_1"],
["Node379"],
["epi_isl_434007_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_433687_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2"],
["epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2"],
["epi_isl_430662_Victoria_20200327_null_7"],
["epi_isl_429696_Minas_gerais_20200317_null_21"],
["epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1"],
["epi_isl_429655_Washington_20200402_null_2"],
["Node55"],
["epi_isl_423339_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_426788_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_429257_Montevideo_20200319_null_12"],
["Node48"],
["epi_isl_423089_England_20200323_null_3"],
["epi_isl_430432_New_York_20200413_null_25"],
["Node51"],
["epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1"],
["epi_isl_425332_England_20200329_null_4"],
["Node522"],
["epi_isl_423709_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_432456_England_20200405_null_1"],
["epi_isl_425289_England_20200321_null_2"],
["Node536"],
["epi_isl_426322_New_York_20200312_null_11"],
["epi_isl_433981_England_20200413_null_1"],
["epi_isl_428891_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200325_null_4"],
["Node546"],
["epi_isl_429568_Unknown_20200323_null_7"],
["epi_isl_423870_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_423888_England_20200318_null_2"],
["Node553"],
["epi_isl_422196_Wales_20200327_null_8"],
["Node552"],
["epi_isl_431951_Wales_20200405_null_1"],
["Node551"],
["epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1"],
["epi_isl_430385_New_York_20200408_null_1"],
["Node559"],
["epi_isl_422134_Wales_20200325_null_5"],
["epi_isl_419416_Wales_20200317_null_1"],
["epi_isl_418732_England_20200313_null_1"],
["epi_isl_417242_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_421915_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_418090_Wales_20200312_null_1"],
["epi_isl_432115_Wales_20200407_null_1"],
["epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_423426_England_20200330_null_1"],
["Node589"],
["epi_isl_423453_England_20200329_null_7"],
["epi_isl_424842_South_Carolina_20200307_null_3"],
["Node585"],
["epi_isl_421906_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1"],
["epi_isl_433336_Scotland_20200326_null_1"],
["epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1"],
["epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1"],
["epi_isl_427246_Washington_20200331_null_3"],
["Node607"],
["epi_isl_426108_Washington_20200325_null_17"],
["epi_isl_415517_Noord_Brabant_20200101_null_2"],
["epi_isl_423385_England_20200328_null_1"],
["Node599"],
["epi_isl_433804_England_20200406_null_1"],
["epi_isl_422675_Netherlands_20200310_null_4"],
["Node604"],
["epi_isl_430050_Utah_20200331_null_1"],
["epi_isl_418099_Wales_20200313_null_1"],
["epi_isl_416396_Shanghai_20200210_null_1"],
["epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2"],
["Node616"],
["epi_isl_421880_England_20200326_null_2"],
["Node615"],
["epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1"],
["epi_isl_424343_Rome_20200323_null_7"],
["epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_3"],
["epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_18"],
["Node65"],
["epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_6"],
["Node64"],
["epi_isl_429702_Minas_gerais_20200322_null_4"],
["epi_isl_426507_Arizona_20200318_null_3"],
["epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1"],
["Node694"],
["epi_isl_423362_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_426801_Victoria_20200325_null_10"],
["Node691"],
["epi_isl_418503_Hangzhou_20200122_null_1"],
["epi_isl_422349_Wales_20200324_null_3"],
["Node688"],
["epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1"],
["epi_isl_432548_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_429622_Washington_20200327_null_2"],
["epi_isl_433275_Scotland_20200319_null_1"],
["epi_isl_413695_China_20200101_null_1"],
["epi_isl_424868_Louisiana_20200309_null_1"],
["Node677"],
["epi_isl_418217_Mbour_20200313_null_1"],
["epi_isl_428771_New_York_20200405_null_1"],
["epi_isl_430850_Halland_20200311_null_4"],
["epi_isl_421931_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_434271_Washington_20200324_null_1"],
["epi_isl_429643_USA_20200408_null_1"],
["Node699"],
["epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_1"],
["epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1"],
["Node702"],
["epi_isl_422149_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_424435_Reykjavik_20200319_null_2"],
["Node725"],
["epi_isl_416315_Hong_Kong_20200219_null_4"],
["epi_isl_423145_England_20200324_null_1"],
["Node722"],
["epi_isl_423687_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_424088_England_20200313_null_6"],
["Node718"],
["epi_isl_429636_Washington_20200407_null_1"],
["epi_isl_429774_Luxembourg_20200323_null_1"],
["epi_isl_422578_Netherlands_20200330_null_1"],
["epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_423112_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_430423_New_York_20200411_null_3"],
["Node735"],
["epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_8"],
["epi_isl_430619_Victoria_20200408_null_2"],
["Node738"],
["epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_427061_Victoria_20200330_null_1"],
["Node742"],
["epi_isl_406036_California_20200122_null_1"],
["epi_isl_424146_England_20200321_null_1"],
["Node745"],
["epi_isl_423346_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_430815_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200418_null_1"],
["Node756"],
["epi_isl_423875_England_20200318_null_2"],
["epi_isl_418731_England_20200313_null_2"],
["epi_isl_429255_Kinshasa_20200405_null_11"],
["Node751"],
["epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_7"],
["epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1"],
["epi_isl_428879_Sverdlovsk_Region_20200319_null_3"],
["epi_isl_418440_Lucerne_20200320_null_2"],
["epi_isl_431916_Wales_20200331_null_1"],
["epi_isl_432416_Wales_20200331_null_1"],
["Node764"],
["epi_isl_434322_Washington_20200324_null_2"],
["epi_isl_420006_Victoria_20200324_null_1"],
["epi_isl_423570_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_430921_Connecticut_20200406_null_1"],
["Node771"],
["epi_isl_434514_Luxembourg_20200416_null_3"],
["epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1"],
["epi_isl_425920_Scotland_20200323_null_8"],
["Node776"],
["epi_isl_431012_Kinshasa_20200407_null_11861"],
["epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1"],
["epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_1"],
["epi_isl_427683_New_South_Wales_20200323_null_6"],
["epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_426712_Victoria_20200326_null_1"],
["epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2"],
["Node783"],
["epi_isl_426827_Victoria_20200325_null_1"],
["epi_isl_427601_New_York_20200316_null_5"],
["Node786"],
["epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_5"],
["epi_isl_425505_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_423659_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_426716_Victoria_20200323_null_3"],
["epi_isl_427724_New_South_Wales_20200319_null_1"],
["epi_isl_428916_Chechen_Republic_20200326_null_33"],
["epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1"],
["epi_isl_426181_South_Korea_20200223_null_2"],
["epi_isl_428405_Connecticut_20200411_null_2"],
["epi_isl_421603_New_York_20200321_null_3"],
["epi_isl_433348_Scotland_20200327_null_1"],
["epi_isl_430475_Victoria_20200331_null_1"],
["epi_isl_433888_England_20200409_null_1"],
["epi_isl_435045_Nur_Sultan_20200301_null_1"],
["epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_1"],
["epi_isl_429328_Unknown_20200315_null_1"],
["epi_isl_422751_Netherlands_20200326_null_1"],
["epi_isl_427639_New_York_20200406_null_2"],
["epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1"],
["epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4"],
["epi_isl_426299_New_York_20200328_null_1"],
["epi_isl_432054_Wales_20200331_null_1"],
["epi_isl_433696_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_417948_Kinshasa_20200319_null_2"],
["epi_isl_419801_Victoria_20200315_null_1"],
["epi_isl_424661_Li_ge_20200405_null_2"],
["epi_isl_427209_Washington_20200327_null_1"],
["epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_416349_Shanghai_20200130_null_1"],
["epi_isl_434544_Puerto_Rico_20200323_null_1"],
["epi_isl_420761_England_20200325_null_4"],
["epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1"],
["epi_isl_433620_Scotland_20200404_null_1"],
["epi_isl_422987_Washington_20200318_null_16"],
["epi_isl_418974_New_York_20200317_null_1"],
["epi_isl_427476_New_York_20200401_null_2"],
["Node86"],
["epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1"],
["epi_isl_419887_Victoria_20200319_null_1"],
["epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_2"],
["epi_isl_425930_Scotland_20200325_null_5"],
["epi_isl_417826_Reykjavik_20200316_null_3"],
["epi_isl_434878_Texas_20200324_null_1"],
["epi_isl_425900_Scotland_20200322_null_2"],
["epi_isl_430805_Buenos_Aires_20200401_null_3"],
["epi_isl_423399_England_20200329_null_3"],
["epi_isl_427388_Liege_20200407_null_1"],
["epi_isl_427620_Alaska_20200404_null_5"],
["epi_isl_423598_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_429117_Halland_20200311_null_2"],
["epi_isl_430340_New_York_20200330_null_1"],
["epi_isl_424408_Reykjavik_20200319_null_1"],
["epi_isl_427641_New_York_20200406_null_1"],
["epi_isl_418116_Wales_20200313_null_1"],
["epi_isl_424375_Reykjavik_20200301_null_1"],
["epi_isl_430498_Victoria_20200401_null_15"],
["epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1"],
["epi_isl_423649_England_20200322_null_2"],
["epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_430610_Victoria_20200408_null_2"],
["epi_isl_423758_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_429674_Minas_gerais_20200311_null_1"],
["epi_isl_430793_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200301_null_1"],
["epi_isl_424148_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_2"],
["epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1"],
["epi_isl_417424_Kasterlee_20200304_null_1"],
["Node897"],
["epi_isl_418863_Komen_20200305_null_2"],
["epi_isl_417518_Taoyuan_20200204_null_1"],
["epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_3"],
["epi_isl_430552_Victoria_20200330_null_2"],
["epi_isl_418768_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_424144_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_430031_Utah_20200315_null_2"],
["epi_isl_433809_England_20200407_null_1"],
["epi_isl_435025_Texas_20200403_null_1"],
["epi_isl_422297_Wales_20200329_null_7"],
["epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1"],
["epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1"],
["epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1"],
["epi_isl_420756_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1"],
["epi_isl_425259_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_429370_Unknown_20200309_null_1"],
["epi_isl_421665_India_20200310_null_1"],
["epi_isl_430467_West_Bengal_20200403_null_1"],
["epi_isl_434711_Kinshasa_20200408_null_1"],
["epi_isl_422051_Wales_20200330_null_1"],
["epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_2"],
["epi_isl_428923_Sverdlovsk_Region_20200327_null_3"],
["epi_isl_421730_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_2"],
["epi_isl_418101_Wales_20200315_null_1"],
["epi_isl_421864_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_430911_Washington_20200408_null_15"],
["epi_isl_434657_Skane_20200401_null_1"],
["epi_isl_422080_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_430660_Victoria_20200327_null_2"],
["epi_isl_429011_California_20200408_null_1"],
["epi_isl_422091_Wales_20200328_null_8"],
["epi_isl_426814_Victoria_20200325_null_3"],
["epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1"],
["epi_isl_421618_New_York_20200320_null_2"],
["epi_isl_431092_Cincinnati_20200413_null_1"],
["epi_isl_429206_Switzerland_20200407_null_1"],
["epi_isl_420026_Virginia_20200327_null_3"],
["epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_5"],
["Node958"],
["epi_isl_425368_England_20200316_null_6"],
["epi_isl_427156_Victoria_20200330_null_1"],
["epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1"],
["epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1"],
["epi_isl_435038_Louisiana_20200413_null_1"],
["epi_isl_420060_Ile_de_France_20200320_null_1"],
["epi_isl_430741_Beijing_20200210_null_10"],
["epi_isl_434772_Texas_20200318_null_2"],
["epi_isl_425990_Scotland_20200330_null_2"]
],
"RESOLVED": [
[520.5815471400721, 1221.681792053189, 0, 1, 0.2987961322661605, 0, 0.0008185437537866347, 0.003816345967488568, 0.7012038677338395, 1, 0.0005660867966126747],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5277891831129, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987741443091586, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012258556908414, 1, 0.0005553808382664476],
[521.0567528625193, 1220.783929463753, 0, 1, 0.2991414531475031, 0, 0.000819145776631631, 0.003819152814949329, 0.7008585468524969, 1, 0.0005555411741090794],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.8722482688956, 1221.249183840831, 0, 1, 0.2989873373167301, 0, 0.0008188337099681805, 0.003817697847701534, 0.7010126626832699, 1, 0.0005554962194175968],
[520.648584474408, 1221.593642926613, 0, 1, 0.298838230577778, 0, 0.0008186028191864736, 0.003816621351668645, 0.701161769422222, 1, 0.0005555534214773481],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.0567528625193, 1220.865565554184, 0, 0, 0.2991274337285757, 0, 0, 0, 1, 1, 7.114040072538832e-05],
[520.8722482688958, 1221.210024639967, 0, 1, 0.2989940580700378, 0, 0.0008188599666096067, 0.003817820265626248, 0.7010059419299622, 1, 0.000484119724082299],
[520.6145078532094, 1221.627719547812, 0, 1, 0.2988186715172395, 0, 0.0008185799847192007, 0.003816514889153118, 0.7011813284827606, 1, 0.0005555729490773695],
[521.148584474408, 1221.093642926613, 0, 1, 0.2991252170783554, 0, 0.0008189380116690192, 0.003818184139819159, 0.7008747829216446, 1, 0.0005554924697738782],
[520.2656351894846, 1222.058897303691, 0, 2, 0.2986043216902947, 0, 0.001636582332007673, 0.007630336624434822, 0.4919558975515316, 1, 0.001111198675576537],
[520.566948383977, 1221.554483725749, 1, 0, 0.298812091275156, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.298812091275156, 0.0005555276736663185],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553938474266351],
[520.527789183113, 1221.714438217908, 0, 1, 0.298768897341908, 0, 0.0008185218809877381, 0.003816243988617578, 0.701231102658092, 1, 0.0005555600143000238],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553809836951445],
[520.6877436752721, 1221.556746474072, 1, 0, 0.2988603187550554, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988603187550554, 0.0005553882499311208],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.000555639672931413],
[520.4114074697598, 1221.670865439102, 1, 0, 0.2987295236067105, 0.001921556648540815, 0, -0.008958989587343581, 1, 0.2987295236067105, 0.0005555940330224576],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.000555533090545745],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 0, 0.2988607069018208, 0, 0, 0, 1, 1, 8.989019337649977e-05],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.000465468040631299],
[519.9988255037066, 1222.243401897315, 0, 0, 0.2984652864713373, 0, 0, 0, 1, 1, 8.98898784608444e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3432845894894, 1221.898942811532, 0, 1, 0.298662996686579, 0, 0.000818398285621761, 0.003815667742480014, 0.701337003313421, 1, 0.000465468040631299],
[519.9988255037066, 1222.243401897315, 0, 0, 0.2984652864713373, 0, 0, 0, 1, 1, 8.988987848413586e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3432845894894, 1221.898942811532, 0, 1, 0.298662996686579, 0, 0.000818398285621761, 0.003815667742480014, 0.701337003313421, 1, 0.000465468040631299],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 0, 0.2988607069018208, 0, 0, 0, 1, 1, 9.176619856976222e-05],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0004636084663193027],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 0, 0.2988607069018208, 0, 0, 0, 1, 1, 8.988987875252836e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.000465468040631299],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.9988255037066, 1222.243401897315, 0, 0, 0.2984652864713373, 0, 0, 0, 1, 1, 8.98898783929891e-05],
[520.3432845894894, 1221.898942811532, 0, 1, 0.298662996686579, 0, 0.0008183982856217611, 0.003815667742480015, 0.701337003313421, 1, 0.000465468040631299],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.609425273544, 1220.632802127477, 0, 0, 0.2993897272548901, 0, 0, 0, 1, 1, 8.988987832165449e-05],
[521.1485844744082, 1221.093642926613, 0, 1, 0.2991252170783555, 0, 0.0008189380116690192, 0.003818184139819159, 0.7008747829216445, 1, 0.000465468040631299],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.4316230222861, 1219.818389472987, 1, 0, 0.2986526487224607, 0.001925181208994461, 0, -0.008975888594399954, 1, 0.2986526487224607, 0.0005565917701421112],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5583858330705, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987864589929095, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012135410070905, 1, 0.0005553295953433621],
[520.566948383977, 1221.675279017044, 1, 0, 0.2987913736659508, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987913736659508, 0.0005556276786692315],
[521.0583858330705, 1221.183841567951, 0, 1, 0.2990734454934869, 0, 0.0008188775235643801, 0.003817902122476589, 0.7009265545065131, 1, 0.0005553899461511389],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.39452923359, 0, 1, 0.2988881476911235, 0, 0.0008187362691295889, 0.003817243543396226, 0.7011118523088765, 1, 0.0005553901192366671],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.0094161920711, 1219.240590458079, 0, 1, 0.2989848579581871, 0, 0.000820182667658966, 0.003823987174594234, 0.7010151420418129, 1, 0.0005561738757193911],
[520.8432845894894, 1221.398942811532, 0, 1, 0.2989499831871565, 0, 0.0008187333105906453, 0.003817229749621471, 0.7010500168128435, 1, 0.0005555879524752818],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.8148387691506, 1221.427388631871, 1, 0, 0.2989336560542863, 0.001920068180782473, 0, -0.008952049814239202, 1, 0.2989336560542863, 0.0005554673217154908],
[520.5669483839771, 1221.675279017044, 1, 0, 0.2987913736659508, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527369, 1, 0.2987913736659509, 0.0005555989641152911],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.1877436752721, 1222.054483725749, 0, 1, 0.2985737204012434, 0, 0.0008182941213482081, 0.003815182091097921, 0.7014262795987566, 1, 0.000555597120458027],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555920936308091],
[520.1877436752721, 1222.054483725749, 0, 1, 0.2985737204012434, 0, 0.0008182941213482081, 0.003815182091097921, 0.7014262795987566, 1, 0.0005555846748469656],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555006144149928],
[520.4461530926818, 1221.79607430834, 0, 1, 0.2987220404300807, 0, 0.0008184671902519423, 0.003815989000697815, 0.7012779595699192, 1, 0.0005554668971978123],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.566948383977, 1221.675279017044, 1, 0, 0.2987913736659508, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987913736659508, 0.0005556038847004255],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.8388710115473, 1222.403356389474, 0, 2, 0.2983734769114245, 0, 0.001636121162091094, 0.007628186484087016, 0.4922797779013634, 1, 0.001111578563705909],
[520.3432845894894, 1221.898942811532, 0, 1, 0.298662996686579, 0, 0.000818398285621761, 0.003815667742480014, 0.701337003313421, 1, 0.0005553696421377709],
[520.527789183113, 1221.714438217908, 0, 1, 0.298768897341908, 0, 0.0008185218809877381, 0.003816243988617578, 0.701231102658092, 1, 0.0005554166465337554],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553363620642821],
[520.527789183113, 1221.714438217908, 0, 1, 0.298768897341908, 0, 0.0008185218809877381, 0.003816243988617578, 0.701231102658092, 1, 0.000555256870856082],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005553938478467752],
[520.8041253886254, 1221.898942811532, 0, 1, 0.298848458404624, 0, 0.000818398285621761, 0.003815667742480014, 0.701151541595376, 1, 0.0005555584857235128],
[520.6900064235954, 1221.552220977426, 0, 1, 0.2988620056582668, 0, 0.0008186305774139145, 0.003816750770528502, 0.7011379943417333, 1, 0.0005554239555913625],
[521.5022638129316, 1220.73996358809, 0, 1, 0.2993282194697343, 0, 0.0008191752787880601, 0.003819290364634608, 0.7006717805302658, 1, 0.000555266217278997],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.0583858330705, 1221.183841567951, 0, 1, 0.2990734454934869, 0, 0.0008188775235643801, 0.003817902122476589, 0.7009265545065131, 1, 0.0005554390386165421],
[520.7269028761363, 1221.515324524885, 0, 1, 0.2988831832258637, 0, 0.0008186553045406576, 0.003816866057304557, 0.7011168167741364, 1, 0.0005554086301781638],
[520.3432845894894, 1221.898942811532, 0, 1, 0.298662996686579, 0, 0.000818398285621761, 0.003815667742480014, 0.701337003313421, 1, 0.0005554818216466836],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553803937915501],
[520.6877436752721, 1221.39452923359, 0, 1, 0.2988881476911235, 0, 0.0008187362691295889, 0.003817243543396226, 0.7011118523088765, 1, 0.0005555600143035138],
[520.6877436752721, 1221.556746474072, 1, 0, 0.2988603187550554, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988603187550554, 0.0005553938477202064],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005554239555802157],
[520.527789183113, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987741443091586, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012258556908414, 1, 0.0005555600137012096],
[520.1877436752721, 1222.054483725749, 0, 1, 0.2985737204012434, 0, 0.0008182941213482081, 0.003815182091097921, 0.7014262795987566, 1, 0.0005555531406867368],
[520.5669483839771, 1221.554483725749, 1, 0, 0.298812091275156, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527369, 1, 0.298812091275156, 0.0005555380614968938],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553557547132054],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005558336337443104],
[520.6877436752721, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2988385187667002, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7011614812332998, 1, 0.0005553937880234137],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555884509864162],
[520.2269028761363, 1222.015324524885, 1, 0, 0.2985961967252862, 0.001922238151220902, 0, -0.00896216699843853, 1, 0.2985961967252861, 0.0005555603198177122],
[520.3432845894894, 1221.898942811532, 0, 1, 0.298662996686579, 0, 0.000818398285621761, 0.003815667742480014, 0.701337003313421, 1, 0.000555557861494511],
[520.4255896816438, 1221.898942811532, 0, 1, 0.2986961269132461, 0, 0.000818398285621761, 0.003815667742480014, 0.7013038730867539, 1, 0.0005555600143035138],
[520.6877436752721, 1221.804133119107, 1, 0, 0.2988178886854663, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988178886854662, 0.0005554239487452812],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.000555481821922775],
[520.8476981674314, 1221.39452923359, 0, 1, 0.2989525164617337, 0, 0.0008187362691295889, 0.003817243543396226, 0.7010474835382663, 1, 0.0005558125944649431],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.000555512002356033],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.1284479508859, 1221.113779450135, 1, 0, 0.2991136592575167, 0.001918912705556703, 0, -0.008946662572325742, 1, 0.2991136592575167, 0.0005553819687612605],
[520.8476981674314, 1221.39452923359, 0, 1, 0.2989525164617337, 0, 0.0008187362691295889, 0.003817243543396226, 0.7010474835382663, 1, 0.0005554703663190239],
[520.6877436752721, 1221.593642926613, 0, 1, 0.2988539897627054, 0, 0.0008186028191864736, 0.003816621351668645, 0.7011460102372946, 1, 0.0005554600275895403],
[520.527789183113, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987741443091586, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012258556908414, 1, 0.0005554824091672208],
[520.8085389665673, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2989093157875957, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989093157875957, 0.0005553809241855599],
[520.6877436752721, 1221.515324524885, 0, 1, 0.2988674243428962, 0, 0.0008186553045406576, 0.003816866057304557, 0.7011325756571039, 1, 0.000555560429713678],
[520.590412939507, 1221.734119553669, 1, 0, 0.2987907265442502, 0.001920895919603116, 0, -0.008955909030922096, 1, 0.2987907265442502, 0.0005553937884451629],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005555600136803227],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005554239487579037],
[520.5669483839771, 1221.675279017044, 1, 0, 0.2987913736659508, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527369, 1, 0.2987913736659509, 0.0005554823497908031],
[520.6877436752721, 1221.515324524885, 0, 1, 0.2988674243428962, 0, 0.0008186553045406576, 0.003816866057304557, 0.7011325756571039, 1, 0.000555823327719668],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005552942571114091],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005552470381779173],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005556014416377418],
[520.8476981674314, 1221.39452923359, 0, 1, 0.2989525164617337, 0, 0.0008187362691295889, 0.003817243543396226, 0.7010474835382663, 1, 0.0005553932668618282],
[520.6877436752721, 1221.593642926613, 1, 0, 0.2988539897627054, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988539897627054, 0.0005558126011112886],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555120044035839],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553437093282966],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 0, 0.2988607069018208, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000126287997350033],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0004290530405322142],
[520.4461530926818, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2987634689061988, 0.001921428363064331, 0, -0.008958391474220609, 1, 0.2987634689061989, 0.000555485459726958],
[520.3297713793286, 1221.421216045744, 0, 1, 0.2987394725973779, 0, 0.0008187183805742475, 0.003817160140504536, 0.701260527402622, 1, 0.0005558381083867902],
[520.3253578013866, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2987148397935466, 0.001921874429156132, 0, -0.008960471195094175, 1, 0.2987148397935466, 0.0005555192682381078],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.4461530926818, 1221.554483725749, 0, 0, 0.2987634689061988, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001489066074801963],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.566948383977, 1221.554483725749, 1, 0, 0.298812091275156, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.298812091275156, 0.0004064410918576326],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005556032864256125],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 0, 0.2988607069018208, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002673884452226283],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0002879584974008934],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005551725411014323],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 0, 1, 0.2988163339259357, 0, 0.0008184557185032574, 0.00381593551527125, 0.7011836660740642, 1, 0.0005551917330275546],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005552835426112238],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 0, 1, 0.2988163339259357, 0, 0.0008184557185032574, 0.00381593551527125, 0.7011836660740642, 1, 0.0005552835410001526],
[520.566948383977, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2987677224416382, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987677224416382, 0.0005554693001471347],
[520.6877436752721, 1221.774040209288, 0, 1, 0.2988230493724091, 0, 0.0008184819509086159, 0.003816057820198683, 0.7011769506275909, 1, 0.0005554602365011809],
[520.5606485813937, 1221.940294504031, 1, 0, 0.2987433956045059, 0.00192100575163557, 0, -0.008956421107438739, 1, 0.2987433956045059, 0.0005553629323058687],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005553807440045088],
[520.566948383977, 1221.933994701448, 1, 0, 0.2987470109842326, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987470109842325, 0.0005553665982397021],
[521.609425273544, 1220.891517811881, 0, 0, 0.2993452757333587, 0, 0, 0, 1, 1, 7.457559312560952e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.1485844744082, 1221.352358611017, 0, 1, 0.2990808048296472, 0, 0.0008187645383001924, 0.003817375344457242, 0.7009191951703528, 1, 0.0004806764580783988],
[520.4114074697598, 1221.929581123506, 1, 0, 0.2986851660362593, 0.001921556648540815, 0, -0.008958989587343581, 1, 0.2986851660362593, 0.0005554638616999133],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005553993031894132],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 0, 1, 0.2988163339259357, 0, 0.0008184557185032574, 0.00381593551527125, 0.7011836660740642, 1, 0.0005554552064173174],
[520.3432845894894, 1222.157658495935, 0, 1, 0.298618653065475, 0, 0.0008182250408107439, 0.003814860012736974, 0.701381346934525, 1, 0.0005553629323705272],
[520.527789183113, 1221.942557252354, 0, 1, 0.2987297834066129, 0, 0.0008183690747694296, 0.003815531550959419, 0.7012702165933871, 1, 0.0005554730727123665],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005553034710652139],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005553229361140427],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 0, 1, 0.2988163339259357, 0, 0.0008184557185032574, 0.00381593551527125, 0.7011836660740642, 1, 0.0005555200654825495],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005554493924196939],
[520.5583858330705, 1221.942557252354, 0, 1, 0.2987420970408912, 0, 0.0008183690747694296, 0.003815531550959419, 0.7012579029591088, 1, 0.0005554688794415473],
[520.566948383977, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2987677224416382, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987677224416382, 0.0005554049154219211],
[520.8722482688958, 1221.507899525234, 0, 1, 0.298942942461968, 0, 0.0008186602807797414, 0.003816889258324506, 0.701057057538032, 1, 0.0005554652073113357],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005553590903619332],
[520.566948383977, 1221.933994701448, 1, 0, 0.2987470109842326, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987470109842325, 0.0005552311328148919],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 0, 2, 0.2988163339259357, 0, 0.001636911437006515, 0.0076318710305425, 0.4916585335690648, 1, 0.00111085977488438],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005553079504095245],
[520.527789183113, 1221.973153902312, 0, 1, 0.2987245379973344, 0, 0.0008183485838510844, 0.003815436014913564, 0.7012754620026656, 1, 0.0005551924091431823],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.00055517534254207],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005553948549909406],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.527789183113, 1221.973153902312, 0, 1, 0.2987245379973344, 0, 0.0008183485838510843, 0.003815436014913563, 0.7012754620026656, 1, 0.0005551610433826316],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5277891831129, 1221.973153902312, 0, 1, 0.2987245379973343, 0, 0.0008183485838510843, 0.003815436014913563, 0.7012754620026657, 1, 0.00055536113037582],
[520.3140767339945, 1222.156269701473, 1, 0, 0.2986071342897683, 0.001921916097824968, 0, -0.008960665469444871, 1, 0.2986071342897683, 0.0005555149782671256],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1222.191735117134, 0, 1, 0.2987514340555794, 0, 0.0008182022274141469, 0.003814753648460532, 0.7012485659444205, 1, 0.0005557886382826837],
[520.648584474408, 1221.852358611017, 0, 1, 0.2987938609390375, 0, 0.000818429487779346, 0.003815813218183329, 0.7012061390609625, 1, 0.0005553724183602559],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005553875683499144],
[520.8722482688956, 1221.46874032437, 0, 1, 0.2989496612195517, 0, 0.0008186865262998402, 0.003817011624397584, 0.7010503387804483, 1, 0.0005554127208026505],
[520.527789183113, 1221.973153902312, 0, 1, 0.2987245379973344, 0, 0.0008183485838510844, 0.003815436014913564, 0.7012754620026656, 1, 0.000555467452826083],
[521.2558665555425, 1221.124281238587, 1, 0, 0.2991631115720973, 0.001918443636151277, 0, -0.008944475601714108, 1, 0.2991631115720973, 0.0005553532426856963],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.0322027610549, 1221.46874032437, 0, 1, 0.2990140147863964, 0, 0.0008186865262998402, 0.003817011624397584, 0.7009859852136036, 1, 0.0005552581722587621],
[520.7749175331305, 1221.695428902337, 0, 1, 0.2988716098374174, 0, 0.0008185346170104568, 0.00381630336854531, 0.7011283901625827, 1, 0.0005553037413037104],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005553022837494058],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005553073064720949],
[520.527789183113, 1221.973153902312, 0, 1, 0.2987245379973344, 0, 0.0008183485838510844, 0.003815436014913564, 0.7012754620026656, 1, 0.0005554393598931668],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005553073061572726],
[520.566948383977, 1221.933994701448, 1, 0, 0.2987470109842326, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987470109842326, 0.000555444377704601],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 0, 1, 0.2988163339259357, 0, 0.0008184557185032574, 0.00381593551527125, 0.7011836660740642, 1, 0.0005555247673155997],
[520.7609794973349, 1221.822268680244, 0, 1, 0.2988442474940322, 0, 0.0008184496433185438, 0.003815907190570736, 0.7011557525059678, 1, 0.0005552810103612434],
[520.5904129395069, 1221.910530145918, 1, 0, 0.2987604770059429, 0.001920895919603116, 0, -0.0089559090309221, 1, 0.2987604770059429, 0.0005553113126164735],
[519.8824437903535, 1222.618499295071, 0, 2, 0.2983541821617635, 0, 0.001635833255552035, 0.007626844160045975, 0.4923068536898878, 1, 0.0011117033800193],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 0, 1, 0.2988163339259357, 0, 0.0008184557185032574, 0.00381593551527125, 0.7011836660740642, 1, 0.0005553408981169445],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2988163339259357, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988163339259358, 0.0005553839977580923],
[520.5669483839771, 1221.933994701448, 1, 1, 0.2987470109842326, 0.001920982503987915, 0.0008183748093892157, -0.005140754430703861, 0.9107502234279867, 0.5082442453964521, 0.001111310022134993],
[520.594826517449, 1221.44527576884, 0, 2, 0.298842044930085, 0, 0.001637404507329318, 0.007634169902080415, 0.4916224779578249, 1, 0.001111376325795468],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 0, 0, 0.2988163339259357, 0, 0, 0, 1, 1, 4.138583690671235e-06],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.813199410152, 0, 1, 0.2988163339259357, 0, 0.0008184557185032574, 0.00381593551527125, 0.7011836660740642, 1, 0.0005510063821089302],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2988385187667003, 0, 0.000818542380585607, 0.003816339565130502, 0.7011614812332998, 1, 0.0005554803011881889],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005550519763030629],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005554370334415276],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.000555464146510338],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.000555440877034796],
[521.0567528625193, 1220.943883955912, 1, 0, 0.2991139852934676, 0.001919176739398001, 0, -0.008947893593246565, 1, 0.2991139852934676, 0.0005552795785847372],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.8722482688956, 1221.249183840831, 0, 1, 0.2989873373167301, 0, 0.0008188337099681805, 0.003817697847701534, 0.7010126626832699, 1, 0.0005553683227701637],
[520.3678346909537, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2986875786760256, 0.001921717549267625, 0, -0.008959739764517477, 1, 0.2986875786760256, 0.000555312839083833],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.527789183113, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987741443091586, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012258556908414, 1, 0.0005554648000127299],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005557208791440404],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.648584474408, 1221.593642926613, 0, 1, 0.298838230577778, 0, 0.0008186028191864736, 0.003816621351668645, 0.701161769422222, 1, 0.0005553371092902763],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005552884558692209],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005553709249243271],
[520.8085389665673, 1221.433688434454, 1, 0, 0.2989300401376909, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989300401376909, 0.0005553639672783067],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.0501295491576, 1221.433688434454, 1, 0, 0.2990272415568901, 0.001919201134956548, 0, -0.008948007334132198, 1, 0.2990272415568902, 0.0005551342479793418],
[520.8085389665673, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2989093157875957, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989093157875957, 0.0005552356014983034],
[520.0094133876695, 1219.719616136858, 0, 1, 0.2989025328443184, 0, 0.0008198605538273111, 0.003822485363827465, 0.7010974671556816, 1, 0.0005552894378841295],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005552529902775385],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.9464593596756, 1221.295768041346, 1, 0, 0.2990092027196437, 0.001919583062776078, 0, -0.008949788019266245, 1, 0.2990092027196437, 0.0005551962882822194],
[520.8171015174739, 1221.425125883547, 0, 1, 0.2989349548107323, 0, 0.0008187157598191913, 0.003817147921599994, 0.7010650451892677, 1, 0.0005554601001979395],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553932668300698],
[520.7749175331305, 1221.436713217933, 0, 1, 0.2989159918009648, 0, 0.0008187079929548312, 0.003817111709679319, 0.7010840081990353, 1, 0.0005555605442840911],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553809241926963],
[520.724640127813, 1221.517587273208, 1, 0, 0.2988818844694177, 0.00192040077026996, 0, -0.008953600466288686, 1, 0.2988818844694177, 0.0005552975433361142],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005554924094359399],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555165393525762],
[520.8722482688956, 1221.136231734885, 0, 1, 0.2990067237030702, 0, 0.000818909450077725, 0.003818050975387501, 0.7009932762969298, 1, 0.0005555466468416308],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.517587273208, 0, 1, 0.298867036178682, 0, 0.0008186537880574428, 0.003816858986913298, 0.701132963821318, 1, 0.000555368905357492],
[520.3432845894894, 1221.898942811532, 0, 1, 0.298662996686579, 0, 0.0008183982856217611, 0.003815667742480015, 0.701337003313421, 1, 0.0005553819648792057],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.8722482688956, 1221.210024639966, 0, 1, 0.2989940580700378, 0, 0.0008188599666096068, 0.003817820265626249, 0.7010059419299622, 1, 0.00055543338405069],
[520.6306576863053, 1221.464214827723, 0, 1, 0.2988532174111618, 0, 0.0008186895595144726, 0.003817025766337312, 0.7011467825888382, 1, 0.0005553856392144362],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.566948383977, 1221.681578819627, 1, 0, 0.2987902932651709, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987902932651709, 0.0005555130588511264],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553225873174448],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005553682053720314],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.4335534875153, 1221.808673913506, 1, 0, 0.2987148085968899, 0.001921474880508428, 0, -0.008958608355308975, 1, 0.2987148085968899, 0.0005554053970022477],
[520.5606485813937, 1221.681578819628, 1, 0, 0.2987877577493554, 0.00192100575163557, 0, -0.008956421107438739, 1, 0.2987877577493554, 0.0005553951351158624],
[520.3455473378126, 1221.896680063209, 1, 0, 0.298664295443025, 0.001921799859951126, 0, -0.008960123526587135, 1, 0.298664295443025, 0.0005556743274823071],
[521.4290279908688, 1220.813199410152, 1, 0, 0.2992861840851528, 0.001917806539948735, 0, -0.008941505229620705, 1, 0.2992861840851528, 0.0005552753928820761],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.0583858330705, 1221.183841567951, 0, 1, 0.2990734454934869, 0, 0.0008188775235643802, 0.003817902122476589, 0.7009265545065131, 1, 0.0005553067130724509],
[520.8432845894894, 1221.398942811532, 0, 1, 0.2989499831871565, 0, 0.0008187333105906455, 0.003817229749621472, 0.7010500168128435, 1, 0.0005556379518753142],
[519.6877436752721, 1222.515324524885, 0, 1, 0.2982934384406483, 0, 0.0008179856562441352, 0.003813743915617877, 0.7017065615593517, 1, 0.0005554556247468414],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.6877436752721, 1222.554483725749, 1, 0, 0.298286733900666, 0.001924232411039603, 0, -0.008971464956405974, 1, 0.2982867339006661, 0.0005555051987645184],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.6877436752721, 1222.554483725749, 0, 0, 0.298286733900666, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000169163071051821],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.1877436752721, 1222.054483725749, 0, 1, 0.2985737204012434, 0, 0.0008182941213482081, 0.003815182091097921, 0.7014262795987566, 1, 0.0003862168656508986],
[521.0567528625193, 1220.904724755048, 0, 1, 0.2991207093598616, 0, 0.0008190647310343007, 0.003818774951167309, 0.7008792906401384, 1, 0.0005554940977585017],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.8722482688958, 1221.249183840831, 0, 1, 0.2989873373167302, 0, 0.0008188337099681805, 0.003817697847701534, 0.7010126626832698, 1, 0.0005554006854608467],
[520.6877436752721, 1221.515324524885, 0, 1, 0.2988674243428962, 0, 0.0008186553045406576, 0.003816866057304557, 0.7011325756571039, 1, 0.0005555399682566822],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[519.694752140781, 1219.305610529583, 0, 1, 0.2988468336733129, 0, 0.0008201389310147342, 0.003823783258596984, 0.7011531663266871, 1, 0.0005565609165827412],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553919742016684],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.1485844744082, 1221.093642926613, 0, 1, 0.2991252170783555, 0, 0.0008189380116690192, 0.003818184139819159, 0.7008747829216445, 1, 0.0005552778992568848],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.527789183113, 1221.714438217908, 0, 1, 0.298768897341908, 0, 0.0008185218809877381, 0.003816243988617578, 0.701231102658092, 1, 0.0005557348370407992],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005555258238483608],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3678346909537, 1221.835233509204, 0, 1, 0.298683801095895, 0, 0.0008184409587927204, 0.003815866700181612, 0.701316198904105, 1, 0.0005556077105154962],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.527789183113, 1221.714438217908, 0, 1, 0.298768897341908, 0, 0.0008185218809877381, 0.003816243988617578, 0.701231102658092, 1, 0.0005553180471160531],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.2690734987095, 1221.973153902312, 0, 1, 0.2986204015240852, 0, 0.0008183485838510843, 0.003815436014913563, 0.7013795984759148, 1, 0.0005555844079433511],
[520.5583858330705, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987864589929095, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012135410070905, 1, 0.0005554186169016173],
[520.6877436752721, 1221.593642926613, 0, 1, 0.2988539897627054, 0, 0.0008186028191864736, 0.003816621351668645, 0.7011460102372946, 1, 0.0005554399548767609],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.566948383977, 1221.675279017044, 1, 0, 0.2987913736659508, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987913736659509, 0.0005555380613543644],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 0, 0.2988607069018208, 0, 0, 0, 1, 1, 6.758364312884877e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.000487773589112892],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.593642926613, 0, 1, 0.2988539897627054, 0, 0.0008186028191864736, 0.003816621351668645, 0.7011460102372946, 1, 0.0005556073301241428],
[520.3082326995736, 1221.813199410152, 1, 0, 0.2986635851609237, 0.001921937684536698, 0, -0.008960766114474389, 1, 0.2986635851609237, 0.0005556904252483349],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.4290279908688, 1221.813199410152, 1, 0, 0.298712211083998, 0.001921491589084738, 0, -0.008958686256713179, 1, 0.298712211083998, 0.0005555537009426287],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5583858330705, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987864589929095, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012135410070905, 1, 0.0005555931783958985],
[520.566948383977, 1221.554483725749, 1, 0, 0.298812091275156, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.298812091275156, 0.0005555413890461083],
[520.4461530926818, 1221.79607430834, 0, 0, 0.2987220404300807, 0, 0, 0, 1, 1, 7.168689443405325e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.566948383977, 1221.675279017044, 1, 0, 0.2987913736659508, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987913736659508, 0.000483653697091413],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.4461530926818, 1221.796074308339, 0, 0, 0.2987220404300807, 0, 0, 0, 1, 1, 9.22715910396081e-05],
[520.566948383977, 1221.675279017044, 1, 0, 0.2987913736659508, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987913736659509, 0.0004631061145864022],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 0, 0.2988607069018208, 0, 0, 0, 1, 1, 7.513886442125435e-05],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0004801874294611267],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005553823573599476],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005555101283595483],
[520.6877436752721, 1221.304834332391, 1, 0, 0.2989035373909507, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2989035373909507, 0.0005553715741676012],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005561815802483774],
[519.479889914754, 1219.671957845244, 0, 2, 0.298697259002333, 0, 0.001639785179232404, 0.007645269452440705, 0.4918255345308408, 1, 0.00116226444371911],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005554339257592761],
[520.3432845894894, 1221.898942811532, 0, 1, 0.298662996686579, 0, 0.000818398285621761, 0.003815667742480014, 0.701337003313421, 1, 0.0005553616310231328],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005555580348350664],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005555426807310631],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.566948383977, 1221.554483725749, 1, 0, 0.298812091275156, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.298812091275156, 0.0005555716773135223],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555958253570197],
[520.6877436752721, 1221.234574741431, 0, 1, 0.2989155935200051, 0, 0.0008188435053206118, 0.003817743517164624, 0.7010844064799948, 1, 0.0005553286382717198],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.39452923359, 0, 1, 0.2988881476911235, 0, 0.0008187362691295889, 0.003817243543396226, 0.7011118523088765, 1, 0.0005558699596907895],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 0, 0.2988607069018208, 0, 0, 0, 1, 1, 6.880028969730968e-05],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0004864166538102966],
[521.0076526595907, 1221.234574741431, 0, 0, 0.2990443260216465, 0, 0, 0, 1, 1, 6.880028985709853e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.8476981674314, 1221.39452923359, 0, 1, 0.2989525164617337, 0, 0.0008187362691295889, 0.003817243543396226, 0.7010474835382663, 1, 0.0004864166538102966],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.9293342578625, 1221.312893143159, 0, 0, 0.298999373373561, 0, 0, 0, 1, 1, 9.063920028494824e-05],
[520.8085389665673, 1221.433688434454, 1, 0, 0.2989300401376909, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989300401376909, 0.0004646026888901155],
[521.1877436752721, 1221.093642926613, 0, 2, 0.2991409698130262, 0, 0.001637876023338038, 0.007636368279638319, 0.4912033801946253, 1, 0.001112326586383998],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005554449719175326],
[520.6877436752721, 1221.515324524885, 0, 1, 0.2988674243428962, 0, 0.0008186553045406576, 0.003816866057304557, 0.7011325756571039, 1, 0.0005555600130471463],
[520.8085389665673, 1221.433688434454, 1, 0, 0.2989300401376909, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989300401376909, 0.0005553803944194651],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 0, 0.2988607069018208, 0, 0, 0, 1, 1, 8.988987796276273e-05],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.000465468040631299],
[520.4290279908688, 1221.813199410152, 0, 0, 0.298712211083998, 0, 0, 0, 1, 1, 8.989008483644968e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5583858330705, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987864589929095, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012135410070905, 1, 0.000465468040631299],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 0, 0.2988607069018208, 0, 0, 0, 1, 1, 8.98901933504513e-05],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.000465468040631299],
[519.9988255037066, 1222.243401897315, 0, 0, 0.2984652864713373, 0, 0, 0, 1, 1, 8.988987843753462e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3432845894894, 1221.898942811532, 0, 1, 0.298662996686579, 0, 0.0008183982856217611, 0.003815667742480015, 0.701337003313421, 1, 0.000465468040631299],
[520.6877436752721, 1221.234574741431, 0, 0, 0.2989155935200051, 0, 0, 0, 1, 1, 8.988987841903745e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.39452923359, 0, 1, 0.2988881476911235, 0, 0.0008187362691295889, 0.003817243543396226, 0.7011118523088765, 1, 0.000465468040631299],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.476165324021, 1, 0, 0.2988741420859519, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.298874142085952, 0.0005553778299784083],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.515324524885, 0, 1, 0.2988674243428962, 0, 0.0008186553045406576, 0.003816866057304557, 0.7011325756571039, 1, 0.0005553227117129781],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553495090351627],
[520.6877436752721, 1221.515324524885, 0, 2, 0.2988674243428962, 0, 0.001637310609081315, 0.007633732114609114, 0.4915868886475644, 1, 0.001111369272256624],
[521.0583858330705, 1221.183841567951, 0, 1, 0.2990734454934869, 0, 0.0008188775235643801, 0.003817902122476589, 0.7009265545065131, 1, 0.0005555821168119897],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005554773794828593],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.609425273544, 1220.632802127477, 0, 0, 0.2993897272548901, 0, 0, 0, 1, 1, 4.92243409029617e-05],
[521.1485844744082, 1221.093642926613, 1, 0, 0.2991252170783555, 0.001918838561191768, 0, -0.008946316884576221, 1, 0.2991252170783555, 0.0005073559248251234],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005554969158988804],
[520.566948383977, 1221.675279017044, 1, 0, 0.2987913736659508, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987913736659509, 0.0005554818216449202],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.3678346909537, 1221.874392710068, 0, 0, 0.2986770877819952, 0, 0, 0, 1, 1, 7.114040146296572e-05],
[520.527789183113, 1221.714438217908, 0, 1, 0.298768897341908, 0, 0.0008185218809877381, 0.003816243988617578, 0.701231102658092, 1, 0.0004841197270123638],
[520.7850744110374, 1221.457152989984, 1, 0, 0.2989165721163327, 0.001920177918176539, 0, -0.008952561449517574, 1, 0.2989165721163327, 0.0005555735392801096],
[520.1587799958659, 1222.114044055113, 1, 2, 0.2985518529678025, 0.001922489898195985, 0.00163650848276301, -0.00133334842091874, 0.7858221426308721, 0.6548668168530808, 0.001670302326556436],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005553337070791057],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5583858330705, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987864589929095, 0, 0.000818542380585607, 0.003816339565130502, 0.7012135410070905, 1, 0.0005556668055021546],
[520.5277891831129, 1221.714438217908, 0, 1, 0.298768897341908, 0, 0.0008185218809877381, 0.003816243988617578, 0.701231102658092, 1, 0.000555438548415156],
[520.5583858330705, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987864589929095, 0, 0.000818542380585607, 0.003816339565130502, 0.7012135410070905, 1, 0.0005554823495139221],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005554974961673539],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 0, 0.2988607069018208, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001976173061345863],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0003577183663895261],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.7806608330955, 1221.711215961284, 0, 1, 0.2988712129844548, 0, 0.000818524039834705, 0.003816254053940145, 0.7011287870155452, 1, 0.0005553987893894601],
[520.8476981674314, 1221.39452923359, 0, 1, 0.2989525164617337, 0, 0.0008187362691295889, 0.003817243543396226, 0.7010474835382663, 1, 0.0005553888300481201],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555825318505058],
[520.8722482688958, 1221.249183840831, 0, 2, 0.2989873373167302, 0, 0.001637667419936361, 0.007635395695403068, 0.4914187532422878, 1, 0.00111163696139198],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.7806608330955, 1221.711215961284, 0, 1, 0.2988712129844548, 0, 0.000818524039834705, 0.003816254053940145, 0.7011287870155452, 1, 0.0005555043896992625],
[520.7850744110374, 1221.457152989984, 1, 0, 0.2989165721163326, 0.001920177918176539, 0, -0.008952561449517574, 1, 0.2989165721163326, 0.0005555763259371127],
[520.8722482688956, 1221.249183840831, 0, 1, 0.2989873373167301, 0, 0.0008188337099681805, 0.003817697847701534, 0.7010126626832699, 1, 0.0005554818282713948],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005558130175282996],
[520.5583858330705, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987864589929095, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012135410070905, 1, 0.000555512004069637],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005554405450688382],
[520.7609794973349, 1221.563552995841, 0, 1, 0.2988886225186493, 0, 0.0008186229832639781, 0.003816715363864714, 0.7011113774813507, 1, 0.000555408905717288],
[520.7806608330955, 1221.922407367062, 0, 1, 0.2988349939447524, 0, 0.0008183825699331848, 0.003815594470276242, 0.7011650060552476, 1, 0.0005555328590887829],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005554038222406805],
[520.5277891831129, 1221.714438217909, 1, 1, 0.298768897341908, 0.001921127019115241, 0.000818521880987738, -0.005140742511513839, 0.9107371459811004, 0.5082749406649165, 0.001111986053005099],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005554010175336244],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005553938552988405],
[520.6877436752721, 1221.39452923359, 0, 1, 0.2988881476911235, 0, 0.0008187362691295889, 0.003817243543396226, 0.7011118523088765, 1, 0.0005555125853783535],
[520.4406153252546, 1221.832208725724, 0, 1, 0.2987136159968173, 0, 0.00081844298493565, 0.003815876146790133, 0.7012863840031827, 1, 0.0005555605442989735],
[520.8085389665673, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2989093157875957, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989093157875957, 0.0005554455614900335],
[520.724640127813, 1221.517587273208, 0, 1, 0.2988818844694177, 0, 0.0008186537880574429, 0.003816858986913299, 0.7011181155305823, 1, 0.0005555606037167973],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005554239474857964],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005554455021110418],
[520.5032390816486, 1221.898942811532, 0, 1, 0.2987273802171802, 0, 0.000818398285621761, 0.003815667742480014, 0.7012726197828199, 1, 0.0005555922398411577],
[520.590412939507, 1221.651814461515, 1, 0, 0.2988048416873091, 0.001920895919603116, 0, -0.008955909030922096, 1, 0.2988048416873091, 0.0005554236808635993],
[520.8801810420302, 1221.362046358991, 0, 1, 0.2989711607547533, 0, 0.0008187580439240809, 0.003817345065335363, 0.7010288392452466, 1, 0.0005553938552988405],
[520.7806608330955, 1221.54387166008, 0, 1, 0.2988999185403682, 0, 0.0008186361727974601, 0.00381677685822306, 0.7011000814596318, 1, 0.0005555423867673082],
[520.7850744110374, 1221.457152989984, 1, 0, 0.2989165721163326, 0.001920177918176539, 0, -0.008952561449517574, 1, 0.2989165721163326, 0.000555602925249909],
[520.3432845894894, 1221.898942811532, 0, 1, 0.298662996686579, 0, 0.000818398285621761, 0.003815667742480014, 0.701337003313421, 1, 0.0005554767988107655],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555578601436415],
[520.7806608330955, 1221.54387166008, 0, 1, 0.2988999185403682, 0, 0.0008186361727974601, 0.00381677685822306, 0.7011000814596318, 1, 0.000555560429642426],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555125847949337],
[520.527789183113, 1221.714438217908, 0, 1, 0.298768897341908, 0, 0.0008185218809877381, 0.003816243988617578, 0.701231102658092, 1, 0.0005555584519504549],
[520.7850744110374, 1221.457152989984, 1, 0, 0.2989165721163327, 0.001920177918176539, 0, -0.008952561449517574, 1, 0.2989165721163327, 0.0005556074015750601],
[520.7806608330955, 1221.54387166008, 0, 1, 0.2988999185403682, 0, 0.0008186361727974601, 0.00381677685822306, 0.7011000814596318, 1, 0.0005555423822552709],
[520.3678346909537, 1221.874392710068, 1, 0, 0.2986770877819951, 0.001921717549267625, 0, -0.008959739764517477, 1, 0.2986770877819951, 0.0005553547729168507],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.5277891831129, 1221.714438217909, 0, 1, 0.298768897341908, 0, 0.000818521880987738, 0.003816243988617578, 0.701231102658092, 1, 0.000555356278820856],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.000555612418155189],
[520.566948383977, 1221.681578819627, 1, 0, 0.2987902932651709, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987902932651709, 0.0005554824090374393],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005556073814211879],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555429719423418],
[520.5583858330705, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987864589929095, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012135410070905, 1, 0.0005555584525399335],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555605443029205],
[520.5583858330705, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987864589929095, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012135410070905, 1, 0.0005555120042002485],
[520.566948383977, 1221.554483725749, 1, 0, 0.298812091275156, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.298812091275156, 0.0005554824084203837],
[520.527789183113, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2987963297014415, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7012036702985585, 1, 0.0005557023393523637],
[521.1485844744082, 1221.093642926613, 0, 1, 0.2991252170783555, 0, 0.0008189380116690192, 0.003818184139819159, 0.7008747829216445, 1, 0.000555512002103742],
[520.8722482688958, 1221.24918384083, 0, 1, 0.2989873373167302, 0, 0.0008188337099681807, 0.003817697847701535, 0.7010126626832698, 1, 0.000555482409024409],
[520.8085389665673, 1221.433688434454, 1, 0, 0.2989300401376909, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989300401376909, 0.0005553809832957514],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555600142832264],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555584519193303],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553809837085156],
[521.1485844744082, 1221.093642926613, 1, 0, 0.2991252170783555, 0.001918838561191768, 0, -0.008946316884576221, 1, 0.2991252170783555, 0.0005557017592197653],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005554455618608843],
[520.527789183113, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987741443091586, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012258556908414, 1, 0.0005555600131294131],
[520.566948383977, 1221.554483725749, 1, 0, 0.298812091275156, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.298812091275156, 0.0005555120040720135],
[521.0322027610549, 1221.210024639966, 0, 1, 0.2990584171170626, 0, 0.0008188599666096068, 0.003817820265626249, 0.7009415828829374, 1, 0.0005553938478296473],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555605442924323],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553809833046577],
[520.6877436752721, 1221.714438217909, 0, 1, 0.2988332711507092, 0, 0.000818521880987738, 0.003816243988617578, 0.7011667288492909, 1, 0.0005554455616206922],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553809839902141],
[520.6485844744082, 1221.593642926613, 0, 1, 0.2988382305777781, 0, 0.0008186028191864736, 0.003816621351668645, 0.7011617694222219, 1, 0.0005559559805468406],
[520.5277891831129, 1221.714438217909, 0, 1, 0.298768897341908, 0, 0.000818521880987738, 0.003816243988617578, 0.701231102658092, 1, 0.0005554818277543831],
[520.8085389665673, 1221.433688434454, 1, 0, 0.2989300401376909, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989300401376909, 0.00055538098359921],
[520.7269028761363, 1221.515324524885, 0, 1, 0.2988831832258637, 0, 0.0008186553045406576, 0.003816866057304557, 0.7011168167741364, 1, 0.0005558130197347719],
[521.5611664404612, 1220.521106468401, 0, 1, 0.2993895148072303, 0, 0.0008193221687853619, 0.003819975218738343, 0.7006104851927697, 1, 0.0005553591321696304],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[521.0322027610549, 1221.210024639967, 0, 1, 0.2990584171170626, 0, 0.0008188599666096067, 0.003817820265626248, 0.7009415828829374, 1, 0.0005554496488302587],
[520.6485844744082, 1221.593642926613, 0, 1, 0.2988382305777781, 0, 0.0008186028191864736, 0.003816621351668645, 0.7011617694222219, 1, 0.000555482409024409],
[520.7609794973349, 1221.481247903687, 0, 1, 0.2989027422864022, 0, 0.000818678143210308, 0.003816972539413082, 0.7010972577135978, 1, 0.0005553938477252434],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005555600143062849],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005555120044127329],
[520.566948383977, 1221.554483725749, 1, 0, 0.298812091275156, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.298812091275156, 0.0005554818220969436],
[520.8041253886253, 1221.687751405754, 0, 1, 0.2988846790762297, 0, 0.0008185397609571958, 0.003816327351478785, 0.7011153209237704, 1, 0.0005555417806895642],
[520.5904129395069, 1221.651814461514, 1, 0, 0.2988048416873091, 0.001920895919603116, 0, -0.0089559090309221, 1, 0.298804841687309, 0.0005554018623769111],
[520.566948383977, 1221.681578819628, 1, 0, 0.2987902932651708, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987902932651708, 0.0005554824092070082],
[520.8085389665673, 1221.433688434454, 1, 0, 0.2989300401376909, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989300401376909, 0.0005554455020835067],
[520.8085389665673, 1221.433688434454, 1, 0, 0.2989300401376909, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989300401376909, 0.0005553804003309176],
[520.6877436752721, 1221.515324524885, 0, 1, 0.2988674243428962, 0, 0.0008186553045406576, 0.003816866057304557, 0.7011325756571039, 1, 0.0005555603204333563],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555584504457147],
[520.5583858330705, 1221.683841567951, 0, 1, 0.2987864589929095, 0, 0.0008185423805856069, 0.003816339565130502, 0.7012135410070905, 1, 0.000555512585096459],
[520.6854809269489, 1221.556746474072, 0, 1, 0.2988594081453749, 0, 0.0008186275446363186, 0.003816736630626396, 0.7011405918546252, 1, 0.0005557023416032559],
[520.7806608330955, 1221.711215961284, 0, 1, 0.2988712129844548, 0, 0.000818524039834705, 0.003816254053940145, 0.7011287870155452, 1, 0.0005555600137107324],
[520.8085389665673, 1221.433688434454, 1, 0, 0.2989300401376909, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989300401376909, 0.0005553803997075853],
[520.3432845894894, 1221.898942811532, 0, 1, 0.298662996686579, 0, 0.000818398285621761, 0.003815667742480014, 0.701337003313421, 1, 0.0005555578591718699],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005555120044591143],
[520.8432845894895, 1221.64859220489, 0, 1, 0.2989071521800563, 0, 0.0008185659987502231, 0.003816449681525472, 0.7010928478199437, 1, 0.0005555584795756006],
[520.8085389665673, 1221.433688434454, 1, 0, 0.2989300401376909, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989300401376909, 0.000555445561487999],
[521.0583858330705, 1221.183841567951, 0, 1, 0.2990734454934869, 0, 0.0008188775235643801, 0.003817902122476589, 0.7009265545065131, 1, 0.0005555600139698419],
[520.566948383977, 1221.675279017044, 1, 0, 0.2987913736659508, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987913736659509, 0.0005555120035200966],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005554821298826583],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.000555560014330427],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.000555512002103742],
[520.3140767339945, 1221.897554017069, 1, 0, 0.2986514769791132, 0.001921916097824968, 0, -0.008960665469444871, 1, 0.2986514769791131, 0.000555481828222685],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 0, 1, 0.2988607069018208, 0, 0.0008186290610223078, 0.003816743700564354, 0.7011392930981792, 1, 0.0005554233687629549],
[520.7749175331305, 1221.436713217933, 0, 1, 0.2989159918009648, 0, 0.0008187079929548312, 0.003817111709679319, 0.7010840081990353, 1, 0.0005555600145866567],
[520.590412939507, 1221.781172303716, 1, 0, 0.2987826576997559, 0.001920895919603116, 0, -0.008955909030922096, 1, 0.2987826576997559, 0.0005553932732851875],
[520.8085389665673, 1221.433688434454, 1, 0, 0.2989300401376909, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989300401376909, 0.000555380701211673],
[520.6833300973301, 1222.019738102827, 0, 1, 0.2987791435032507, 0, 0.0008183173878619094, 0.003815290567969598, 0.7012208564967493, 1, 0.0005558125963788368],
[520.1877436752721, 1222.054483725749, 0, 1, 0.2985737204012434, 0, 0.0008182941213482081, 0.003815182091097921, 0.7014262795987566, 1, 0.0005555578608957031],
[521.1877436752721, 1221.054483725749, 0, 1, 0.2991476934023982, 0, 0.0008189642750000348, 0.003818306588933151, 0.7008523065976018, 1, 0.0005554233732413333],
[520.6508472227313, 1221.59138017829, 1, 0, 0.298839529334224, 0.001920672952582762, 0, -0.008954869478320209, 1, 0.298839529334224, 0.0005555600142969416],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005553938552988405],
[520.8722482688958, 1221.249183840831, 0, 1, 0.2989873373167302, 0, 0.0008188337099681805, 0.003817697847701534, 0.7010126626832698, 1, 0.0005555123158848893],
[520.4406153252546, 1221.832208725725, 0, 1, 0.2987136159968173, 0, 0.0008184429849356499, 0.003815876146790132, 0.7012863840031827, 1, 0.0005555606037316807],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.000555455596771393],
[520.8620913909888, 1221.318942710118, 0, 1, 0.2989712786419651, 0, 0.0008187869401100019, 0.003817479789767753, 0.7010287213580348, 1, 0.0005553422245747113],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[520.7749175331305, 1221.436713217933, 0, 1, 0.2989159918009648, 0, 0.0008187079929548312, 0.003817111709679319, 0.7010840081990353, 1, 0.000555454263708982],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.000555517615808791],
[520.8085389665673, 1221.427388631871, 1, 0, 0.2989311210476924, 0.00192009140630506, 0, -0.008952158099995533, 1, 0.2989311210476924, 0.0005554455616254506],
[520.590412939507, 1221.781172303716, 1, 0, 0.298782657699756, 0.001920895919603116, 0, -0.008955909030922096, 1, 0.298782657699756, 0.0005553938478508438],
[520.7183403252297, 1221.523887075792, 0, 1, 0.2988782685528223, 0, 0.0008186495659891693, 0.003816839302109456, 0.7011217314471777, 1, 0.0005559558013283409],
[521.0322027610549, 1221.210024639967, 0, 1, 0.2990584171170626, 0, 0.0008188599666096067, 0.003817820265626248, 0.7009415828829374, 1, 0.0005553809835792142],
[520.8476981674314, 1221.39452923359, 0, 1, 0.2989525164617337, 0, 0.0008187362691295889, 0.003817243543396226, 0.7010474835382663, 1, 0.0005553932668071],
[520.6485844744082, 1221.593642926613, 0, 1, 0.2988382305777781, 0, 0.0008186028191864736, 0.003816621351668645, 0.7011617694222219, 1, 0.0005559558018170399],
[520.566948383977, 1221.681578819627, 1, 0, 0.2987902932651709, 0.001920982503987915, 0, -0.008956312718527371, 1, 0.2987902932651709, 0.0005555125849098635],
[520.6877436752721, 1221.554483725749, 1, 0, 0.2988607069018208, 0.001920536851782806, 0, -0.008954234927342718, 1, 0.2988607069018208, 0.0005555600140646779],
[520.5606485813937, 1221.681578819628, 1, 0, 0.2987877577493554, 0.00192100575163557, 0, -0.008956421107438739, 1, 0.2987877577493554, 0.000555512002103742]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[1.005448420114541, 2.010896840229083, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[1.005448420114541, 2.010896840229083, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.989162208611516, 0, -9.324720761312784, 1, 0.1111111111111109, 0.2133213701008963],
[1.005448420114541, 2.010246890453709, 1, 0, 0.3334051741205525, 0.9945811043057579, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3334051741205525, 0.2133213701008963],
[1.005448420114541, 2.010896840229083, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4972905521528789, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2133213701008963],
[0.683796437251065, 2.271022116371324, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[1.005448420114541, 2.010896840229083, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[0.9988442977215519, 2.000577851139225, 0, 2, 0.3330122430751961, 0, 0.9997111578842602, 4.661013694619704, 0.4448726678875813, 1, 0.2144836345446154],
[0.9207431616292024, 2.005512875309305, 1, 0, 0.3146488721446596, 1.086079203923228, 0, -5.063692650626494, 1, 0.3146488721446596, 0.2144836345446154],
[0.6804037917697373, 2.319596208230262, 1, 0, 0.2268012639232458, 1.469715501436271, 0, -6.852343324733019, 1, 0.2268012639232458, 0.2144836345446154],
[1, 1.921681598271837, 0, 0, 0.3422686443969446, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 1.584061701693088, 0, 0, 0.2378156781098074, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999999, 0, -9.324720761312784, 1, 0.1111111111111109, 0.2144836345446154],
[1, 1.921681598271837, 0, 0, 0.3422686443969446, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.369009187247032, 1.311081828434476, 0, 0, 0.5108069760455179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.835389815691059, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2946296170875722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 3, 0.3333333333333333, 0, 1.499999999999999, 6.993540570984589, 0.2962962962962963, 1, 0.2144836345446154],
[0.9213687384834687, 2.004854672922699, 1, 0, 0.3148661632915834, 1.085341794476286, 0, -5.060254582036752, 1, 0.3148661632915835, 0.2144836345446154],
[0.3119737660700486, 2.688026233929952, 0, 1, 0.1039912553566829, 0, 0.3720201787383521, 1.734492142154403, 0.8960087446433171, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.835389815691059, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2946296170875722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.99979709252569, 0, 1, 0.3333558801332282, 0, 0.5000507320155301, 2.331416721267435, 0.6666441198667719, 1, 0.2144836345446154],
[0.9213687241353598, 2.07863127586464, 1, 0, 0.3071229080451199, 1.085341811377883, 0, -5.060254660838085, 1, 0.3071229080451199, 0.2144836345446154],
[1.368757154536166, 1.31166882632757, 1, 0, 0.5106491148452083, 0.7305897884704556, 0, -3.406272884276788, 1, 0.5106491148452083, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.004525496646478, 0, 0, 0.3149748354695882, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9210559396607281, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3153160907174224, 2.171420772485005, 0, -10.12394617936839, 1, 0.09942423706531756, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6796095527032984, 2.318002537584113, 0, 1, 0.2267169774585935, 0, 0.4314059125415057, 2.011369834614434, 0.7732830225414065, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.3110818284344756, 2.688918171565525, 0, 0, 0.1036939428114919, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.000956260025405, 1.920200686843483, 0, 2, 0.3426574738130054, 0, 1.041557798465167, 4.856117813727693, 0.4320991967338996, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.921681598271837, 0, 0, 0.3422686443969446, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.368531251852801, 1.311974105345999, 0, 1, 0.5105497171186231, 0, 0.7622101655247807, 3.55369847747629, 0.4894502828813769, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[1.173707598064067, 1.765178354181679, 0, 1, 0.3993716044568453, 0, 0.5665149913214245, 2.641297050584911, 0.6006283955431547, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.001386383213657, 1.998326944362275, 2, 2, 0.3338273607707964, 1.997231072367475, 1.000837228183529, -4.645547182653154, 0.8884492652628824, 0.4082856779252251, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9983245033118311, 2.00167549668817, 0, 1, 0.3327748344372769, 0, 0.4995814764453723, 2.329228882688729, 0.667225165562723, 1, 0.2144836345446154],
[0.9213687554782538, 2.00485465504159, 1, 0, 0.3148661691947071, 1.085341774456994, 0, -5.060254488699596, 1, 0.314866169194707, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.318666145822644, 0, 1, 0.2267909600723986, 0, 0.4312824430552973, 2.010794175373716, 0.7732090399276014, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.001193576356176, 1.998400752676451, 0, 5, 0.3337763265738212, 0, 2.502000658928655, 11.66522874456515, 0.131250299684745, 1, 0.2144836345446154],
[0.9991714298692922, 2.000670078362755, 0, 2, 0.3330747398245558, 0, 0.9996650730322796, 4.660798830431681, 0.4447893026600839, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6801024684200345, 2.319249719473056, 0, 1, 0.2267497865590022, 0, 0.4311739230164506, 2.010288215844089, 0.7732502134409978, 1, 0.2144836345446154],
[0.9998984967223259, 2.000101503277675, 0, 1, 0.3332994989074418, 0, 0.4999746254683802, 2.331061885117296, 0.6667005010925582, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -2.331180190328196, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2144836345446154],
[0.6892196250940126, 1.390292452865306, 0, 1, 0.3314333359248207, 0, 0.7192731269878239, 3.353510530138866, 0.6685666640751793, 1, 0.2144836345446154],
[1.001301635342169, 1.998698364657832, 1, 0, 0.3337672117807229, 0.99870005670996, 0, -4.656299576563812, 1, 0.3337672117807229, 0.2144836345446154],
[0.9210557623147538, 2.000000000000001, 2, 0, 0.315316049148228, 2.171421190584264, 0, -10.12394812869781, 1, 0.09942421085044773, 0.2144836345446154],
[1.369009187247032, 1.311081828434476, 0, 0, 0.5108069760455179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.500701213283672, 0, 0, 0.399887837334593, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6886661253167065, 2.146723690374349, 1, 0, 0.2428823442567319, 1.45208245801275, 0, -6.7701317216848, 1, 0.2428823442567319, 0.2144836345446154],
[1.000955667032239, 1.920201694963363, 0, 3, 0.3426572221184386, 0, 1.562335877459601, 7.284172896345689, 0.2840375038156182, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.002546324743734, 1.997453675256267, 1, 2, 0.3341821082479111, 0.9974601425581162, 1.001274785380645, 0.01778523956211435, 0.7396083216587284, 0.7048339633635696, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 3, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 1.499999999999999, 2.331180190328196, 0.5925925925925928, 0.802469135802469, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6805563861975327, 2.319443613802466, 0, 1, 0.226852128732511, 0, 0.4311378789504663, 2.010120165418887, 0.7731478712674891, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.174347715716582, 1.764458984368317, 0, 0, 0.3996001899963874, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.500701213283672, 0, 0, 0.399887837334593, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.389400230162639, 0, 0, 0.3314786468679079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9995856825162783, 2.000335065398648, 0, 1, 0.3332040298768003, 0, 0.49991624768159, 2.330789706837054, 0.6667959701231997, 1, 0.2144836345446154],
[1.369009187247032, 1.311081828434476, 0, 0, 0.5108069760455179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6804038013197179, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2538437682354858, 1.469715480807706, 0, -6.852343228555211, 1, 0.2538437682354858, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6804036623938542, 2.319596337606145, 1, 0, 0.2268012207979515, 1.469715780896468, 0, -6.852344627677166, 1, 0.2268012207979515, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9995856825154052, 2.000414317484596, 0, 1, 0.3331952275051349, 0, 0.4998964420817791, 2.330697365993181, 0.6668047724948651, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9215656632486041, 2.078434336751395, 1, 2, 0.3071885544162014, 1.085109873207415, 0.9622627785903554, -0.5727574268213259, 0.7748811539996945, 0.6674590283019781, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6804038010243366, 2.319596198975662, 1, 0, 0.2268012670081123, 1.469715481445748, 0, -6.852343231529995, 1, 0.2268012670081123, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9213687555116211, 2.078631244488378, 1, 0, 0.3071229185038738, 1.085341774417688, 0, -5.06025448851634, 1, 0.3071229185038737, 0.2144836345446154],
[0, 2.011486599929853, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9991079084858943, 2.000892091514107, 0, 1, 0.333035969495298, 0, 0.4997770765555298, 2.33014084089278, 0.666964030504702, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6805052088115772, 2.319494791188422, 0, 1, 0.2268350696038592, 0, 0.4311283663144757, 2.010075814081728, 0.7731649303961409, 1, 0.2144836345446154],
[0.9213687241352796, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3153893983060981, 1.085341811377977, 0, -5.060254660838527, 1, 0.3153893983060981, 0.2144836345446154],
[0.742289012799495, 2.257710987200505, 0, 1, 0.247429670933165, 0, 0.4429264886733666, 2.065082912333958, 0.752570329066835, 1, 0.2144836345446154],
[1.369009187247032, 1.311081828434476, 0, 0, 0.5108069760455179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9210557182687876, 2.078944281731212, 1, 2, 0.3070185727562627, 1.085710647212088, 0.9620267448122891, -0.5766589262737951, 0.775098177365758, 0.6672142009257283, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9989936982401098, 2.001006301759892, 0, 1, 0.3329978994133698, 0, 0.4997485510767741, 2.33000784483079, 0.6670021005866302, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.811783041718148, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.835200114310215, 2.000189701380845, 0, 1, 0.2945627122197498, 0, 0.4999525791526889, 2.330959097248477, 0.7054372877802502, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.494446301732919, 2.341156595272369, 0, 1, 0.1743707845182093, 0, 0.4271393045725165, 1.991477370660026, 0.8256292154817907, 1, 0.2144836345446154],
[0.999896234019257, 2.000103765980744, 0, 0.75, 0.3332987446730856, 0, 0.3749805448879999, 1.748294436002757, 0.7378166552643888, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.811783041718148, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[1.001193984069432, 1.998806015930569, 1, 0, 0.3337313280231439, 0.9988074398284146, 0, -4.656800235360846, 1, 0.3337313280231439, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[0.999610842494596, 2.000389157505405, 0, 1, 0.3332036141648652, 0, 0.4999027295504115, 2.330726680437827, 0.6667963858351348, 1, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 2.006444513248598, 0, 0, 0.1976472428651583, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 2.006444513248598, 0, 0, 0.1976472428651583, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6804038010246876, 2.319596198975311, 1, 0, 0.2268012670082293, 1.46971548144499, 0, -6.852343231526461, 1, 0.2268012670082293, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.920713854527061, 1.079206904541144, 1, 0, 0.6402548629729965, 0.5206397598700253, 0, -2.427410189012465, 1, 0.6402548629729965, 0.2144836345446154],
[0.9995857724952979, 2.000414227504704, 0, 1, 0.3331952574984324, 0, 0.499896464567436, 2.330697470829417, 0.6668047425015675, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9996649635561567, 2.000335036443845, 1, 1, 0.3332216545187188, 1.000335148730882, 0.4999162549178661, -2.333133224245706, 0.8889633289598077, 0.5554066379972451, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.999585740390635, 2.000335018594699, 1, 2, 0.3332040479391615, 1.00041443129151, 0.9998325187573158, -0.002713085944434169, 0.7409131045472679, 0.7035312897465541, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.811783041718148, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.921681598271837, 1.078318401728162, 0, 0, 0.6405605327572792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9213687768971651, 2.078631223102834, 1, 0, 0.3071229256323885, 1.085341749226229, 0, -5.060254371064677, 1, 0.3071229256323884, 0.2144836345446154],
[0.835389815691059, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2946296170875722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.811783041718148, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.369009187247032, 1.311081828434476, 0, 0, 0.5108069760455179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319427780780607, 0, 1, 0.2267333735276685, 0, 0.4311408220106117, 2.010133887025907, 0.7732666264723315, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.001433472553542, 1.919309630197571, 0, 1, 0.3428694127909673, 0, 0.5210206754899996, 2.429186154907407, 0.6571305872090327, 1, 0.2144836345446154],
[0, 2.011486599929853, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.811783041718148, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9983427210946134, 2.001657278905387, 0, 3, 0.3327809070315377, 0, 1.49875806993321, 6.987750245445644, 0.2970334752169149, 1, 0.2144836345446154],
[0.9995856836805517, 2.000414316319449, 0, 1, 0.3331952278935171, 0, 0.4998964423729451, 2.330697367350702, 0.6668047721064829, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 4.662360380656392, 0.4444444444444445, 1, 0.2144836345446154],
[0.835389815691059, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2946296170875722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.997928373318713, 2.002071626681288, 0, 3, 0.3326427911062376, 0, 1.498447887687673, 6.986304064033272, 0.2972179732921763, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.073792905081684, 1.004525496646478, 0, 0, 0.5166642917604946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.000538846586848, 1.998994005520203, 0, 1, 0.3335648902408286, 0, 0.5002516251867237, 2.332353357629553, 0.6664351097591714, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9991077782998408, 2.00089222170016, 0, 1, 0.3330359260999468, 0, 0.4997770440380336, 2.330140689284494, 0.6669640739000532, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.389400230162639, 0, 0, 0.3314786468679079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.3110818284344756, 2.688918171565525, 0, 0, 0.1036939428114919, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.500701213283672, 0, 0, 0.399887837334593, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 2.006444513248598, 0, 0, 0.1976472428651583, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9210558416507871, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3153160677442808, 2.171421003546806, 0, -10.12394725666177, 1, 0.09942422257771577, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.689321055794887, 1.812026802803686, 0, 1, 0.2755798452523481, 0, 0.5518682165477545, 2.573008508175755, 0.7244201547476519, 1, 0.2144836345446154],
[0.6891078117918903, 2.146282003899164, 0, 1, 0.2430381205357958, 0, 0.4659219982198488, 2.172296264976482, 0.7569618794642042, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9213687558090681, 2.078327061087404, 1, 2, 0.3071540622949994, 1.085341774067305, 0.9623124470859641, -0.5736070597766268, 0.7749251970780224, 0.6674093584475285, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9987574872232352, 2.001004840623985, 0, 2, 0.3329455397021382, 0, 0.999497831987417, 4.660019092410095, 0.4449616530032716, 1, 0.2144836345446154],
[0.6808179950381245, 2.318767701527643, 1, 2, 0.2269706765896352, 1.46882134034075, 0.8625271081196992, -2.826762207327914, 0.8688380370403357, 0.5380575162417383, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 3, 0.3333333333333333, 0, 1.499999999999999, 6.993540570984589, 0.2962962962962963, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.9996649355425649, 2.000335064457436, 0, 1, 0.3332216451808548, 0, 0.499916247916814, 2.330789707933754, 0.6667783548191453, 1, 0.2144836345446154],
[0.9213687554786013, 2.000000000000001, 1, 0, 0.315389405651275, 1.085341774456585, 0, -5.060254488697688, 1, 0.315389405651275, 0.2144836345446154],
[1.073792905081684, 1.004525496646478, 0, 0, 0.5166642917604946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.9989637369446098, 2.001036263055391, 0, 1, 0.3329879123148698, 0, 0.4997410683967793, 2.329972957880041, 0.6670120876851302, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.919094630678, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3148560587994804, 2.176054492369991, 0, -10.14555025137521, 0.9999999999999999, 0.09913433776274194, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.369009187247032, 1.311081828434476, 0, 0, 0.5108069760455179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9995857515445581, 2.000414248455443, 0, 2, 0.3331952505148525, 0, 0.9997929186638401, 4.661394892839109, 0.4446285739359502, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6805055215316721, 2.319494478468327, 0, 1, 0.2268351738438908, 0, 0.4311284244402891, 2.010076085085218, 0.7731648261561093, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000414115698043, 0, 1, 0.2537174832161173, 0, 0.4998964925075279, 2.330697601096194, 0.7462825167838827, 1, 0.2144836345446154],
[0.6801703242268013, 2.319829675773197, 0, 1, 0.2267234414089339, 0, 0.431066129743642, 2.009785644759646, 0.7732765585910661, 1, 0.2144836345446154],
[1.00022579955737, 1.999694948357348, 0, 1, 0.3334174078607376, 0, 0.5000762745445007, 2.33153580974253, 0.6665825921392624, 1, 0.2144836345446154],
[1.91952011660215, 1.080400637737114, 2, 0, 0.6398569408294008, 1.041927085161427, 0, -4.857839561389437, 0.9999999999999999, 0.4094169047275594, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.921681598271837, 0, 0, 0.3422686443969446, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.0009600832951500131, 2.999039916704849, 0, 1, 0.0003200277650500044, 0, 0.3334400434052026, 1.554617647696765, 0.99967997223495, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.368757154796898, 1.31166882572031, 1, 0, 0.5106491150084983, 0.7305897883312865, 0, -3.406272883627932, 1, 0.5106491150084983, 0.2144836345446154],
[0.6805052055027955, 2.319494794497203, 0, 1, 0.2268350685009319, 0, 0.4311283656994669, 2.010075811214336, 0.7731649314990681, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.999898569015818, 1, 1, 0.333344603823746, 0.9999999999999996, 0.5000253590321413, -2.331061957381448, 0.8888813751015898, 0.5555705827490818, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[0.999107900419258, 2.000892099580743, 0, 1, 0.3330359668064192, 0, 0.4997770745406686, 2.330140831498771, 0.6669640331935808, 1, 0.2144836345446154],
[1.921681598271837, 1.078318401728162, 0, 0, 0.6405605327572792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.000225695398698, 1.999695089074073, 0, 1, 0.3334173690771255, 0, 0.5000762393545879, 2.331535645674474, 0.6665826309228745, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.389400230162639, 0, 0, 0.3314786468679079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.4945088142882878, 2.006192398995383, 1, 0, 0.1977480602886373, 2.022208646450985, 0, -9.428265474633868, 1, 0.1977480602886372, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.999118808766408, 2.000881191233593, 0, 2, 0.3330396029221359, 0, 0.9995595984222082, 4.660307069788519, 0.4448361712702622, 1, 0.2144836345446154],
[0.8347107789115904, 2.000892225157556, 0, 1, 0.2943679978169596, 0, 0.4997770431744555, 2.330140685258181, 0.7056320021830405, 1, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9989948596562921, 2.001005140343709, 0, 2, 0.3329982865520973, 0, 0.9994976822780495, 4.660018394411071, 0.4448912857424381, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.369009187247032, 1.311081828434476, 0, 0, 0.5108069760455179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9213687558088135, 2.000101409064646, 1, 1, 0.3153784580403961, 1.085341774067605, 0.4999746490192481, -2.729192491964199, 0.9005364282040622, 0.5312933442848543, 0.2144836345446154],
[1, 1.999898560307486, 0, 1, 0.3333446047914039, 0, 0.5000253612094452, 2.33129843342632, 0.6666553952085961, 1, 0.2144836345446154],
[0.9989637369447595, 2.001036263055242, 0, 1, 0.3329879123149198, 0, 0.4997410683968167, 2.329972957880216, 0.6670120876850802, 1, 0.2144836345446154],
[0.9998985831843181, 2.000101416815683, 1, 1, 0.3332995277281059, 1.000101427102096, 0.4999746470816854, -2.331771284472416, 0.8889114248162218, 0.5555104802724333, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9932715370354234, 2.006728462964576, 3, 0, 0.3310905123451412, 3.020322125562942, 0, -14.08183021504457, 1, 0.03629444900501666, 0.2144836345446154],
[1.000477866641494, 1.920890871993487, 0, 1, 0.3424688754316481, 0, 0.5205917809178859, 2.427186493846905, 0.6575311245683519, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319494666833894, 0, 1, 0.2267283177292654, 0, 0.4311283894284604, 2.010075921847455, 0.7732716822707346, 1, 0.2144836345446154],
[0.4944973760082493, 2.006850484375987, 0, 1, 0.1976923657200917, 0, 0.4982932250236576, 2.323222590299803, 0.8023076342799083, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6804547702146165, 2.319545229785382, 1, 0, 0.2268182567382056, 1.469605393000035, 0, -6.851829959522333, 1, 0.2268182567382055, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.389400230162639, 0, 0, 0.3314786468679079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.494749495960325, 2.3408535013445, 1, 1, 0.1744777024254005, 2.021224898994525, 0.4271946106091803, -7.431943662134119, 0.9695575313563534, 0.3185129362071544, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.001362656814062125, 2.998637343185937, 0, 2, 0.0004542189380207085, 0, 0.6669696168977463, 3.109652716925626, 0.9990917684388023, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.390381124791599, 0, 1, 0.3313222741778881, 0, 0.7192272551527107, 3.353296659112246, 0.6686777258221119, 1, 0.2144836345446154],
[0.4944973761884364, 2.341105628040089, 0, 1, 0.1743887897745309, 0, 0.4271486036438149, 1.991520726281624, 0.8256112102254691, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000207057849022, 0, 0.5, 0.2537370833482267, 0, 0.2499741204481544, 1.165469435366905, 0.8638651032723648, 1, 0.2144836345446154],
[0.9995855763742933, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3332412264705339, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.666758773529466, 1, 0.2144836345446154],
[0.9980718282992154, 2.001928171700786, 0, 2, 0.3326906094330717, 0, 0.9990368427159163, 4.657869794294742, 0.4453018227388053, 1, 0.2144836345446154],
[0.9998984967549573, 2.000101503245044, 0, 1, 0.333299498918319, 0, 0.4999746254765373, 2.331061885155327, 0.666700501081681, 1, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 1.584061701693088, 0, 0, 0.2378156781098074, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.500701213283672, 0, 0, 0.399887837334593, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -2.331180190328196, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 2.341133115655985, 0, 0, 0.1743170188803865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.680505035627362, 2.318873385949288, 0, 2.5, 0.2268820201985878, 0, 1.07810974723683, 5.026536171516477, 0.5255504757797089, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[1.921681598271837, 1.078318401728162, 0, 0, 0.6405605327572792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 4.662360380656392, 0.4444444444444445, 1, 0.2144836345446154],
[0.9998927471925754, 2.000107252807426, 0, 3, 0.333297582397525, 0, 1.499919564707886, 6.993165552665433, 0.2963439667670119, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.000000000000001, 0, 0, 0.315462711206111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.000000000000001, 0, 0, 0.315462711206111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[0.9991707191796979, 2.000829280820303, 0, 2, 0.3330569063932325, 0, 0.9995855314452601, 4.660427978887747, 0.4448130901097654, 1, 0.2144836345446154],
[0.9998985702192689, 2.000101429780732, 0, 1, 0.3332995234064229, 0, 0.4999746438407518, 2.331061970775913, 0.6667004765935771, 1, 0.2144836345446154],
[0.3110818284344756, 2.688918171565525, 0, 0, 0.1036939428114919, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9987048945200993, 2.001295105479902, 0, 1, 0.3329016315066996, 0, 0.4996764331566205, 2.32967160509713, 0.6670983684933004, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[0.9213687554781582, 2.00485465504169, 1, 0, 0.3148661691946739, 1.085341774457106, 0, -5.060254488700121, 1, 0.3148661691946739, 0.2144836345446154],
[0.9995857408242326, 2.000414259175769, 0, 1, 0.3331952469414108, 0, 0.4998964566529487, 2.330697433929225, 0.6668047530585892, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999999, 0, -9.324720761312784, 1, 0.1111111111111109, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6804038013531791, 2.31959619864682, 1, 0, 0.2268012671177265, 1.469715480735428, 0, -6.852343228218224, 1, 0.2268012671177264, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.921681598271837, 1.078318401728162, 0, 0, 0.6405605327572792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.680403837722954, 2.258386547842698, 1, 0, 0.231525133968339, 1.469715402174405, 0, -6.852342861938426, 1, 0.231525133968339, 0.2144836345446154],
[0.4944973061637331, 2.006850366562577, 0, 1, 0.1976923526287581, 0, 0.498293254276274, 2.323222726686042, 0.8023076473712419, 1, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 2.341133115655985, 0, 0, 0.1743170188803865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -2.331180190328196, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2144836345446154],
[1.364889855409654, 1.316446814099774, 0, 1, 0.5090333753796653, 0, 0.7596205097612166, 3.541624569044711, 0.4909666246203347, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.174347715716582, 1.764458984368317, 0, 0, 0.3996001899963874, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.3142354162994104, 2.685350416026955, 0, 2, 0.1047596014466108, 0, 0.7447817566241696, 3.472440954320201, 0.8014553712020311, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.835389815691059, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2946296170875722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.3110818284344756, 2.688918171565525, 0, 0, 0.1036939428114919, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.000095524814736, 1.999904475185265, 15, 0, 0.3333651749382454, 14.99856726464074, 0, -69.92872578127091, 0.9999999999999996, 6.979164590692477e-08, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[1.000477780967125, 1.999108011394688, 0, 1, 0.3335386450738482, 0, 0.5002230966511633, 2.332220347315638, 0.6664613549261518, 1, 0.2144836345446154],
[0.4947494674289628, 2.006598328211403, 1, 1, 0.1977931530718234, 2.021225015555135, 0.4983558422932395, -7.100164898339219, 0.9608778685979064, 0.3564641747415529, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6891077682122453, 2.14628204747881, 0, 1, 0.2430381051659003, 0, 0.4659219887594355, 2.172296220868626, 0.7569618948340997, 1, 0.2144836345446154],
[0.9213688969948063, 2.078631103005193, 1, 0, 0.3071229656649355, 1.085341607755224, 0, -5.060253711475868, 1, 0.3071229656649355, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.000677178655776, 1.999085142310641, 1, 1, 0.3335854883107517, 0.9993232796048311, 0.5002288190907921, -2.326958238905733, 0.8887207219884773, 0.5558916986099809, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.001433635727109, 1.91931521945936, 1, 1, 0.3428687933742851, 0.9985684166419393, 0.5210191582191923, -2.226506742282058, 0.8824409905300619, 0.568178577278632, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[1.369009187247032, 1.311081828434476, 0, 0, 0.5108069760455179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.811783041718148, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 1.584061701693088, 0, 0, 0.2378156781098074, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9998986032657875, 2.000101396734214, 2, 1, 0.333299534421929, 2.000202814033106, 0.4999746521015436, -6.994604344134681, 0.9629742281244367, 0.259214195186497, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9991077783035709, 2.00089222169643, 0, 1, 0.3330359261011901, 0, 0.4997770440389653, 2.330140689288838, 0.6669640738988099, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.174347715716582, 1.764458984368317, 0, 0, 0.3996001899963874, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 4.662360380656392, 0.4444444444444445, 1, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 2.006444513248598, 0, 0, 0.1976472428651583, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.999898568939745, 0, 2, 0.333344603832199, 0, 1.000050718102323, 4.662596846727245, 0.4444294172396477, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.3110818284344756, 2.688918171565525, 0, 0, 0.1036939428114919, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6804038377228766, 2.319596162277122, 1, 0, 0.226801279240959, 1.469715402174572, 0, -6.852342861939205, 1, 0.2268012792409589, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.811783041718148, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.92168745747799, 1, 0, 0.3422679580050644, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3422679580050645, 0.2144836345446154],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -2.331180190328196, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2144836345446154],
[0.9955377071407152, 2.004462292859286, 1, 1, 0.3318459023802383, 1.004482294168546, 0.498886910251397, -2.357267886618076, 0.8898782970734455, 0.5535701018339219, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000414232129738, 0, 1, 0.2537174721955246, 0, 0.4998964634116563, 2.330697465440755, 0.7462825278044753, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.174347715716582, 1.764458984368317, 0, 0, 0.3996001899963874, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999999, 0, -9.324720761312784, 1, 0.1111111111111109, 0.2144836345446154],
[0.835389815691059, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2946296170875722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.369009187247032, 1.311081828434476, 0, 0, 0.5108069760455179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9987414801476422, 2.001017785810649, 0, 1, 0.3329405434234364, 0, 0.4997456829674714, 2.32999447267161, 0.6670594565765635, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.4948207514414879, 2.340786292133001, 0, 1, 0.174502582282251, 0, 0.4272068763222153, 1.991792414508673, 0.825497417717749, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000334965146146, 0, 1, 0.2537249752636374, 0, 0.4999162727363211, 2.33078982365124, 0.7462750247363625, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.9210559599373801, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3153160954701891, 2.171420724682108, 0, -10.12394595649405, 1, 0.09942424006256534, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 2.5, 0.3333333333333333, 0, 1.25, 5.827950475820491, 0.3628873693012117, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.389400230162639, 0, 0, 0.3314786468679079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.369009187247032, 1.311081828434476, 0, 0, 0.5108069760455179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.174347715716582, 1.764458984368317, 0, 0, 0.3996001899963874, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.920250134638801, 1.07892127672931, 2, 0, 0.6402602156583154, 1.041530977617247, 0, -4.855992765268974, 1, 0.4099331437548325, 0.2144836345446154],
[0.9993299531214892, 2.000670046878512, 1, 2, 0.3331099843738296, 1.000670496142358, 0.9996650887638581, -0.004687571527937856, 0.7410384894463711, 0.703405805310375, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 2.341133115655985, 0, 0, 0.1743170188803865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[1.917507598675579, 1.08249240132442, 0, 1, 0.6391691995585265, 0, 0.9237940134974697, 4.307060608418161, 0.3608308004414735, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.811783041718148, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.811783041718148, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9207430189493261, 2.079256981050673, 1, 0, 0.3069143396497754, 1.086079372223876, 0, -5.063693435304766, 1, 0.3069143396497754, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.921884680527111, 0, 1, 0.3422448554059975, 0, 0.5203225823756149, 2.42593139322889, 0.6577551445940025, 1, 0.2144836345446154],
[0.9987049055237569, 2.001295094476244, 0, 1, 0.3329016351745855, 0, 0.4996764359039756, 2.32967161790629, 0.6670983648254145, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.835389815691059, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2946296170875722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9987575056089841, 2.001242494391017, 0, 1, 0.3329191685363279, 0, 0.4996895692564745, 2.329732850328646, 0.6670808314636721, 1, 0.2144836345446154],
[0.0009600450999509969, 2.999039954900048, 0, 1, 0.0003200150333169991, 0, 0.333440039158574, 1.554617627897452, 0.999679984966683, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[0.31375735500382, 2.68624264499618, 0, 1, 0.1045857850012733, 0, 0.37226718958645, 1.735643795746167, 0.8954142149987266, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.002593033703353762, 2.997406966296645, 0, 1, 0.0008643445677845875, 0, 0.3336216974352066, 1.555464584249242, 0.9991356554322154, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999999, 0, -9.324720761312784, 1, 0.1111111111111109, 0.2144836345446154],
[1, 1.500701213283672, 0, 0, 0.399887837334593, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9996649632058108, 2.000335036794191, 0, 1, 0.3332216544019368, 0, 0.4999162548303089, 2.330789740166958, 0.6667783455980631, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.073697335115497, 1.926302664884503, 1, 0, 0.3578991117051657, 0.9313611641705624, 0, -4.342341391910846, 1, 0.3578991117051658, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.25770830355941, 0, 1, 0.2314967571907643, 0, 0.4429270151610999, 2.065085367009506, 0.7685032428092357, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 4.662360380656392, 0.4444444444444445, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.811783041718148, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9217830754485412, 2.078216924551458, 0, 1, 0.3072610251495138, 0, 0.4811817227481343, 2.243442600036891, 0.6927389748504862, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.000225799772659, 1.999694948066497, 0, 1, 0.3334174079409004, 0, 0.5000762746172356, 2.331535810081646, 0.6665825920590995, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[1.173707597995589, 1.765178354258635, 0, 1, 0.3993716044323924, 0, 0.566514991296726, 2.641297050469757, 0.6006283955676076, 1, 0.2144836345446154],
[0.9991713063786094, 2.000828693621392, 0, 1, 0.333057102126203, 0, 0.4997929124007384, 2.330214673310075, 0.666942897873797, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.4944463454030179, 2.341156600680323, 0, 1, 0.1743707969008739, 0, 0.4271393035858462, 1.991477366059813, 0.8256292030991261, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6886661763084019, 2.146723639382653, 1, 0, 0.2428823622407477, 1.452082350494552, 0, -6.770131220396213, 1, 0.2428823622407478, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319494702204749, 0, 1, 0.2267283150557047, 0, 0.4311283828540199, 2.010075891195044, 0.7732716849442953, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9210670684081615, 2.078285960801462, 1, 2, 0.3070885819169066, 1.0856972682003, 0.9623314778245089, -0.5751757733764509, 0.7750088015664238, 0.667315050818327, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.001433075643954, 1.919310286964155, 0, 1, 0.3428692463927107, 0, 0.5210204972025329, 2.429185323666985, 0.6571307536072892, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.389400230162639, 0, 0, 0.3314786468679079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.004525496646478, 0, 0, 0.3149748354695882, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.004173702810329268, 2.99582629718967, 0, 2, 0.001391234270109756, 0, 0.6675954483329569, 3.112570568614121, 0.9972194669925748, 1, 0.2144836345446154],
[0.6816464210583376, 2.318353578941662, 1, 1, 0.2272154736861126, 1.46703623624603, 0.4313405897544343, -4.828786348620725, 0.9483731285175954, 0.4028040758898207, 0.2144836345446154],
[0.6804038377228777, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2538437783691993, 1.46971540217457, 0, -6.852342861939194, 1, 0.2538437783691994, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 2.341133115655985, 0, 0, 0.1743170188803865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9987577909444627, 2.001242209055539, 1, 1, 0.3329192636481541, 1.001243754058091, 0.4996896405018049, -2.338426027800067, 0.8891647638919709, 0.5550032911882792, 0.2144836345446154],
[0.995151187005489, 2.004848812994511, 1, 1, 0.331717062335163, 1.004872438537808, 0.4987907285170126, -2.359535314175795, 0.8899637905557294, 0.5533979152260557, 0.2144836345446154],
[0.9905408949762129, 2.009459105023788, 1, 3, 0.3301802983254042, 1.009549434124084, 1.492939066288929, 2.253736669425437, 0.5981978624805097, 0.7987056107210175, 0.2144836345446154],
[0.680403801194141, 2.319596198805858, 1, 0, 0.2268012670647138, 1.46971548107896, 0, -6.852343229819895, 1, 0.2268012670647137, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[1.000477840415229, 1.920890915390107, 0, 1, 0.3424688644413965, 0, 0.5205917691567162, 2.427186439012093, 0.6575311355586035, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9267033068310644, 2.089641953512557, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[0.6442193013588884, 2.372125958984735, 0, 0, 0.2135761147202024, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[1.005448420114541, 2.010896840229083, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[0.692671687188755, 1.396970266323805, 0, 0, 0.3314786468679079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[0.3127767329257861, 2.703568527417837, 0, 0, 0.1036939428114918, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[1.005448420114541, 2.010896840229083, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9945811043057579, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2133213701008963],
[1.005448420114541, 2.010896840229083, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.989162208611516, 0, -9.324720761312784, 1, 0.1111111111111109, 0.2133213701008963],
[1.004551654077409, 2.011793606266215, 0, 2, 0.3330360311481616, 0, 0.9941377653107749, 4.660282112573015, 0.4448409357465961, 1, 0.2133213701008963],
[0.8399413703663526, 2.010896840229083, 0, 0, 0.2946296170875722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[0.692671687188755, 1.821654396885829, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[0.9260337647324037, 2.090311495611218, 2, 0, 0.3070052281173244, 2.159748462927743, 0, -10.12438867191895, 1, 0.0942522100913703, 0.2133213701008963],
[0.9996080616592606, 2.000391938340741, 0, 0.75, 0.3332026872197534, 0, 0.3749265259597578, 1.748042580291916, 0.737896381579624, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078216922669485, 0, 1, 0.3072375921511599, 0, 0.4811817231838786, 2.243442602068488, 0.6927624078488401, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 5, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 2.499999999999999, 6.99354057098459, 0.3511659807956106, 0.9122085048010974, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[0, 2.011486599929853, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.83513778300715, 2.00046515727515, 1, 0, 0.2945185911409753, 1.19740720674763, 0, -5.582743920252591, 1, 0.2945185911409753, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 3, 1, 0.3333333333333333, 2.999999999999999, 0.4999999999999998, -11.65590095164098, 0.9876543209876545, 0.1111111111111109, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.921681598271837, 0, 0, 0.3422686443969446, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.921681598271837, 0, 0, 0.3422686443969446, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.4944973642445066, 1.585014658653271, 0, 1, 0.2377949051505986, 0, 0.6309089916238776, 2.941525086347044, 0.7622050948494015, 1, 0.2144836345446154],
[0.6804038376894205, 2.319596162310578, 1, 0, 0.2268012792298069, 1.46971540224684, 0, -6.852342862276141, 1, 0.2268012792298069, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.921783075372111, 1, 0, 0.3422567569882453, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3422567569882453, 0.2144836345446154],
[0.4947494979896862, 2.340853499313407, 1, 1, 0.1744777031411789, 2.021224890703874, 0.4271946109798451, -7.431943621751942, 0.9695575311065787, 0.3185129373889365, 0.2144836345446154],
[0.7416134650515295, 2.258386534948471, 1, 0, 0.2472044883505098, 1.348411331677368, 0, -6.286779569640689, 1, 0.2472044883505098, 0.2144836345446154],
[1.174347715716582, 1.764458984368317, 0, 0, 0.3996001899963874, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.50134770201068, 1, 0, 0.399784483858906, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.399784483858906, 0.2144836345446154],
[1.921681598271837, 1.078318401728162, 0, 0, 0.6405605327572792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.001193534388897, 1.998806465611104, 0, 1, 0.3337311781296323, 0, 0.5002985617690933, 2.332572192891596, 0.6662688218703677, 1, 0.2144836345446154],
[0.9996649814412801, 2.000335018558721, 0, 1, 0.3332216604804265, 0, 0.4999162593876493, 2.330789761414921, 0.6667783395195734, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889067342256993, 1.390605889717268, 0, 1, 0.3312827853477812, 0, 0.7191110057813115, 3.352754662648758, 0.6687172146522189, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.6804038013530083, 2.319596198646991, 1, 0, 0.2268012671176695, 1.469715480735797, 0, -6.852343228219945, 1, 0.2268012671176695, 0.2144836345446154],
[1, 1.921681598271837, 0, 0, 0.3422686443969446, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.921681598271837, 0, 0, 0.3422686443969446, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 1.584061701693088, 0, 0, 0.2378156781098074, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.921681598271837, 0, 0, 0.3422686443969446, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.811783041718148, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6810290128999559, 2.039191639792367, 1, 1, 0.2503580039457134, 1.468366223843831, 0.4903903980803987, -4.559675743279148, 0.9373208698603183, 0.4380368777517449, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.3110818284344756, 2.688918171565525, 0, 0, 0.1036939428114919, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.389400230162639, 0, 0, 0.3314786468679079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.005448420114541, 2.010896840229083, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4972905521528789, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2133213701008963],
[0.692671687188755, 1.821654396885829, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[1.005448420114541, 2.010896840229083, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9945811043057579, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2133213701008963],
[1.005448420114541, 2.010896840229083, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4972905521528789, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2133213701008963],
[0.9263365691459893, 2.090008691197633, 1, 0, 0.3071056159666752, 1.079521238076483, 0, -5.060539586661634, 1, 0.3071056159666752, 0.2133213701008963],
[1.005448420114541, 2.010896840229083, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[0.683796437251065, 2.271022116371324, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[0.683796437251065, 2.332548823092556, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.835389815691059, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2946296170875722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.8340316460053606, 2.001784576621545, 0, 1, 0.2941063808545291, 0, 0.4995542535789348, 2.329101959874804, 0.705893619145471, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.9999999999999996, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.000541513375393, 1.998215768619202, 0, 4, 0.3336520495949882, 0, 2.001785824542893, 9.333046918908376, 0.1971533971997642, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.3119737867299369, 2.688026213270063, 0, 1, 0.1039912622433123, 0, 0.3720201815976603, 1.734492155485528, 0.8960087377566877, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.004525496646478, 0, 0, 0.3149748354695882, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.3110818284344756, 2.688918171565525, 0, 0, 0.1036939428114919, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.003281655751760178, 2.996718344248239, 0, 2, 0.001093885250586726, 0, 0.667396722097259, 3.111644035286206, 0.997813426083768, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.835389815691059, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2946296170875722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9992506432939676, 2.000749356706033, 0, 2, 0.3330835477646558, 0, 0.9996254619782724, 4.660614149422842, 0.4447775542621782, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9213687388109021, 2.078631261189097, 1, 0, 0.3071229129369675, 1.085341794090581, 0, -5.060254580238453, 1, 0.3071229129369675, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 2.341133115655985, 0, 0, 0.1743170188803865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.174347715716582, 1.764458984368317, 0, 0, 0.3996001899963874, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6894164777941293, 1.388901923934034, 0, 1, 0.3317184110100097, 0, 0.7199932426960155, 3.356867969086227, 0.6682815889899903, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9989637369449025, 2.001036263055099, 0, 1, 0.3329879123149674, 0, 0.4997410683968524, 2.329972957880382, 0.6670120876850326, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889675796818497, 1.812380259479964, 1, 1, 0.2754385331360866, 1.451447106497781, 0.5517605892964953, -4.194662772810011, 0.924133614463841, 0.475010680736014, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6407283441606073, 2.359271655839394, 0, 0, 0.2135761147202024, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.999898568959697, 0, 2, 0.333344603829982, 0, 1.000050718092346, 4.662596846680731, 0.4444294172426035, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.369009187247032, 1.311081828434476, 0, 0, 0.5108069760455179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.389400230162639, 0, 0, 0.3314786468679079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154]
],
"RESOLVED": [
[1.005448420114541, 2.010896840229083, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[1.005448420114541, 2.010896840229083, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.989162208611516, 0, -9.324720761312784, 1, 0.1111111111111109, 0.2133213701008963],
[1.005448420114541, 2.010246890453709, 1, 0, 0.3334051741205525, 0.9945811043057579, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3334051741205525, 0.2133213701008963],
[1.005448420114541, 2.010896840229083, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4972905521528789, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2133213701008963],
[0.683796437251065, 2.271022116371324, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[1.005448420114541, 2.010896840229083, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[0.9988442977215519, 2.000577851139225, 0, 2, 0.3330122430751961, 0, 0.9997111578842602, 4.661013694619704, 0.4448726678875813, 1, 0.2144836345446154],
[0.9207431616292024, 2.005512875309305, 1, 0, 0.3146488721446596, 1.086079203923228, 0, -5.063692650626494, 1, 0.3146488721446596, 0.2144836345446154],
[0.6804037917697373, 2.319596208230262, 1, 0, 0.2268012639232458, 1.469715501436271, 0, -6.852343324733019, 1, 0.2268012639232458, 0.2144836345446154],
[1, 1.921681598271837, 0, 0, 0.3422686443969446, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 1.584061701693088, 0, 0, 0.2378156781098074, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999999, 0, -9.324720761312784, 1, 0.1111111111111109, 0.2144836345446154],
[1, 1.921681598271837, 0, 0, 0.3422686443969446, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.369009187247032, 1.311081828434476, 0, 0, 0.5108069760455179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.835389815691059, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2946296170875722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 3, 0.3333333333333333, 0, 1.499999999999999, 6.993540570984589, 0.2962962962962963, 1, 0.2144836345446154],
[0.9213687384834687, 2.004854672922699, 1, 0, 0.3148661632915834, 1.085341794476286, 0, -5.060254582036752, 1, 0.3148661632915835, 0.2144836345446154],
[0.3119737660700486, 2.688026233929952, 0, 1, 0.1039912553566829, 0, 0.3720201787383521, 1.734492142154403, 0.8960087446433171, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.835389815691059, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2946296170875722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.99979709252569, 0, 1, 0.3333558801332282, 0, 0.5000507320155301, 2.331416721267435, 0.6666441198667719, 1, 0.2144836345446154],
[0.9213687241353598, 2.07863127586464, 1, 0, 0.3071229080451199, 1.085341811377883, 0, -5.060254660838085, 1, 0.3071229080451199, 0.2144836345446154],
[1.368757154536166, 1.31166882632757, 1, 0, 0.5106491148452083, 0.7305897884704556, 0, -3.406272884276788, 1, 0.5106491148452083, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.004525496646478, 0, 0, 0.3149748354695882, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9210559396607281, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3153160907174224, 2.171420772485005, 0, -10.12394617936839, 1, 0.09942423706531756, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6796095527032984, 2.318002537584113, 0, 1, 0.2267169774585935, 0, 0.4314059125415057, 2.011369834614434, 0.7732830225414065, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.3110818284344756, 2.688918171565525, 0, 0, 0.1036939428114919, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.000956260025405, 1.920200686843483, 0, 2, 0.3426574738130054, 0, 1.041557798465167, 4.856117813727693, 0.4320991967338996, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.921681598271837, 0, 0, 0.3422686443969446, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.368531251852801, 1.311974105345999, 0, 1, 0.5105497171186231, 0, 0.7622101655247807, 3.55369847747629, 0.4894502828813769, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[1.173707598064067, 1.765178354181679, 0, 1, 0.3993716044568453, 0, 0.5665149913214245, 2.641297050584911, 0.6006283955431547, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.001386383213657, 1.998326944362275, 2, 2, 0.3338273607707964, 1.997231072367475, 1.000837228183529, -4.645547182653154, 0.8884492652628824, 0.4082856779252251, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9983245033118311, 2.00167549668817, 0, 1, 0.3327748344372769, 0, 0.4995814764453723, 2.329228882688729, 0.667225165562723, 1, 0.2144836345446154],
[0.9213687554782538, 2.00485465504159, 1, 0, 0.3148661691947071, 1.085341774456994, 0, -5.060254488699596, 1, 0.314866169194707, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.318666145822644, 0, 1, 0.2267909600723986, 0, 0.4312824430552973, 2.010794175373716, 0.7732090399276014, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.001193576356176, 1.998400752676451, 0, 5, 0.3337763265738212, 0, 2.502000658928655, 11.66522874456515, 0.131250299684745, 1, 0.2144836345446154],
[0.9991714298692922, 2.000670078362755, 0, 2, 0.3330747398245558, 0, 0.9996650730322796, 4.660798830431681, 0.4447893026600839, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6801024684200345, 2.319249719473056, 0, 1, 0.2267497865590022, 0, 0.4311739230164506, 2.010288215844089, 0.7732502134409978, 1, 0.2144836345446154],
[0.9998984967223259, 2.000101503277675, 0, 1, 0.3332994989074418, 0, 0.4999746254683802, 2.331061885117296, 0.6667005010925582, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -2.331180190328196, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2144836345446154],
[0.6892196250940126, 1.390292452865306, 0, 1, 0.3314333359248207, 0, 0.7192731269878239, 3.353510530138866, 0.6685666640751793, 1, 0.2144836345446154],
[1.001301635342169, 1.998698364657832, 1, 0, 0.3337672117807229, 0.99870005670996, 0, -4.656299576563812, 1, 0.3337672117807229, 0.2144836345446154],
[0.9210557623147538, 2.000000000000001, 2, 0, 0.315316049148228, 2.171421190584264, 0, -10.12394812869781, 1, 0.09942421085044773, 0.2144836345446154],
[1.369009187247032, 1.311081828434476, 0, 0, 0.5108069760455179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.500701213283672, 0, 0, 0.399887837334593, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6886661253167065, 2.146723690374349, 1, 0, 0.2428823442567319, 1.45208245801275, 0, -6.7701317216848, 1, 0.2428823442567319, 0.2144836345446154],
[1.000955667032239, 1.920201694963363, 0, 3, 0.3426572221184386, 0, 1.562335877459601, 7.284172896345689, 0.2840375038156182, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.002546324743734, 1.997453675256267, 1, 2, 0.3341821082479111, 0.9974601425581162, 1.001274785380645, 0.01778523956211435, 0.7396083216587284, 0.7048339633635696, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 3, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 1.499999999999999, 2.331180190328196, 0.5925925925925928, 0.802469135802469, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6805563861975327, 2.319443613802466, 0, 1, 0.226852128732511, 0, 0.4311378789504663, 2.010120165418887, 0.7731478712674891, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.174347715716582, 1.764458984368317, 0, 0, 0.3996001899963874, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.500701213283672, 0, 0, 0.399887837334593, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.389400230162639, 0, 0, 0.3314786468679079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9995856825162783, 2.000335065398648, 0, 1, 0.3332040298768003, 0, 0.49991624768159, 2.330789706837054, 0.6667959701231997, 1, 0.2144836345446154],
[1.369009187247032, 1.311081828434476, 0, 0, 0.5108069760455179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6804038013197179, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2538437682354858, 1.469715480807706, 0, -6.852343228555211, 1, 0.2538437682354858, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6804036623938542, 2.319596337606145, 1, 0, 0.2268012207979515, 1.469715780896468, 0, -6.852344627677166, 1, 0.2268012207979515, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9995856825154052, 2.000414317484596, 0, 1, 0.3331952275051349, 0, 0.4998964420817791, 2.330697365993181, 0.6668047724948651, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9215656632486041, 2.078434336751395, 1, 2, 0.3071885544162014, 1.085109873207415, 0.9622627785903554, -0.5727574268213259, 0.7748811539996945, 0.6674590283019781, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6804038010243366, 2.319596198975662, 1, 0, 0.2268012670081123, 1.469715481445748, 0, -6.852343231529995, 1, 0.2268012670081123, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9213687555116211, 2.078631244488378, 1, 0, 0.3071229185038738, 1.085341774417688, 0, -5.06025448851634, 1, 0.3071229185038737, 0.2144836345446154],
[0, 2.011486599929853, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9991079084858943, 2.000892091514107, 0, 1, 0.333035969495298, 0, 0.4997770765555298, 2.33014084089278, 0.666964030504702, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6805052088115772, 2.319494791188422, 0, 1, 0.2268350696038592, 0, 0.4311283663144757, 2.010075814081728, 0.7731649303961409, 1, 0.2144836345446154],
[0.9213687241352796, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3153893983060981, 1.085341811377977, 0, -5.060254660838527, 1, 0.3153893983060981, 0.2144836345446154],
[0.742289012799495, 2.257710987200505, 0, 1, 0.247429670933165, 0, 0.4429264886733666, 2.065082912333958, 0.752570329066835, 1, 0.2144836345446154],
[1.369009187247032, 1.311081828434476, 0, 0, 0.5108069760455179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9210557182687876, 2.078944281731212, 1, 2, 0.3070185727562627, 1.085710647212088, 0.9620267448122891, -0.5766589262737951, 0.775098177365758, 0.6672142009257283, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9989936982401098, 2.001006301759892, 0, 1, 0.3329978994133698, 0, 0.4997485510767741, 2.33000784483079, 0.6670021005866302, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.811783041718148, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.835200114310215, 2.000189701380845, 0, 1, 0.2945627122197498, 0, 0.4999525791526889, 2.330959097248477, 0.7054372877802502, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.494446301732919, 2.341156595272369, 0, 1, 0.1743707845182093, 0, 0.4271393045725165, 1.991477370660026, 0.8256292154817907, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.811783041718148, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[1.001193984069432, 1.998806015930569, 1, 0, 0.3337313280231439, 0.9988074398284146, 0, -4.656800235360846, 1, 0.3337313280231439, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[0.999610842494596, 2.000389157505405, 0, 1, 0.3332036141648652, 0, 0.4999027295504115, 2.330726680437827, 0.6667963858351348, 1, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 2.006444513248598, 0, 0, 0.1976472428651583, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 2.006444513248598, 0, 0, 0.1976472428651583, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6804038010246876, 2.319596198975311, 1, 0, 0.2268012670082293, 1.46971548144499, 0, -6.852343231526461, 1, 0.2268012670082293, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.920713854527061, 1.079206904541144, 1, 0, 0.6402548629729965, 0.5206397598700253, 0, -2.427410189012465, 1, 0.6402548629729965, 0.2144836345446154],
[0.9995857724952979, 2.000414227504704, 0, 1, 0.3331952574984324, 0, 0.499896464567436, 2.330697470829417, 0.6668047425015675, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9996649635561567, 2.000335036443845, 1, 1, 0.3332216545187188, 1.000335148730882, 0.4999162549178661, -2.333133224245706, 0.8889633289598077, 0.5554066379972451, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.999585740390635, 2.000335018594699, 1, 2, 0.3332040479391615, 1.00041443129151, 0.9998325187573158, -0.002713085944434169, 0.7409131045472679, 0.7035312897465541, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.811783041718148, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.921681598271837, 1.078318401728162, 0, 0, 0.6405605327572792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9213687768971651, 2.078631223102834, 1, 0, 0.3071229256323885, 1.085341749226229, 0, -5.060254371064677, 1, 0.3071229256323884, 0.2144836345446154],
[0.835389815691059, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2946296170875722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.811783041718148, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.369009187247032, 1.311081828434476, 0, 0, 0.5108069760455179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319427780780607, 0, 1, 0.2267333735276685, 0, 0.4311408220106117, 2.010133887025907, 0.7732666264723315, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.001433472553542, 1.919309630197571, 0, 1, 0.3428694127909673, 0, 0.5210206754899996, 2.429186154907407, 0.6571305872090327, 1, 0.2144836345446154],
[0, 2.011486599929853, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.811783041718148, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9983427210946134, 2.001657278905387, 0, 3, 0.3327809070315377, 0, 1.49875806993321, 6.987750245445644, 0.2970334752169149, 1, 0.2144836345446154],
[0.9995856836805517, 2.000414316319449, 0, 1, 0.3331952278935171, 0, 0.4998964423729451, 2.330697367350702, 0.6668047721064829, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 4.662360380656392, 0.4444444444444445, 1, 0.2144836345446154],
[0.835389815691059, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2946296170875722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.997928373318713, 2.002071626681288, 0, 3, 0.3326427911062376, 0, 1.498447887687673, 6.986304064033272, 0.2972179732921763, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.073792905081684, 1.004525496646478, 0, 0, 0.5166642917604946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.000538846586848, 1.998994005520203, 0, 1, 0.3335648902408286, 0, 0.5002516251867237, 2.332353357629553, 0.6664351097591714, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9991077782998408, 2.00089222170016, 0, 1, 0.3330359260999468, 0, 0.4997770440380336, 2.330140689284494, 0.6669640739000532, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.389400230162639, 0, 0, 0.3314786468679079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.3110818284344756, 2.688918171565525, 0, 0, 0.1036939428114919, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.500701213283672, 0, 0, 0.399887837334593, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 2.006444513248598, 0, 0, 0.1976472428651583, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9210558416507871, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3153160677442808, 2.171421003546806, 0, -10.12394725666177, 1, 0.09942422257771577, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.689321055794887, 1.812026802803686, 0, 1, 0.2755798452523481, 0, 0.5518682165477545, 2.573008508175755, 0.7244201547476519, 1, 0.2144836345446154],
[0.6891078117918903, 2.146282003899164, 0, 1, 0.2430381205357958, 0, 0.4659219982198488, 2.172296264976482, 0.7569618794642042, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9213687558090681, 2.078327061087404, 1, 2, 0.3071540622949994, 1.085341774067305, 0.9623124470859641, -0.5736070597766268, 0.7749251970780224, 0.6674093584475285, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9987574872232352, 2.001004840623985, 0, 2, 0.3329455397021382, 0, 0.999497831987417, 4.660019092410095, 0.4449616530032716, 1, 0.2144836345446154],
[0.6808179950381245, 2.318767701527643, 1, 2, 0.2269706765896352, 1.46882134034075, 0.8625271081196992, -2.826762207327914, 0.8688380370403357, 0.5380575162417383, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 3, 0.3333333333333333, 0, 1.499999999999999, 6.993540570984589, 0.2962962962962963, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.9996649355425649, 2.000335064457436, 0, 1, 0.3332216451808548, 0, 0.499916247916814, 2.330789707933754, 0.6667783548191453, 1, 0.2144836345446154],
[0.9213687554786013, 2.000000000000001, 1, 0, 0.315389405651275, 1.085341774456585, 0, -5.060254488697688, 1, 0.315389405651275, 0.2144836345446154],
[1.073792905081684, 1.004525496646478, 0, 0, 0.5166642917604946, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.9989637369446098, 2.001036263055391, 0, 1, 0.3329879123148698, 0, 0.4997410683967793, 2.329972957880041, 0.6670120876851302, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.919094630678, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3148560587994804, 2.176054492369991, 0, -10.14555025137521, 0.9999999999999999, 0.09913433776274194, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.369009187247032, 1.311081828434476, 0, 0, 0.5108069760455179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9995857515445581, 2.000414248455443, 0, 2, 0.3331952505148525, 0, 0.9997929186638401, 4.661394892839109, 0.4446285739359502, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6805055215316721, 2.319494478468327, 0, 1, 0.2268351738438908, 0, 0.4311284244402891, 2.010076085085218, 0.7731648261561093, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000414115698043, 0, 1, 0.2537174832161173, 0, 0.4998964925075279, 2.330697601096194, 0.7462825167838827, 1, 0.2144836345446154],
[0.6801703242268013, 2.319829675773197, 0, 1, 0.2267234414089339, 0, 0.431066129743642, 2.009785644759646, 0.7732765585910661, 1, 0.2144836345446154],
[1.00022579955737, 1.999694948357348, 0, 1, 0.3334174078607376, 0, 0.5000762745445007, 2.33153580974253, 0.6665825921392624, 1, 0.2144836345446154],
[1.91952011660215, 1.080400637737114, 2, 0, 0.6398569408294008, 1.041927085161427, 0, -4.857839561389437, 0.9999999999999999, 0.4094169047275594, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.921681598271837, 0, 0, 0.3422686443969446, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.0009600832951500131, 2.999039916704849, 0, 1, 0.0003200277650500044, 0, 0.3334400434052026, 1.554617647696765, 0.99967997223495, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.368757154796898, 1.31166882572031, 1, 0, 0.5106491150084983, 0.7305897883312865, 0, -3.406272883627932, 1, 0.5106491150084983, 0.2144836345446154],
[0.6805052055027955, 2.319494794497203, 0, 1, 0.2268350685009319, 0, 0.4311283656994669, 2.010075811214336, 0.7731649314990681, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.999898569015818, 1, 1, 0.333344603823746, 0.9999999999999996, 0.5000253590321413, -2.331061957381448, 0.8888813751015898, 0.5555705827490818, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[0.999107900419258, 2.000892099580743, 0, 1, 0.3330359668064192, 0, 0.4997770745406686, 2.330140831498771, 0.6669640331935808, 1, 0.2144836345446154],
[1.921681598271837, 1.078318401728162, 0, 0, 0.6405605327572792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.000225695398698, 1.999695089074073, 0, 1, 0.3334173690771255, 0, 0.5000762393545879, 2.331535645674474, 0.6665826309228745, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.389400230162639, 0, 0, 0.3314786468679079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.4945088142882878, 2.006192398995383, 1, 0, 0.1977480602886373, 2.022208646450985, 0, -9.428265474633868, 1, 0.1977480602886372, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.999118808766408, 2.000881191233593, 0, 2, 0.3330396029221359, 0, 0.9995595984222082, 4.660307069788519, 0.4448361712702622, 1, 0.2144836345446154],
[0.8347107789115904, 2.000892225157556, 0, 1, 0.2943679978169596, 0, 0.4997770431744555, 2.330140685258181, 0.7056320021830405, 1, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9989948596562921, 2.001005140343709, 0, 2, 0.3329982865520973, 0, 0.9994976822780495, 4.660018394411071, 0.4448912857424381, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.369009187247032, 1.311081828434476, 0, 0, 0.5108069760455179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9213687558088135, 2.000101409064646, 1, 1, 0.3153784580403961, 1.085341774067605, 0.4999746490192481, -2.729192491964199, 0.9005364282040622, 0.5312933442848543, 0.2144836345446154],
[1, 1.999898560307486, 0, 1, 0.3333446047914039, 0, 0.5000253612094452, 2.33129843342632, 0.6666553952085961, 1, 0.2144836345446154],
[0.9989637369447595, 2.001036263055242, 0, 1, 0.3329879123149198, 0, 0.4997410683968167, 2.329972957880216, 0.6670120876850802, 1, 0.2144836345446154],
[0.9998985831843181, 2.000101416815683, 1, 1, 0.3332995277281059, 1.000101427102096, 0.4999746470816854, -2.331771284472416, 0.8889114248162218, 0.5555104802724333, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9932715370354234, 2.006728462964576, 3, 0, 0.3310905123451412, 3.020322125562942, 0, -14.08183021504457, 1, 0.03629444900501666, 0.2144836345446154],
[1.000477866641494, 1.920890871993487, 0, 1, 0.3424688754316481, 0, 0.5205917809178859, 2.427186493846905, 0.6575311245683519, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319494666833894, 0, 1, 0.2267283177292654, 0, 0.4311283894284604, 2.010075921847455, 0.7732716822707346, 1, 0.2144836345446154],
[0.4944973760082493, 2.006850484375987, 0, 1, 0.1976923657200917, 0, 0.4982932250236576, 2.323222590299803, 0.8023076342799083, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6804547702146165, 2.319545229785382, 1, 0, 0.2268182567382056, 1.469605393000035, 0, -6.851829959522333, 1, 0.2268182567382055, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.389400230162639, 0, 0, 0.3314786468679079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.494749495960325, 2.3408535013445, 1, 1, 0.1744777024254005, 2.021224898994525, 0.4271946106091803, -7.431943662134119, 0.9695575313563534, 0.3185129362071544, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.001362656814062125, 2.998637343185937, 0, 2, 0.0004542189380207085, 0, 0.6669696168977463, 3.109652716925626, 0.9990917684388023, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.390381124791599, 0, 1, 0.3313222741778881, 0, 0.7192272551527107, 3.353296659112246, 0.6686777258221119, 1, 0.2144836345446154],
[0.4944973761884364, 2.341105628040089, 0, 1, 0.1743887897745309, 0, 0.4271486036438149, 1.991520726281624, 0.8256112102254691, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9995855763742933, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3332412264705339, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.666758773529466, 1, 0.2144836345446154],
[0.9980718282992154, 2.001928171700786, 0, 2, 0.3326906094330717, 0, 0.9990368427159163, 4.657869794294742, 0.4453018227388053, 1, 0.2144836345446154],
[0.9998984967549573, 2.000101503245044, 0, 1, 0.333299498918319, 0, 0.4999746254765373, 2.331061885155327, 0.666700501081681, 1, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 1.584061701693088, 0, 0, 0.2378156781098074, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.500701213283672, 0, 0, 0.399887837334593, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -2.331180190328196, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 2.341133115655985, 0, 0, 0.1743170188803865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.680505035627362, 2.319080773589917, 0, 2, 0.2268663338572518, 0, 0.8624106683891039, 4.020869332152758, 0.5977356657233264, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[1.921681598271837, 1.078318401728162, 0, 0, 0.6405605327572792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 4.662360380656392, 0.4444444444444445, 1, 0.2144836345446154],
[0.9998927471925754, 2.000107252807426, 0, 3, 0.333297582397525, 0, 1.499919564707886, 6.993165552665433, 0.2963439667670119, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.000000000000001, 0, 0, 0.315462711206111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.000000000000001, 0, 0, 0.315462711206111, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[0.9991707191796979, 2.000829280820303, 0, 2, 0.3330569063932325, 0, 0.9995855314452601, 4.660427978887747, 0.4448130901097654, 1, 0.2144836345446154],
[0.9998985702192689, 2.000101429780732, 0, 1, 0.3332995234064229, 0, 0.4999746438407518, 2.331061970775913, 0.6667004765935771, 1, 0.2144836345446154],
[0.3110818284344756, 2.688918171565525, 0, 0, 0.1036939428114919, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9987048945200993, 2.001295105479902, 0, 1, 0.3329016315066996, 0, 0.4996764331566205, 2.32967160509713, 0.6670983684933004, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[0.9213687554781582, 2.00485465504169, 1, 0, 0.3148661691946739, 1.085341774457106, 0, -5.060254488700121, 1, 0.3148661691946739, 0.2144836345446154],
[0.9995857408242326, 2.000414259175769, 0, 1, 0.3331952469414108, 0, 0.4998964566529487, 2.330697433929225, 0.6668047530585892, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999999, 0, -9.324720761312784, 1, 0.1111111111111109, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6804038013531791, 2.31959619864682, 1, 0, 0.2268012671177265, 1.469715480735428, 0, -6.852343228218224, 1, 0.2268012671177264, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.921681598271837, 1.078318401728162, 0, 0, 0.6405605327572792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.680403837722954, 2.258386547842698, 1, 0, 0.231525133968339, 1.469715402174405, 0, -6.852342861938426, 1, 0.231525133968339, 0.2144836345446154],
[0.4944973061637331, 2.006850366562577, 0, 1, 0.1976923526287581, 0, 0.498293254276274, 2.323222726686042, 0.8023076473712419, 1, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 2.341133115655985, 0, 0, 0.1743170188803865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -2.331180190328196, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2144836345446154],
[1.364889855409654, 1.316446814099774, 0, 1, 0.5090333753796653, 0, 0.7596205097612166, 3.541624569044711, 0.4909666246203347, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.174347715716582, 1.764458984368317, 0, 0, 0.3996001899963874, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.3142354162994104, 2.685350416026955, 0, 2, 0.1047596014466108, 0, 0.7447817566241696, 3.472440954320201, 0.8014553712020311, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.835389815691059, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2946296170875722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.3110818284344756, 2.688918171565525, 0, 0, 0.1036939428114919, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.000095524814736, 1.999904475185265, 15, 0, 0.3333651749382454, 14.99856726464074, 0, -69.92872578127091, 0.9999999999999996, 6.979164590692477e-08, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[1.000477780967125, 1.999108011394688, 0, 1, 0.3335386450738482, 0, 0.5002230966511633, 2.332220347315638, 0.6664613549261518, 1, 0.2144836345446154],
[0.4947494674289628, 2.006598328211403, 1, 1, 0.1977931530718234, 2.021225015555135, 0.4983558422932395, -7.100164898339219, 0.9608778685979064, 0.3564641747415529, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6891077682122453, 2.14628204747881, 0, 1, 0.2430381051659003, 0, 0.4659219887594355, 2.172296220868626, 0.7569618948340997, 1, 0.2144836345446154],
[0.9213688969948063, 2.078631103005193, 1, 0, 0.3071229656649355, 1.085341607755224, 0, -5.060253711475868, 1, 0.3071229656649355, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.000677178655776, 1.999085142310641, 1, 1, 0.3335854883107517, 0.9993232796048311, 0.5002288190907921, -2.326958238905733, 0.8887207219884773, 0.5558916986099809, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.001433635727109, 1.91931521945936, 1, 1, 0.3428687933742851, 0.9985684166419393, 0.5210191582191923, -2.226506742282058, 0.8824409905300619, 0.568178577278632, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[1.369009187247032, 1.311081828434476, 0, 0, 0.5108069760455179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.811783041718148, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 1.584061701693088, 0, 0, 0.2378156781098074, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9998986032657875, 2.000101396734214, 2, 1, 0.333299534421929, 2.000202814033106, 0.4999746521015436, -6.994604344134681, 0.9629742281244367, 0.259214195186497, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9991077783035709, 2.00089222169643, 0, 1, 0.3330359261011901, 0, 0.4997770440389653, 2.330140689288838, 0.6669640738988099, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.174347715716582, 1.764458984368317, 0, 0, 0.3996001899963874, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 4.662360380656392, 0.4444444444444445, 1, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 2.006444513248598, 0, 0, 0.1976472428651583, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.999898568939745, 0, 2, 0.333344603832199, 0, 1.000050718102323, 4.662596846727245, 0.4444294172396477, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.3110818284344756, 2.688918171565525, 0, 0, 0.1036939428114919, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6804038377228766, 2.319596162277122, 1, 0, 0.226801279240959, 1.469715402174572, 0, -6.852342861939205, 1, 0.2268012792409589, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.811783041718148, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.92168745747799, 1, 0, 0.3422679580050644, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3422679580050645, 0.2144836345446154],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.4999999999999998, -2.331180190328196, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2144836345446154],
[0.9955377071407152, 2.004462292859286, 1, 1, 0.3318459023802383, 1.004482294168546, 0.498886910251397, -2.357267886618076, 0.8898782970734455, 0.5535701018339219, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000414232129738, 0, 1, 0.2537174721955246, 0, 0.4998964634116563, 2.330697465440755, 0.7462825278044753, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.174347715716582, 1.764458984368317, 0, 0, 0.3996001899963874, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999999, 0, -9.324720761312784, 1, 0.1111111111111109, 0.2144836345446154],
[0.835389815691059, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2946296170875722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.369009187247032, 1.311081828434476, 0, 0, 0.5108069760455179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9987414801476422, 2.001017785810649, 0, 1, 0.3329405434234364, 0, 0.4997456829674714, 2.32999447267161, 0.6670594565765635, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.4948207514414879, 2.340786292133001, 0, 1, 0.174502582282251, 0, 0.4272068763222153, 1.991792414508673, 0.825497417717749, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000334965146146, 0, 1, 0.2537249752636374, 0, 0.4999162727363211, 2.33078982365124, 0.7462750247363625, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.9210559599373801, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3153160954701891, 2.171420724682108, 0, -10.12394595649405, 1, 0.09942424006256534, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 4.662360380656392, 0.4444444444444445, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.389400230162639, 0, 0, 0.3314786468679079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.369009187247032, 1.311081828434476, 0, 0, 0.5108069760455179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.174347715716582, 1.764458984368317, 0, 0, 0.3996001899963874, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.920250134638801, 1.07892127672931, 2, 0, 0.6402602156583154, 1.041530977617247, 0, -4.855992765268974, 1, 0.4099331437548325, 0.2144836345446154],
[0.9993299531214892, 2.000670046878512, 1, 2, 0.3331099843738296, 1.000670496142358, 0.9996650887638581, -0.004687571527937856, 0.7410384894463711, 0.703405805310375, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 2.341133115655985, 0, 0, 0.1743170188803865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[1.917507598675579, 1.08249240132442, 0, 1, 0.6391691995585265, 0, 0.9237940134974697, 4.307060608418161, 0.3608308004414735, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.811783041718148, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.811783041718148, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9207430189493261, 2.079256981050673, 1, 0, 0.3069143396497754, 1.086079372223876, 0, -5.063693435304766, 1, 0.3069143396497754, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.921884680527111, 0, 1, 0.3422448554059975, 0, 0.5203225823756149, 2.42593139322889, 0.6577551445940025, 1, 0.2144836345446154],
[0.9987049055237569, 2.001295094476244, 0, 1, 0.3329016351745855, 0, 0.4996764359039756, 2.32967161790629, 0.6670983648254145, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.835389815691059, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2946296170875722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9987575056089841, 2.001242494391017, 0, 1, 0.3329191685363279, 0, 0.4996895692564745, 2.329732850328646, 0.6670808314636721, 1, 0.2144836345446154],
[0.0009600450999509969, 2.999039954900048, 0, 1, 0.0003200150333169991, 0, 0.333440039158574, 1.554617627897452, 0.999679984966683, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[0.31375735500382, 2.68624264499618, 0, 1, 0.1045857850012733, 0, 0.37226718958645, 1.735643795746167, 0.8954142149987266, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.002593033703353762, 2.997406966296645, 0, 1, 0.0008643445677845875, 0, 0.3336216974352066, 1.555464584249242, 0.9991356554322154, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999999, 0, -9.324720761312784, 1, 0.1111111111111109, 0.2144836345446154],
[1, 1.500701213283672, 0, 0, 0.399887837334593, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9996649632058108, 2.000335036794191, 0, 1, 0.3332216544019368, 0, 0.4999162548303089, 2.330789740166958, 0.6667783455980631, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.073697335115497, 1.926302664884503, 1, 0, 0.3578991117051657, 0.9313611641705624, 0, -4.342341391910846, 1, 0.3578991117051658, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.25770830355941, 0, 1, 0.2314967571907643, 0, 0.4429270151610999, 2.065085367009506, 0.7685032428092357, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 4.662360380656392, 0.4444444444444445, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.811783041718148, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9217830754485412, 2.078216924551458, 0, 1, 0.3072610251495138, 0, 0.4811817227481343, 2.243442600036891, 0.6927389748504862, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.000225799772659, 1.999694948066497, 0, 1, 0.3334174079409004, 0, 0.5000762746172356, 2.331535810081646, 0.6665825920590995, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[1.173707597995589, 1.765178354258635, 0, 1, 0.3993716044323924, 0, 0.566514991296726, 2.641297050469757, 0.6006283955676076, 1, 0.2144836345446154],
[0.9991713063786094, 2.000828693621392, 0, 1, 0.333057102126203, 0, 0.4997929124007384, 2.330214673310075, 0.666942897873797, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.4944463454030179, 2.341156600680323, 0, 1, 0.1743707969008739, 0, 0.4271393035858462, 1.991477366059813, 0.8256292030991261, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6886661763084019, 2.146723639382653, 1, 0, 0.2428823622407477, 1.452082350494552, 0, -6.770131220396213, 1, 0.2428823622407478, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319494702204749, 0, 1, 0.2267283150557047, 0, 0.4311283828540199, 2.010075891195044, 0.7732716849442953, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9210670684081615, 2.078285960801462, 1, 2, 0.3070885819169066, 1.0856972682003, 0.9623314778245089, -0.5751757733764509, 0.7750088015664238, 0.667315050818327, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.001433075643954, 1.919310286964155, 0, 1, 0.3428692463927107, 0, 0.5210204972025329, 2.429185323666985, 0.6571307536072892, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.389400230162639, 0, 0, 0.3314786468679079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.004525496646478, 0, 0, 0.3149748354695882, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.004173702810329268, 2.99582629718967, 0, 2, 0.001391234270109756, 0, 0.6675954483329569, 3.112570568614121, 0.9972194669925748, 1, 0.2144836345446154],
[0.6816464210583376, 2.318353578941662, 1, 1, 0.2272154736861126, 1.46703623624603, 0.4313405897544343, -4.828786348620725, 0.9483731285175954, 0.4028040758898207, 0.2144836345446154],
[0.6804038377228777, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2538437783691993, 1.46971540217457, 0, -6.852342861939194, 1, 0.2538437783691994, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 2.341133115655985, 0, 0, 0.1743170188803865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9987577909444627, 2.001242209055539, 1, 1, 0.3329192636481541, 1.001243754058091, 0.4996896405018049, -2.338426027800067, 0.8891647638919709, 0.5550032911882792, 0.2144836345446154],
[0.995151187005489, 2.004848812994511, 1, 1, 0.331717062335163, 1.004872438537808, 0.4987907285170126, -2.359535314175795, 0.8899637905557294, 0.5533979152260557, 0.2144836345446154],
[0.9905408949762129, 2.009459105023788, 1, 3, 0.3301802983254042, 1.009549434124084, 1.492939066288929, 2.253736669425437, 0.5981978624805097, 0.7987056107210175, 0.2144836345446154],
[0.680403801194141, 2.319596198805858, 1, 0, 0.2268012670647138, 1.46971548107896, 0, -6.852343229819895, 1, 0.2268012670647137, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[1.000477840415229, 1.920890915390107, 0, 1, 0.3424688644413965, 0, 0.5205917691567162, 2.427186439012093, 0.6575311355586035, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9267033068310644, 2.089641953512557, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[0.6442193013588884, 2.372125958984735, 0, 0, 0.2135761147202024, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[1.005448420114541, 2.010896840229083, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[0.692671687188755, 1.396970266323805, 0, 0, 0.3314786468679079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[0.3127767329257861, 2.703568527417837, 0, 0, 0.1036939428114918, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[1.005448420114541, 2.010896840229083, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9945811043057579, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2133213701008963],
[1.005448420114541, 2.010896840229083, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.989162208611516, 0, -9.324720761312784, 1, 0.1111111111111109, 0.2133213701008963],
[1.004551654077409, 2.011793606266215, 0, 2, 0.3330360311481616, 0, 0.9941377653107749, 4.660282112573015, 0.4448409357465961, 1, 0.2133213701008963],
[0.8399413703663526, 2.010896840229083, 0, 0, 0.2946296170875722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[0.692671687188755, 1.821654396885829, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[0.9260337647324037, 2.090311495611218, 2, 0, 0.3070052281173244, 2.159748462927743, 0, -10.12438867191895, 1, 0.0942522100913703, 0.2133213701008963],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078216922669485, 0, 1, 0.3072375921511599, 0, 0.4811817231838786, 2.243442602068488, 0.6927624078488401, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 5, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 2.499999999999999, 6.99354057098459, 0.3511659807956106, 0.9122085048010974, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[0, 2.011486599929853, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.83513778300715, 2.00046515727515, 1, 0, 0.2945185911409753, 1.19740720674763, 0, -5.582743920252591, 1, 0.2945185911409753, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 3, 1, 0.3333333333333333, 2.999999999999999, 0.4999999999999998, -11.65590095164098, 0.9876543209876545, 0.1111111111111109, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.921681598271837, 0, 0, 0.3422686443969446, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.921681598271837, 0, 0, 0.3422686443969446, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.4944973642445066, 1.585014658653271, 0, 1, 0.2377949051505986, 0, 0.6309089916238776, 2.941525086347044, 0.7622050948494015, 1, 0.2144836345446154],
[0.6804038376894205, 2.319596162310578, 1, 0, 0.2268012792298069, 1.46971540224684, 0, -6.852342862276141, 1, 0.2268012792298069, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.921783075372111, 1, 0, 0.3422567569882453, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3422567569882453, 0.2144836345446154],
[0.4947494979896862, 2.340853499313407, 1, 1, 0.1744777031411789, 2.021224890703874, 0.4271946109798451, -7.431943621751942, 0.9695575311065787, 0.3185129373889365, 0.2144836345446154],
[0.7416134650515295, 2.258386534948471, 1, 0, 0.2472044883505098, 1.348411331677368, 0, -6.286779569640689, 1, 0.2472044883505098, 0.2144836345446154],
[1.174347715716582, 1.764458984368317, 0, 0, 0.3996001899963874, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.50134770201068, 1, 0, 0.399784483858906, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.399784483858906, 0.2144836345446154],
[1.921681598271837, 1.078318401728162, 0, 0, 0.6405605327572792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.001193534388897, 1.998806465611104, 0, 1, 0.3337311781296323, 0, 0.5002985617690933, 2.332572192891596, 0.6662688218703677, 1, 0.2144836345446154],
[0.9996649814412801, 2.000335018558721, 0, 1, 0.3332216604804265, 0, 0.4999162593876493, 2.330789761414921, 0.6667783395195734, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889067342256993, 1.390605889717268, 0, 1, 0.3312827853477812, 0, 0.7191110057813115, 3.352754662648758, 0.6687172146522189, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.6804038013530083, 2.319596198646991, 1, 0, 0.2268012671176695, 1.469715480735797, 0, -6.852343228219945, 1, 0.2268012671176695, 0.2144836345446154],
[1, 1.921681598271837, 0, 0, 0.3422686443969446, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.921681598271837, 0, 0, 0.3422686443969446, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 1.584061701693088, 0, 0, 0.2378156781098074, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.921681598271837, 0, 0, 0.3422686443969446, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.811783041718148, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6810290128999559, 2.039191639792367, 1, 1, 0.2503580039457134, 1.468366223843831, 0.4903903980803987, -4.559675743279148, 0.9373208698603183, 0.4380368777517449, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.3110818284344756, 2.688918171565525, 0, 0, 0.1036939428114919, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.389400230162639, 0, 0, 0.3314786468679079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.005448420114541, 2.010896840229083, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4972905521528789, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2133213701008963],
[0.692671687188755, 1.821654396885829, 0, 0, 0.2754899977278396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[1.005448420114541, 2.010896840229083, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9945811043057579, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2133213701008963],
[1.005448420114541, 2.010896840229083, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4972905521528789, 2.331180190328196, 0.6666666666666667, 1, 0.2133213701008963],
[0.9263365691459893, 2.090008691197633, 1, 0, 0.3071056159666752, 1.079521238076483, 0, -5.060539586661634, 1, 0.3071056159666752, 0.2133213701008963],
[1.005448420114541, 2.010896840229083, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[0.683796437251065, 2.271022116371324, 0, 0, 0.2314174034181493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[0.683796437251065, 2.332548823092556, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2133213701008963],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.835389815691059, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2946296170875722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.8340316460053606, 2.001784576621545, 0, 1, 0.2941063808545291, 0, 0.4995542535789348, 2.329101959874804, 0.705893619145471, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0.9999999999999996, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 2.14647164412553, 0, 0, 0.2429712372362522, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.000541513375393, 1.998215768619202, 0, 4, 0.3336520495949882, 0, 2.001785824542893, 9.333046918908376, 0.1971533971997642, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.3119737867299369, 2.688026213270063, 0, 1, 0.1039912622433123, 0, 0.3720201815976603, 1.734492155485528, 0.8960087377566877, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.004525496646478, 0, 0, 0.3149748354695882, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.3110818284344756, 2.688918171565525, 0, 0, 0.1036939428114919, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.003281655751760178, 2.996718344248239, 0, 2, 0.001093885250586726, 0, 0.667396722097259, 3.111644035286206, 0.997813426083768, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.835389815691059, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2946296170875722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9216815982718379, 2.078318401728161, 0, 0, 0.3072271994239461, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9992506432939676, 2.000749356706033, 0, 2, 0.3330835477646558, 0, 0.9996254619782724, 4.660614149422842, 0.4447775542621782, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.000000000000001, 0, 0, 0.253756686508861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9213687388109021, 2.078631261189097, 1, 0, 0.3071229129369675, 1.085341794090581, 0, -5.060254580238453, 1, 0.3071229129369675, 0.2144836345446154],
[0.4942567000350739, 2.341133115655985, 0, 0, 0.1743170188803865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.174347715716582, 1.764458984368317, 0, 0, 0.3996001899963874, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6894164777941293, 1.388901923934034, 0, 1, 0.3317184110100097, 0, 0.7199932426960155, 3.356867969086227, 0.6682815889899903, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.9989637369449025, 2.001036263055099, 0, 1, 0.3329879123149674, 0, 0.4997410683968524, 2.329972957880382, 0.6670120876850326, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889675796818497, 1.812380259479964, 1, 1, 0.2754385331360866, 1.451447106497781, 0.5517605892964953, -4.194662772810011, 0.924133614463841, 0.475010680736014, 0.2144836345446154],
[0.7412843155966085, 2.258715684403392, 0, 0, 0.2470947718655362, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -4.662360380656392, 1, 0.3333333333333333, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6407283441606073, 2.359271655839394, 0, 0, 0.2135761147202024, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6800910156815073, 2.319908984318491, 0, 0, 0.2266970052271692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1, 1.999898568959697, 0, 2, 0.333344603829982, 0, 1.000050718092346, 4.662596846680731, 0.4444294172426035, 1, 0.2144836345446154],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[1.369009187247032, 1.311081828434476, 0, 0, 0.5108069760455179, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154],
[0.6889181715655247, 1.389400230162639, 0, 0, 0.3314786468679079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2144836345446154]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node1":{
"Global MG94xREV":0.0005553808382664476,
"Nucleotide GTR":0.0005547444616665528,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "C", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "TGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node112":{
"Global MG94xREV":0.0005554390386165421,
"Nucleotide GTR":0.0005548025953284605,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "I", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATT", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node130":{
"Global MG94xREV":0.0005553557547132054,
"Nucleotide GTR":0.0005547194068550043,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTT", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node155":{
"Global MG94xREV":0.0005554703663190239,
"Nucleotide GTR":0.0005548338871344628,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "V", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "GTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node173":{
"Global MG94xREV":0.0005552470381779173,
"Nucleotide GTR":0.0005546108148912798,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "P", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CCC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node192":{
"Global MG94xREV":0.000484119724082299,
"Nucleotide GTR":0.000483565001191759,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "L", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "TTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node215":{
"Global MG94xREV":0.000555639672931413,
"Nucleotide GTR":0.0005550029997488618,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "N", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "AAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node229":{
"Global MG94xREV":0.000465468040631299,
"Nucleotide GTR":0.0004649346895528185,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "S", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "TCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node232":{
"Global MG94xREV":0.000465468040631299,
"Nucleotide GTR":0.0004649346895528185,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "I", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ATA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node299":{
"Global MG94xREV":0.0005555006144149928,
"Nucleotide GTR":0.0005548641005710068,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node315":{
"Global MG94xREV":0.0005555920936308091,
"Nucleotide GTR":0.0005549554749664396,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "V", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GTT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node320":{
"Global MG94xREV":0.0005556038847004255,
"Nucleotide GTR":0.0005549672525253978,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTT", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node325":{
"Global MG94xREV":0.0005553363620642821,
"Nucleotide GTR":0.000554700036426919,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGC", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node329":{
"Global MG94xREV":0.0005553696421377709,
"Nucleotide GTR":0.0005547332783668272,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "I", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ATA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node333":{
"Global MG94xREV":0.0005553901192366671,
"Nucleotide GTR":0.0005547537320022806,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "Y", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "TAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node350":{
"Global MG94xREV":0.0005552529902775385,
"Nucleotide GTR":0.000554616760170757,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node363":{
"Global MG94xREV":0.0005552356014983034,
"Nucleotide GTR":0.0005545993913162504,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAC", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node379":{
"Global MG94xREV":0.0005554601001979395,
"Nucleotide GTR":0.0005548236327766919,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "V", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "GTT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node382":{
"Global MG94xREV":0.0005554648000127299,
"Nucleotide GTR":0.0005548283272062552,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "C", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "TGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node385":{
"Global MG94xREV":0.0005553683227701637,
"Nucleotide GTR":0.0005547319605110018,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "L", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TTA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node388":{
"Global MG94xREV":0.000555440877034796,
"Nucleotide GTR":0.0005548044316401843,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "V", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GTT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node391":{
"Global MG94xREV":0.0005554370334415276,
"Nucleotide GTR":0.0005548005924510526,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTG", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node397":{
"Global MG94xREV":0.0005554803011881889,
"Nucleotide GTR":0.0005548438106198746,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node399":{
"Global MG94xREV":0.0005510063821089302,
"Nucleotide GTR":0.0005503750179281607,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node400":{
"Global MG94xREV":4.138583690671235e-06,
"Nucleotide GTR":4.133841543236559e-06,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node461":{
"Global MG94xREV":0.0005552581722587621,
"Nucleotide GTR":0.0005546219362142688,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "T", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ACA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node471":{
"Global MG94xREV":0.00055536113037582,
"Nucleotide GTR":0.0005547247763579791,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "F", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "TTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node476":{
"Global MG94xREV":0.00055517534254207,
"Nucleotide GTR":0.0005545392014070336,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCG", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node48":{
"Global MG94xREV":0.00055543338405069,
"Nucleotide GTR":0.0005547969472418262,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node480":{
"Global MG94xREV":0.00111085977488438,
"Nucleotide GTR":0.001109586909279747,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "S", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "A", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "TCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "GCT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node483":{
"Global MG94xREV":0.0005553590903619332,
"Nucleotide GTR":0.0005547227386816179,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTT", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node498":{
"Global MG94xREV":0.0004806764580783988,
"Nucleotide GTR":0.0004801256806137018,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "L", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CTA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node506":{
"Global MG94xREV":0.0005552835410001526,
"Nucleotide GTR":0.0005546472758871859,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node507":{
"Global MG94xREV":0.0005552835426112238,
"Nucleotide GTR":0.0005546472774964103,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTC", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node51":{
"Global MG94xREV":0.0005555130588511264,
"Nucleotide GTR":0.00055487653074783,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGT", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node516":{
"Global MG94xREV":0.0002879584974008934,
"Nucleotide GTR":0.0002876285435442587,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node517":{
"Global MG94xREV":0.0002673884452226283,
"Nucleotide GTR":0.0002670820613182911,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node522":{
"Global MG94xREV":0.0005553682053720314,
"Nucleotide GTR":0.0005547318432473906,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node526":{
"Global MG94xREV":0.0004064410918576326,
"Nucleotide GTR":0.0004059753761139969,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node527":{
"Global MG94xREV":0.0001489066074801963,
"Nucleotide GTR":0.0001487359845957878,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node536":{
"Global MG94xREV":0.0005553951351158624,
"Nucleotide GTR":0.0005547587421340904,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATT", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node540":{
"Global MG94xREV":0.0004290530405322142,
"Nucleotide GTR":0.0004285614151532029,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "S", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "TCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node541":{
"Global MG94xREV":0.000126287997350033,
"Nucleotide GTR":0.0001261432917339515,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "S", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "TCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node546":{
"Global MG94xREV":0.0005553067130724509,
"Nucleotide GTR":0.0005546704214080369,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "I", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATT", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node55":{
"Global MG94xREV":0.000555368905357492,
"Nucleotide GTR":0.0005547325424307804,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "S", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "TCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node551":{
"Global MG94xREV":0.0003862168656508986,
"Nucleotide GTR":0.0003857743235989396,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node552":{
"Global MG94xREV":0.000169163071051821,
"Nucleotide GTR":0.0001689692375369307,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node553":{
"Global MG94xREV":0.0005555051987645184,
"Nucleotide GTR":0.000554868679667609,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node559":{
"Global MG94xREV":0.0005554006854608467,
"Nucleotide GTR":0.0005547642861192774,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "L", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TTA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node565":{
"Global MG94xREV":0.0005553295953433621,
"Nucleotide GTR":0.0005546932774595671,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "I", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ATT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node577":{
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node585":{
"Global MG94xREV":0.0005552778992568848,
"Nucleotide GTR":0.0005546416406084421,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "L", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CTA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node589":{
"Global MG94xREV":0.0005553919742016684,
"Nucleotide GTR":0.0005547555848417928,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCG", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node599":{
"Global MG94xREV":0.0005553180471160531,
"Nucleotide GTR":0.0005546817424646588,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node604":{
"Global MG94xREV":0.0005554186169016173,
"Nucleotide GTR":0.0005547821970135178,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "I", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ATT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node607":{
"Global MG94xREV":0.0005555258238483608,
"Nucleotide GTR":0.0005548892811184424,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGT", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node615":{
"Global MG94xREV":0.000487773589112892,
"Nucleotide GTR":0.0004872146794840917,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "L", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CTT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node616":{
"Global MG94xREV":6.758364312884877e-05,
"Nucleotide GTR":6.750620320643964e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "L", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CTT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node64":{
"Global MG94xREV":0.0005555931783958985,
"Nucleotide GTR":0.0005549565584885639,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node65":{
"Global MG94xREV":0.0005555537009426287,
"Nucleotide GTR":0.0005549171262700692,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACC", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node677":{
"Global MG94xREV":0.0005554339257592761,
"Nucleotide GTR":0.0005547974883297014,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "V", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GTT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node688":{
"Global MG94xREV":0.0004801874294611267,
"Nucleotide GTR":0.0004796372123441176,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "V", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GTT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node691":{
"Global MG94xREV":0.0004631061145864022,
"Nucleotide GTR":0.0004625754698930938,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAT", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node694":{
"Global MG94xREV":0.000483653697091413,
"Nucleotide GTR":0.0004830995081924177,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTT", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node699":{
"Global MG94xREV":0.0005555958253570197,
"Nucleotide GTR":0.0005549592024166957,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "V", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GTT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node702":{
"Global MG94xREV":0.0005558699596907895,
"Nucleotide GTR":0.0005552330226368647,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "Y", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "TAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node706":{
"Global MG94xREV":0.000465468040631299,
"Nucleotide GTR":0.0004649346895528185,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "L", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CTG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node709":{
"Global MG94xREV":0.000465468040631299,
"Nucleotide GTR":0.0004649346895528185,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "I", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ATA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node712":{
"Global MG94xREV":0.000465468040631299,
"Nucleotide GTR":0.0004649346895528185,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "V", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GTA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node718":{
"Global MG94xREV":0.0004646026888901155,
"Nucleotide GTR":0.0004640703293647475,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAC", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node722":{
"Global MG94xREV":0.0004864166538102966,
"Nucleotide GTR":0.0004858592990098491,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "G", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "GGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node725":{
"Global MG94xREV":0.0004864166538102966,
"Nucleotide GTR":0.0004858592990098491,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACG", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node728":{
"Global MG94xREV":0.0004636084663193027,
"Nucleotide GTR":0.0004630772460121711,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTT", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node731":{
"Global MG94xREV":0.000465468040631299,
"Nucleotide GTR":0.0004649346895528185,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "I", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ATA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node735":{
"Global MG94xREV":0.000465468040631299,
"Nucleotide GTR":0.0004649346895528185,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTT", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node738":{
"Global MG94xREV":0.000465468040631299,
"Nucleotide GTR":0.0004649346895528185,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "I", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ATT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node742":{
"Global MG94xREV":0.000465468040631299,
"Nucleotide GTR":0.0004649346895528185,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCT", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node745":{
"Global MG94xREV":0.000465468040631299,
"Nucleotide GTR":0.0004649346895528185,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "I", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ATA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node751":{
"Global MG94xREV":0.0005553227117129781,
"Nucleotide GTR":0.0005546864017167099,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "Y", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "TAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node756":{
"Global MG94xREV":0.000465468040631299,
"Nucleotide GTR":0.0004649346895528185,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "Y", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "TAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node764":{
"Global MG94xREV":0.0005073559248251234,
"Nucleotide GTR":0.0005067745770073191,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTA", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node771":{
"Global MG94xREV":0.0004841197270123638,
"Nucleotide GTR":0.0004835650041184659,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "F", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "TTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node776":{
"Global MG94xREV":0.0005553337070791057,
"Nucleotide GTR":0.0005546973844839263,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "V", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GTA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node783":{
"Global MG94xREV":0.0003577183663895261,
"Nucleotide GTR":0.0003573084790076826,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "V", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GTT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node786":{
"Global MG94xREV":0.0005553987893894601,
"Nucleotide GTR":0.0005547623922204816,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "D", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAT", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node86":{
"Global MG94xREV":0.000555356278820856,
"Nucleotide GTR":0.0005547199303621115,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "F", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "TTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node897":{
"Global MG94xREV":0.0005554496488302587,
"Nucleotide GTR":0.0005548131933845875,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "V", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "GTA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node958":{
"Global MG94xREV":0.000555454263708982,
"Nucleotide GTR":0.0005548178029754071,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "L", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "TTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node973":{
"Global MG94xREV":0.0005554962194175968,
"Nucleotide GTR":0.0005548597106095666,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "L", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TTA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406036_California_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":8.988987843753462e-05,
"Nucleotide GTR":8.978687917781273e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "I", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ATA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406036_California_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553938552988405,
"Nucleotide GTR":0.0005547574637835328,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACG", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005556073814211879,
"Nucleotide GTR":0.0005549707452394831,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "T", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "ACT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413523_Kerala_20200131_null_1":{
"Global MG94xREV":8.988987848413586e-05,
"Nucleotide GTR":8.978687922436066e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "I", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ATA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413523_Kerala_20200131_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413695_China_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116226444371911,
"Nucleotide GTR":0.001160932676679431,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "-", "Y", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "ILVF", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "---", "TAT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "-TT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413695_China_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413749_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005558126011112886,
"Nucleotide GTR":0.000555175729781017,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCT", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413749_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005565609165827412,
"Nucleotide GTR":0.0005559231878039896,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "E", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "HPRL", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAA", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CNT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413931_California_20200305_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005551924091431823,
"Nucleotide GTR":0.0005545562484525811,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "F", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCG", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "TTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413931_California_20200305_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553823573599476,
"Nucleotide GTR":0.0005547459790194165,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "A", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GCA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553938477202064,
"Nucleotide GTR":0.0005547574562135816,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCG", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415149_England_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "AS", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "KCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415149_England_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415517_Noord_Brabant_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005556077105154962,
"Nucleotide GTR":0.0005549710739567029,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "S", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "TCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415517_Noord_Brabant_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415592_Washington_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553229361140427,
"Nucleotide GTR":0.0005546866258606477,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTC", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415592_Washington_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001111310022134993,
"Nucleotide GTR":0.001110036640619845,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "H", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "CAT", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416315_Hong_Kong_20200219_null_4":{
"Global MG94xREV":6.880028985709853e-05,
"Nucleotide GTR":6.872145585434869e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "G", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "GGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416315_Hong_Kong_20200219_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555584504457147,
"Nucleotide GTR":0.0005549218703309928,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "T", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "ACA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005555606037167973,
"Nucleotide GTR":0.0005549240211347756,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "I", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "ATC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416349_Shanghai_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555578601436415,
"Nucleotide GTR":0.0005549212807053113,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "T", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "ACT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416349_Shanghai_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556668055021546,
"Nucleotide GTR":0.0005550301012300669,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "I", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "ATT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416396_Shanghai_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555380613543644,
"Nucleotide GTR":0.0005549015046022435,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "L", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTT", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CTT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416396_Shanghai_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "KGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416670_Washington_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0011117033800193,
"Nucleotide GTR":0.001110429547779648,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "P", "I", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "CCA", "ATA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416670_Washington_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416671_Washington_20200312_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000555256870856082,
"Nucleotide GTR":0.000554620636302785,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "F", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "TTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416671_Washington_20200312_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416679_Washington_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005557886382826837,
"Nucleotide GTR":0.0005551517944099373,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "K", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "AAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416679_Washington_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416682_USA_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554493924196939,
"Nucleotide GTR":0.0005548129372678285,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCT", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416682_USA_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416689_Washington_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555247673155997,
"Nucleotide GTR":0.0005548882257962972,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "T", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "ACT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416689_Washington_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417107_Washington_20200305_null_2":{
"Global MG94xREV":7.457559312560952e-05,
"Nucleotide GTR":7.44901415595515e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "L", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CTA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417107_Washington_20200305_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417117_Washington_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553073064720949,
"Nucleotide GTR":0.0005546710141277414,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGC", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417117_Washington_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTT", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417150_Washington_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "ILV", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "NTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTT", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417150_Washington_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417231_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555481821922775,
"Nucleotide GTR":0.0005548453296119447,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "V", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GTT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417231_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417238_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "V", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "GTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417238_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATY", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417242_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417261_England_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "TI", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "AYA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417261_England_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417324_California_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554393598931668,
"Nucleotide GTR":0.0005548029162369532,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "F", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TTT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417324_California_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417368_USA_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554688794415473,
"Nucleotide GTR":0.0005548324019607073,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "I", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ATT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417368_USA_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417424_Kasterlee_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "V", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "GTA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417424_Kasterlee_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417518_Taoyuan_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553938477252434,
"Nucleotide GTR":0.0005547574562186132,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "R", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AGA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417518_Taoyuan_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417530_Luxembourg_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "PL", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CYG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417530_Luxembourg_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553938478508438,
"Nucleotide GTR":0.0005547574563440691,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTG", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417577_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553532426856963,
"Nucleotide GTR":0.0005547168977058728,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "T", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAT", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ACA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417577_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417826_Reykjavik_20200316_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005555584525399335,
"Nucleotide GTR":0.000554921872422813,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "I", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "ATT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417826_Reykjavik_20200316_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "L", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CTT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417948_Kinshasa_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554236808635993,
"Nucleotide GTR":0.0005547872551730183,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAG", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417948_Kinshasa_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418090_Wales_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTK", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418090_Wales_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418099_Wales_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTK", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418099_Wales_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418101_Wales_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555481828222685,
"Nucleotide GTR":0.0005548453359046359,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "TTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418101_Wales_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418116_Wales_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554455618608843,
"Nucleotide GTR":0.0005548091110982192,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "P", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "CCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418116_Wales_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005553495090351627,
"Nucleotide GTR":0.0005547131683334983,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTT", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418217_Mbour_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553616310231328,
"Nucleotide GTR":0.0005547252764316319,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "I", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "ATA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418217_Mbour_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418333_Ontario_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553665982397021,
"Nucleotide GTR":0.000554730237956574,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTT", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418333_Ontario_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418342_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001111376325795468,
"Nucleotide GTR":0.001110102868307049,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "Q", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "L", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAG", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CTC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418342_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418368_Ontario_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555584857235128,
"Nucleotide GTR":0.0005549219055683687,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "H", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAC", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418368_Ontario_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554239555913625,
"Nucleotide GTR":0.0005547875295859875,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "V", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "GTC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418440_Lucerne_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554773794828593,
"Nucleotide GTR":0.0005548408922623467,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTT", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418440_Lucerne_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418503_Hangzhou_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "AV", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GYT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418503_Hangzhou_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418697_England_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555534214773481,
"Nucleotide GTR":0.0005549168471250105,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "H", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CAC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418697_England_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418731_England_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553778299784083,
"Nucleotide GTR":0.0005547414568255247,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "Y", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "TAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTT", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418731_England_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418732_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "TI", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "AYA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418732_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418768_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554818220969436,
"Nucleotide GTR":0.000554845329785915,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAT", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418768_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418830_British_Columbia_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551917330275546,
"Nucleotide GTR":0.000554555573111672,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTC", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418830_British_Columbia_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418863_Komen_20200305_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000555482409024409,
"Nucleotide GTR":0.0005548459160408557,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "F", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "TTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418863_Komen_20200305_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418883_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553629323705272,
"Nucleotide GTR":0.0005547265762878924,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "I", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ATA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418883_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418890_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554049154219211,
"Nucleotide GTR":0.0005547685112334998,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAT", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418890_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418939_Washington_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553839977580923,
"Nucleotide GTR":0.0005547476175379308,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGC", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418939_Washington_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418974_New_York_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553547729168507,
"Nucleotide GTR":0.0005547184261836297,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "F", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCG", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "TTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418974_New_York_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555612418155189,
"Nucleotide GTR":0.0005549757762022026,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "G", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GGG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005558125944649431,
"Nucleotide GTR":0.0005551757231422866,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "V", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GTT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419253_Hong_Kong_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "V", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "GTT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419253_Hong_Kong_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419416_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "IV", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "RTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419416_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATW", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419473_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555531406867368,
"Nucleotide GTR":0.0005549165666561408,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "M", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "ATG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419473_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419496_Wales_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005556032864256125,
"Nucleotide GTR":0.0005549666549361103,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419496_Wales_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "ED", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAM", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555600137107324,
"Nucleotide GTR":0.0005549234318047618,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "D", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAT", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553819687612605,
"Nucleotide GTR":0.0005547455908660019,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "V", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAC", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "GTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419704_New_York_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005556014416377418,
"Nucleotide GTR":0.000554964812262069,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "S", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "TCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419704_New_York_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419801_Victoria_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553938552988405,
"Nucleotide GTR":0.0005547574637835328,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "R", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CGA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419801_Victoria_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419820_Victoria_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "I", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ATA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419820_Victoria_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419848_Victoria_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551725411014323,
"Nucleotide GTR":0.0005545364031763927,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419848_Victoria_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419887_Victoria_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554824090374393,
"Nucleotide GTR":0.0005548459160538707,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGT", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419887_Victoria_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553809241926963,
"Nucleotide GTR":0.000554744547494343,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTC", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554974961673539,
"Nucleotide GTR":0.0005548609858963751,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "S", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "TCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420006_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554818216449202,
"Nucleotide GTR":0.0005548453293344084,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAT", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420006_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420026_Virginia_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005553422245747113,
"Nucleotide GTR":0.0005547058922198602,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "S", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "L", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "TTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420026_Virginia_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420060_Ile_de_France_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005559558018170399,
"Nucleotide GTR":0.0005553187664019243,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "H", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CAC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420060_Ile_de_France_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420078_Thies_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "V", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GTT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420078_Thies_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554767988107655,
"Nucleotide GTR":0.0005548403122556098,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "I", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ATA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "PS", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "YCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005552975433361142,
"Nucleotide GTR":0.0005546612621787352,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGG", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420300_New_York_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554086301781638,
"Nucleotide GTR":0.0005547722217332335,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "G", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "GGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420300_New_York_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420328_Alken_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005660867966126747,
"Nucleotide GTR":0.0005654381527163562,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "C", "A", "N", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "TGT", "GCT", "AAC", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420328_Alken_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420528_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACY", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420528_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420540_Estonia_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555266217278997,
"Nucleotide GTR":0.0005546299720162113,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "R", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "I", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AGA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATT", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420540_Estonia_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420623_ARA_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554600275895403,
"Nucleotide GTR":0.0005548235602514907,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "P", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "CCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420623_ARA_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420634_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "AS", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "KCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420634_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420700_England_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "TI", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "AYA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420700_England_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420756_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005557023416032559,
"Nucleotide GTR":0.0005550655966125446,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "I", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "ATC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420756_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420761_England_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005555125847949337,
"Nucleotide GTR":0.0005548760572348292,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "V", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GTA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420761_England_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "LF", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "YTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420789_Illinois_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "AV", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GYT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420789_Illinois_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "AS", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "KCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420917_Wales_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "CF", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TKC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420917_Wales_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420932_Wales_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005553937884451629,
"Nucleotide GTR":0.0005547573970064569,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGG", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420932_Wales_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "QR", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CRA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420980_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "HR", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CRT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420980_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554455614900335,
"Nucleotide GTR":0.0005548091107277941,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAC", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555584519504549,
"Nucleotide GTR":0.0005549218718340091,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "S", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "AGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553225873174448,
"Nucleotide GTR":0.0005546862774637144,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005559558013283409,
"Nucleotide GTR":0.0005553187659137853,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "I", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "ATT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421317_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554652073113357,
"Nucleotide GTR":0.0005548287340381629,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "L", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TTA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421317_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555120044035839,
"Nucleotide GTR":0.000554875477508514,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "L", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CTT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421575_KZN_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":8.988987832165449e-05,
"Nucleotide GTR":8.97868790620655e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "L", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CTG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421575_KZN_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421603_New_York_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000555408905717288,
"Nucleotide GTR":0.0005547724969566335,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "R", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AGG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421603_New_York_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421618_New_York_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555123158848893,
"Nucleotide GTR":0.0005548757886329117,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "L", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TTA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421618_New_York_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421665_India_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555120044591143,
"Nucleotide GTR":0.0005548754775639803,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "V", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GTT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421665_India_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421730_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555560014330427,
"Nucleotide GTR":0.0005549234324237468,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "S", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "TCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421730_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421827_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCW", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421827_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421860_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "LV", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "STC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421860_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421864_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554233687629549,
"Nucleotide GTR":0.0005547869434299905,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "A", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "GCT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421864_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421866_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "SL", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TYA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421866_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421880_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "PL", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CYT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421880_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421892_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCY", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421892_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421906_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "QP", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CMA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421906_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421915_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "IV", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "RTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421915_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421931_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "AV", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GYT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421931_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421939_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005552894378841295,
"Nucleotide GTR":0.0005546531660142868,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "H", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "YF", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "CAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TWT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421939_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421955_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555411741090794,
"Nucleotide GTR":0.0005549046137902454,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "Y", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "L", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "TAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TTA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421955_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422003_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "IV", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "RTA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422003_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422043_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTR", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422043_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422051_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555600139698419,
"Nucleotide GTR":0.0005549234320635752,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "I", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATT", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422051_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422080_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555380701211673,
"Nucleotide GTR":0.0005547443247688194,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAC", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422080_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422091_Wales_20200328_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0005554233732413333,
"Nucleotide GTR":0.000554786947903237,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "V", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "GTG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422091_Wales_20200328_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422114_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553437093282966,
"Nucleotide GTR":0.0005547073752721589,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "S", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "TCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422114_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422119_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTW", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422119_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422134_Wales_20200325_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005555399682566822,
"Nucleotide GTR":0.0005549034093195594,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "S", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "TCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422134_Wales_20200325_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422148_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005561738757193911,
"Nucleotide GTR":0.0005555365904268603,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "HY", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "T", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "YAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "ACT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422148_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422149_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACR", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422149_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCG", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422178_Wales_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555600137012096,
"Nucleotide GTR":0.0005549234317952501,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "C", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "TGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422178_Wales_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422196_Wales_20200327_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422196_Wales_20200327_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553639672783067,
"Nucleotide GTR":0.000554727610009835,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAC", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422265_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "NS", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "ART", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422265_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422297_Wales_20200329_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005553804003309176,
"Nucleotide GTR":0.0005547440242328255,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTC", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422297_Wales_20200329_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "TA", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "RCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCY", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422349_Wales_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":7.513886442125435e-05,
"Nucleotide GTR":7.505276743740872e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "V", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GTT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422349_Wales_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005558130175282996,
"Nucleotide GTR":0.0005551761457208808,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCT", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422372_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "HR", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CRT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422372_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAY", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "AV", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GYT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555438548415156,
"Nucleotide GTR":0.0005548021056887654,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "F", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "TTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422578_Netherlands_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555600130471463,
"Nucleotide GTR":0.0005549234311419365,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "S", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "TCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422578_Netherlands_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422606_Netherlands_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553371092902763,
"Nucleotide GTR":0.0005547007827967132,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "F", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "TTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422606_Netherlands_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422675_Netherlands_20200310_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005555844079433511,
"Nucleotide GTR":0.0005549477980855363,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "I", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ATT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422675_Netherlands_20200310_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422751_Netherlands_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555125853783535,
"Nucleotide GTR":0.0005548760578175805,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "Y", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "TAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422751_Netherlands_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005557348370407992,
"Nucleotide GTR":0.0005550980548155724,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGT", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422908_Zuid_Holland_20200317_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005553809241855599,
"Nucleotide GTR":0.0005547445474872147,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAC", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422908_Zuid_Holland_20200317_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422932_Zuid_Holland_20200323_null_8":{
"Global MG94xREV":8.988987875252836e-05,
"Nucleotide GTR":8.978687949244576e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "V", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GTA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422932_Zuid_Holland_20200323_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422968_USA_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTC", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422968_USA_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422987_Washington_20200318_null_16":{
"Global MG94xREV":0.0005555423822552709,
"Nucleotide GTR":0.0005549058205520968,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "N", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAT", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422987_Washington_20200318_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423017_Washington_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555444377704601,
"Nucleotide GTR":0.0005548079282987875,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423017_Washington_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423061_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "LF", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "YTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423061_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423062_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "VF", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "KTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423062_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423089_England_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005553856392144362,
"Nucleotide GTR":0.0005547492571134315,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGT", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423089_England_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423091_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTY", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423091_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423112_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTY", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423112_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423121_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551962882822194,
"Nucleotide GTR":0.0005545601231467523,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "V", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "GTT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423121_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423145_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "SG", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "RGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423145_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423147_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553803937915501,
"Nucleotide GTR":0.000554744017700951,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGC", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423147_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423155_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "AV", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GYT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423155_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423247_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "VF", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "KTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423247_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423282_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "MV", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "RTG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423282_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423304_England_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555884509864162,
"Nucleotide GTR":0.0005549518364959285,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "T", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "ACA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423304_England_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423312_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "VL", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "KTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423312_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423339_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553819648792057,
"Nucleotide GTR":0.0005547455869883948,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "I", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "ATA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423339_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423346_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":8.988987841903745e-05,
"Nucleotide GTR":8.978687915933688e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "Y", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "TAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423346_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423362_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAY", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423362_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423385_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "YTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423385_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423399_England_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005557023393523637,
"Nucleotide GTR":0.0005550655943642312,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "Y", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TAT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423399_England_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423404_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTY", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423404_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423409_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "AV", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GYA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423409_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423426_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "PL", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CYA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCG", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423426_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423453_England_20200329_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "PL", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CYA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423453_England_20200329_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423531_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTR", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423531_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423549_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "HY", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "YAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423549_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423569_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005565917701421112,
"Nucleotide GTR":0.0005559540060101717,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "I", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "PS", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ATT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "YCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCA", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423569_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423570_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "VF", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "KTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423570_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423593_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "TS", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AST", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423593_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423598_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553809832957514,
"Nucleotide GTR":0.0005547446065296759,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAC", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423598_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423649_England_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555605442924323,
"Nucleotide GTR":0.0005549239617785007,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "S", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "TCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423649_England_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423656_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "Y", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "TAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGY", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423656_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423659_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "ED", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAK", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423659_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423675_England_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "L", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TTA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423675_England_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAY", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423687_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423709_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "TP", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "MCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423709_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423736_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553899461511389,
"Nucleotide GTR":0.0005547535591150814,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "I", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATT", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423736_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423743_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGR", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423743_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423758_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553809839902141,
"Nucleotide GTR":0.0005547446072233429,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCC", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423758_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423779_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555485459726958,
"Nucleotide GTR":0.0005548489632477927,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423779_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423814_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCY", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423814_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423870_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554556247468414,
"Nucleotide GTR":0.0005548191624537375,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "S", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "TCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423870_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423875_England_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTY", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423875_England_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423888_England_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423888_England_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423907_England_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005556276786692315,
"Nucleotide GTR":0.0005549910192301643,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAT", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423907_England_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423954_England_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAY", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423954_England_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423958_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":8.98898784608444e-05,
"Nucleotide GTR":8.978687920109601e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "I", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ATA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423958_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423967_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "KE", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "RAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423967_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424026_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAY", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424026_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424088_England_20200313_null_6":{
"Global MG94xREV":9.063920028494824e-05,
"Nucleotide GTR":9.053534242360283e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAC", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424088_England_20200313_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424131_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "PL", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CYA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424131_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424142_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "IL", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "MTA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424142_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424144_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555417806895642,
"Nucleotide GTR":0.0005549052196756869,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "D", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAC", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424144_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424146_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "TI", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "AYA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424146_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424148_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00055538098359921,
"Nucleotide GTR":0.0005547446068327871,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAC", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424148_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424154_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "RW", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "YGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424154_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "L", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "TTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424199_Washington_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553113126164735,
"Nucleotide GTR":0.0005546750156817266,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAG", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424199_Washington_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424213_Washington_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553408981169445,
"Nucleotide GTR":0.0005547045672819996,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "A", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "GCA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424213_Washington_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552311328148919,
"Nucleotide GTR":0.0005545949277532267,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "S", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "A", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTT", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "TCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "GCT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424343_Rome_20200323_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005556073301241428,
"Nucleotide GTR":0.0005549706940012169,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "A", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424343_Rome_20200323_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424375_Reykjavik_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555600131294131,
"Nucleotide GTR":0.0005549234312241091,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "C", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "TGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424375_Reykjavik_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424408_Reykjavik_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553809837085156,
"Nucleotide GTR":0.000554744606941967,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCC", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424408_Reykjavik_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424435_Reykjavik_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":6.880028969730968e-05,
"Nucleotide GTR":6.872145569474303e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACG", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424435_Reykjavik_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "T", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ACA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAC", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424548_Reykjavik_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005551342479793418,
"Nucleotide GTR":0.0005544981539320264,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAC", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAC", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424548_Reykjavik_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005555600143062849,
"Nucleotide GTR":0.0005549234323996324,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACT", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424597_Reykjavik_20200327_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005555600136803227,
"Nucleotide GTR":0.0005549234317743868,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCT", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424597_Reykjavik_20200327_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555312839083833,
"Nucleotide GTR":0.0005546765404000014,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "C", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "TGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424661_Li_ge_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555423867673082,
"Nucleotide GTR":0.0005549058250589625,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "N", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAT", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424661_Li_ge_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424842_South_Carolina_20200307_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "L", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CTA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424842_South_Carolina_20200307_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424846_Massachusetts_20200306_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "PL", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CYT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424846_Massachusetts_20200306_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424848_Arizona_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552810103612434,
"Nucleotide GTR":0.0005546447481479787,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "R", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AGG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424848_Arizona_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424851_Illinois_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554730727123665,
"Nucleotide GTR":0.000554836590426716,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "C", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "TGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424851_Illinois_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424852_District_of_Columbia_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "TI", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "AYA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424852_District_of_Columbia_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424863_Georgia_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "PL", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CYA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424863_Georgia_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424868_Louisiana_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "V", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GTT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424868_Louisiana_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "LF", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "YTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553803944194651,
"Nucleotide GTR":0.0005547440183281468,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTC", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":9.176619856976222e-05,
"Nucleotide GTR":9.16610493506905e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTT", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "S", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "TCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425163_Wisconsin_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555192682381078,
"Nucleotide GTR":0.0005548827330198577,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAT", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425163_Wisconsin_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005556904252483349,
"Nucleotide GTR":0.0005550536939118387,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAT", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACC", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425190_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005552942571114091,
"Nucleotide GTR":0.0005546579797195121,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "P", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "S", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CCC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "TCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425190_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425231_England_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGC", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425231_England_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425255_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552884558692209,
"Nucleotide GTR":0.0005546521851246088,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACT", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425255_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425259_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553803997075853,
"Nucleotide GTR":0.0005547440236102075,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTC", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425259_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425289_England_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554053970022477,
"Nucleotide GTR":0.0005547689922620134,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATT", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425289_England_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425332_England_20200329_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425332_England_20200329_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425368_England_20200316_null_6":{
"Global MG94xREV":0.000555517615808791,
"Nucleotide GTR":0.0005548810824839578,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTT", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425368_England_20200316_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425435_England_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005553809836951445,
"Nucleotide GTR":0.0005547446069286113,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTC", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425435_England_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425505_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555825318505058,
"Nucleotide GTR":0.0005549459241423905,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "S", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "TCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425505_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555512002356033,
"Nucleotide GTR":0.0005548754754633081,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCT", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425693_Scotland_20200316_null_5":{
"Global MG94xREV":8.98898783929891e-05,
"Nucleotide GTR":8.978687913331832e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "I", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ATA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425693_Scotland_20200316_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555380614968938,
"Nucleotide GTR":0.0005549015047446097,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTT", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAT", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425821_Scotland_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTG", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425821_Scotland_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425900_Scotland_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555120042002485,
"Nucleotide GTR":0.0005548754773054106,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "I", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ATT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425900_Scotland_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001670302326556436,
"Nucleotide GTR":0.001668388430285386,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "I", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "Y", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "V", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCG", "ATA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TAT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GTA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425920_Scotland_20200323_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "V", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GTA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425920_Scotland_20200323_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425930_Scotland_20200325_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005555429719423418,
"Nucleotide GTR":0.0005549064095634817,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "S", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "TCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425930_Scotland_20200325_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425953_Scotland_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001111578563705909,
"Nucleotide GTR":0.00111030487448556,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "F", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "I", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "TTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ATA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425953_Scotland_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425990_Scotland_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000555512002103742,
"Nucleotide GTR":0.0005548754752113066,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATT", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425990_Scotland_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553286382717198,
"Nucleotide GTR":0.0005546923214845738,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "Y", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "V", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "TAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GTT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426082_Washington_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553079504095245,
"Nucleotide GTR":0.0005546716573273223,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTT", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426082_Washington_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426108_Washington_20200325_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426108_Washington_20200325_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426120_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553993031894132,
"Nucleotide GTR":0.0005547629054317026,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTT", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426120_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426181_South_Korea_20200223_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000555512004069637,
"Nucleotide GTR":0.0005548754771749492,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "I", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ATT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426181_South_Korea_20200223_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426299_New_York_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554239474857964,
"Nucleotide GTR":0.0005547875214897095,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCG", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426299_New_York_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426322_New_York_20200312_null_11":{
"Global MG94xREV":0.0005556743274823071,
"Nucleotide GTR":0.0005550376145912458,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATA", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426322_New_York_20200312_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "GV", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GKT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426426_Minnesota_20200305_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCG", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426426_Minnesota_20200305_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426444_Washington_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553724183602559,
"Nucleotide GTR":0.0005547360514082111,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "F", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "TTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426444_Washington_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554638616999133,
"Nucleotide GTR":0.0005548273899685929,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "TTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553709249243271,
"Nucleotide GTR":0.0005547345596835176,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "V", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GTT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426507_Arizona_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":7.168689443405325e-05,
"Nucleotide GTR":7.160475284940777e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTT", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426507_Arizona_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555879524752818,
"Nucleotide GTR":0.0005549513385560066,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "I", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATA", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426667_Victoria_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553629323058687,
"Nucleotide GTR":0.0005547265762233076,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATT", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426667_Victoria_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000555512002103742,
"Nucleotide GTR":0.0005548754752113066,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTT", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426697_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005558336337443104,
"Nucleotide GTR":0.0005551967383140443,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCT", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426697_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426712_Victoria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001976173061345863,
"Nucleotide GTR":0.000197390868669169,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "V", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GTT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426712_Victoria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426716_Victoria_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005555043896992625,
"Nucleotide GTR":0.0005548678715294114,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "D", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAT", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426716_Victoria_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555165393525762,
"Nucleotide GTR":0.0005548800072611875,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "V", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GTT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553809835792142,
"Nucleotide GTR":0.0005547446068128141,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "T", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ACA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555120035200966,
"Nucleotide GTR":0.0005548754766260381,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAT", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426780_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "GC", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "KGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426780_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553809833046577,
"Nucleotide GTR":0.0005547446065385722,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACC", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426788_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "GV", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GKT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426788_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426801_Victoria_20200325_null_10":{
"Global MG94xREV":9.22715910396081e-05,
"Nucleotide GTR":9.216586272252034e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAT", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426801_Victoria_20200325_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426814_Victoria_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005555600142969416,
"Nucleotide GTR":0.0005549234323902997,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGT", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426814_Victoria_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426827_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "GV", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "D", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GKT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAT", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426827_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "GV", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GKT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426869_Victoria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426869_Victoria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426877_Victoria_20200328_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426877_Victoria_20200328_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426952_Victoria_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "N", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "AAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426952_Victoria_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_4":{
"Global MG94xREV":7.114040072538832e-05,
"Nucleotide GTR":7.105888533412972e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "L", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "TTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554127208026505,
"Nucleotide GTR":0.0005547763076705255,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "L", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "TTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427061_Victoria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":8.98901933504513e-05,
"Nucleotide GTR":8.978719372989032e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCT", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427061_Victoria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555466468416308,
"Nucleotide GTR":0.0005549100802519296,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "S", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "TCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005553888300481201,
"Nucleotide GTR":0.0005547524442909359,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "G", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "GGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427156_Victoria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554455616254506,
"Nucleotide GTR":0.0005548091108630563,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGC", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427156_Victoria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005552795785847372,
"Nucleotide GTR":0.0005546433180120567,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "L", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TTA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427172_Idaho_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553938474266351,
"Nucleotide GTR":0.0005547574559203466,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCG", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427172_Idaho_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427204_Washington_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553037413037104,
"Nucleotide GTR":0.000554667453044463,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "L", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "TTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427204_Washington_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427209_Washington_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555602925249909,
"Nucleotide GTR":0.0005549662941742565,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAA", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427209_Washington_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427246_Washington_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGT", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427246_Washington_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427388_Liege_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555512002103742,
"Nucleotide GTR":0.0005548754752113066,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "L", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CTA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427388_Liege_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427417_Doha_20200323_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "ND", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "RAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427417_Doha_20200323_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427476_New_York_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "F", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "TTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427476_New_York_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427601_New_York_20200316_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "D", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAT", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427601_New_York_20200316_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427620_Alaska_20200404_null_5":{
"Global MG94xREV":0.000555482409024409,
"Nucleotide GTR":0.0005548459160408557,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "L", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TTA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427620_Alaska_20200404_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427639_New_York_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555605442989735,
"Nucleotide GTR":0.0005549239617850347,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "F", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTT", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427639_New_York_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427641_New_York_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005557017592197653,
"Nucleotide GTR":0.0005550650148963706,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTA", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427641_New_York_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427683_New_South_Wales_20200323_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005554823495139221,
"Nucleotide GTR":0.0005548458565985589,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "I", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ATT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427683_New_South_Wales_20200323_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427690_New_South_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553882499311208,
"Nucleotide GTR":0.0005547518648386564,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCG", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427690_New_South_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427724_New_South_Wales_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555763259371127,
"Nucleotide GTR":0.000554939725339969,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAA", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427724_New_South_Wales_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427725_New_South_Wales_20200319_null_18":{
"Global MG94xREV":0.0005550519763030629,
"Nucleotide GTR":0.0005544159765257797,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTG", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427725_New_South_Wales_20200319_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005558130197347719,
"Nucleotide GTR":0.0005551761479248254,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "V", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GTC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428271_Wisconsin_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "I", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATT", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428271_Wisconsin_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428301_Wisconsin_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554239487579037,
"Nucleotide GTR":0.0005547875227603594,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "A", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "GCT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428301_Wisconsin_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555603198177122,
"Nucleotide GTR":0.000554923737560993,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTT", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428380_Connecticut_20200331_null_32":{
"Global MG94xREV":0.0005555940330224576,
"Nucleotide GTR":0.0005549574121358587,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "TTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428380_Connecticut_20200331_null_32",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428405_Connecticut_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554405450688382,
"Nucleotide GTR":0.000554804100054605,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACC", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428405_Connecticut_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555603204333563,
"Nucleotide GTR":0.000554923738175932,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "S", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "TCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428461_Guangdong_20200124_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005553937880234137,
"Nucleotide GTR":0.0005547573965851912,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "C", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TGT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428461_Guangdong_20200124_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_8":{
"Global MG94xREV":8.989008483644968e-05,
"Nucleotide GTR":8.978708534022813e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "I", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ATT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428695_Madrid_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554818216466836,
"Nucleotide GTR":0.0005548453293361694,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "I", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ATA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428695_Madrid_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428706_Madrid_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554824091672208,
"Nucleotide GTR":0.0005548459161835041,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "C", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "TGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428706_Madrid_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACC", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428771_New_York_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555580348350664,
"Nucleotide GTR":0.0005549214551965674,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTA", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428771_New_York_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428836_Singapore_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAR", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428836_Singapore_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428848_Singapore_20200415_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTT", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428848_Singapore_20200415_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428879_Sverdlovsk_Region_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005555821168119897,
"Nucleotide GTR":0.0005549455095794413,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "I", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATT", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428879_Sverdlovsk_Region_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428891_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "I", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATT", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428891_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428916_Chechen_Republic_20200326_null_33":{
"Global MG94xREV":0.0005554818282713948,
"Nucleotide GTR":0.0005548453359532897,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "L", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TTA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428916_Chechen_Republic_20200326_null_33",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428923_Sverdlovsk_Region_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005554821298826583,
"Nucleotide GTR":0.0005548456372189564,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "V", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GTC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428923_Sverdlovsk_Region_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429001_California_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005558381083867902,
"Nucleotide GTR":0.0005552012078293072,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "E", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAA", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429001_California_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429011_California_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555578608957031,
"Nucleotide GTR":0.0005549212814565107,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "M", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "ATG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429011_California_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429041_California_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555467452826083,
"Nucleotide GTR":0.0005548309769799128,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "F", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "TTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429041_California_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429061_California_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555149782671256,
"Nucleotide GTR":0.0005548784479644886,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "TTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429061_California_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429103_Guangzhou_20200209_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553932668618282,
"Nucleotide GTR":0.0005547568760207737,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "G", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GGT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429103_Guangzhou_20200209_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429117_Halland_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555600142832264,
"Nucleotide GTR":0.0005549234323765997,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "S", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "TCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429117_Halland_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429177_Bangkok_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "QL", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CWG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429177_Bangkok_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429206_Switzerland_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555455596771393,
"Nucleotide GTR":0.0005548191345103447,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGC", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429206_Switzerland_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429233_Abruzzo_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATM", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429233_Abruzzo_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429255_Kinshasa_20200405_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "Y", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "TAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429255_Kinshasa_20200405_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429257_Montevideo_20200319_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429257_Montevideo_20200319_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429328_Unknown_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553938552988405,
"Nucleotide GTR":0.0005547574637835328,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "A", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "GCT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429328_Unknown_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429370_Unknown_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555578591718699,
"Nucleotide GTR":0.0005549212797346519,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "I", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "ATA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429370_Unknown_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429568_Unknown_20200323_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005556379518753142,
"Nucleotide GTR":0.0005550012806648152,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "I", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATA", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429568_Unknown_20200323_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429621_Washington_20200328_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000555560429713678,
"Nucleotide GTR":0.0005549238473310358,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "S", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "TCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429621_Washington_20200328_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429622_Washington_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553715741676012,
"Nucleotide GTR":0.0005547352081828644,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGA", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429622_Washington_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429636_Washington_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001112326586383998,
"Nucleotide GTR":0.001111052040050665,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "T", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "V", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "ACA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "GTG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429636_Washington_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429643_USA_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555716773135223,
"Nucleotide GTR":0.000554935082042949,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "V", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAT", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GTT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429643_USA_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429650_Washington_20200402_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "S", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "A", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "TCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "GCT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429650_Washington_20200402_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429655_Washington_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "S", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "TCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429655_Washington_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429674_Minas_gerais_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005559559805468406,
"Nucleotide GTR":0.0005553189449269291,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "D", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GAC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429674_Minas_gerais_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429696_Minas_gerais_20200317_null_21":{
"Global MG94xREV":0.0005554924094359399,
"Nucleotide GTR":0.000554855904993532,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCT", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429696_Minas_gerais_20200317_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429702_Minas_gerais_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005555413890461083,
"Nucleotide GTR":0.0005549048284809914,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAT", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429702_Minas_gerais_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429708_Luxembourg_20200330_null_28":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "P", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CCC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429708_Luxembourg_20200330_null_28",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429774_Luxembourg_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554449719175326,
"Nucleotide GTR":0.0005548085218308475,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGC", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429774_Luxembourg_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429780_Luxembourg_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554924697738782,
"Nucleotide GTR":0.0005548559652623331,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "L", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CTA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429780_Luxembourg_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429785_Luxembourg_20200409_null_13":{
"Global MG94xREV":0.0005555600143035138,
"Nucleotide GTR":0.000554923432396865,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "Y", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "TAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429785_Luxembourg_20200409_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429799_Luxembourg_20200330_null_49":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429799_Luxembourg_20200330_null_49",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430031_Utah_20200315_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554018623769111,
"Nucleotide GTR":0.0005547654616867855,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAG", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430031_Utah_20200315_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430037_Utah_20200314_null_69":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "C", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "TGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430037_Utah_20200314_null_69",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430045_Utah_20200331_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "L", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TTA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430045_Utah_20200331_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430050_Utah_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554399548767609,
"Nucleotide GTR":0.0005548035105387929,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "CAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430050_Utah_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430129_Washington_20200306_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005554693001471347,
"Nucleotide GTR":0.0005548328221842336,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430129_Washington_20200306_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430137_Washington_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555200654825495,
"Nucleotide GTR":0.0005548835293507862,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "N", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "AAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430137_Washington_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430152_Washington_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554552064173174,
"Nucleotide GTR":0.0005548187446035513,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "S", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "TCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430152_Washington_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430153_Washington_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005553807440045088,
"Nucleotide GTR":0.0005547443675126225,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTT", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430153_Washington_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430200_Washington_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553034710652139,
"Nucleotide GTR":0.0005546671831156155,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCT", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430200_Washington_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430280_Washington_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "HPRL", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTC", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CNT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430280_Washington_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430290_Washington_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553073061572726,
"Nucleotide GTR":0.0005546710138132801,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACC", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430290_Washington_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553938478296473,
"Nucleotide GTR":0.0005547574563228966,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "V", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "GTA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430340_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555584519193303,
"Nucleotide GTR":0.0005549218718029197,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "T", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "ACA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430340_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554940977585017,
"Nucleotide GTR":0.0005548575913815493,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "S", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "L", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "TCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TTA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430366_New_York_20200408_null_117":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430366_New_York_20200408_null_117",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430379_New_York_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555276736663185,
"Nucleotide GTR":0.0005548911288168081,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAT", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430379_New_York_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430385_New_York_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "L", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TTA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430385_New_York_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430403_New_York_20200410_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "I", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ATT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430403_New_York_20200410_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430423_New_York_20200411_null_3":{
"Global MG94xREV":8.988987796276273e-05,
"Nucleotide GTR":8.978687870358514e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTT", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430423_New_York_20200411_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430432_New_York_20200413_null_25":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGT", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430432_New_York_20200413_null_25",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554010175336244,
"Nucleotide GTR":0.000554764617811553,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACC", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430467_West_Bengal_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555584795756006,
"Nucleotide GTR":0.0005549218994275007,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "A", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GCA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430467_West_Bengal_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430475_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAR", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430475_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430477_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGY", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430477_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "TI", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "AYA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430479_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "N", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "YTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "AAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430479_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430483_Victoria_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005554823497908031,
"Nucleotide GTR":0.0005548458568751215,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAT", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430483_Victoria_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "VF", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "KTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTY", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430498_Victoria_20200401_null_15":{
"Global MG94xREV":0.0005555120040720135,
"Nucleotide GTR":0.0005548754771773234,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAT", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430498_Victoria_20200401_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430552_Victoria_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555120044127329,
"Nucleotide GTR":0.0005548754775176527,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCT", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430552_Victoria_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430577_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "IV", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "RTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430577_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00111163696139198,
"Nucleotide GTR":0.001110363205257331,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "L", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "S", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TTA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "TCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430592_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "LF", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTK", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430592_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430601_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555533090545745,
"Nucleotide GTR":0.0005548965394893664,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "L", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CTT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430601_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "SL", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TYA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430610_Victoria_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554455616206922,
"Nucleotide GTR":0.0005548091108583033,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "H", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "CAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430610_Victoria_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430613_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "PA", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "SCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430613_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430619_Victoria_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "TI", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "AYT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430619_Victoria_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430660_Victoria_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005558125963788368,
"Nucleotide GTR":0.0005551757250539881,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "H", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAT", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430660_Victoria_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430662_Victoria_20200327_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGY", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430662_Victoria_20200327_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430665_Victoria_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "IF", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "WTT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430665_Victoria_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430671_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "YC", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TRT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430671_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "YAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAY", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTY", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "PL", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CYT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "LF", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "YTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "Y", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "TAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430741_Beijing_20200210_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0005555125849098635,
"Nucleotide GTR":0.0005548760573496265,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGT", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430741_Beijing_20200210_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430793_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554818277543831,
"Nucleotide GTR":0.0005548453354368717,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "F", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TTT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430793_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430805_Buenos_Aires_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005554824084203837,
"Nucleotide GTR":0.0005548459154375219,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAT", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430805_Buenos_Aires_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430810_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200407_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "C", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "TGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430810_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200407_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430815_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "HY", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "YAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430815_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430850_Halland_20200311_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005555426807310631,
"Nucleotide GTR":0.000554906118685883,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTT", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430850_Halland_20200311_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430911_Washington_20200408_null_15":{
"Global MG94xREV":0.0005555600145866567,
"Nucleotide GTR":0.0005549234326796825,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "L", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "TTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430911_Washington_20200408_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430921_Connecticut_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":7.114040146296572e-05,
"Nucleotide GTR":7.105888607086192e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "F", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "TTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430921_Connecticut_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "Y", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "TAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430966_Washington_20200402_null_1062":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430966_Washington_20200402_null_1062",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430976_Washington_20200403_null_7":{
"Global MG94xREV":8.989019337649977e-05,
"Nucleotide GTR":8.978719375590894e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "S", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "TCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430976_Washington_20200403_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431012_Kinshasa_20200407_null_11861":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431012_Kinshasa_20200407_null_11861",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431014_Alaska_20200317_null_486":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431014_Alaska_20200317_null_486",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431092_Cincinnati_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555606037316807,
"Nucleotide GTR":0.0005549240211496418,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "F", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431092_Cincinnati_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431782_Fujian_20200322_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTT", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431782_Fujian_20200322_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431916_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTW", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431916_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431950_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGY", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431950_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431951_Wales_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "TM", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "AYG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431951_Wales_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431970_Wales_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTR", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431970_Wales_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431974_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555823327719668,
"Nucleotide GTR":0.000555186444098438,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "Y", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "TAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431974_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432013_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "PS", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "YCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432013_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432016_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554668971978123,
"Nucleotide GTR":0.0005548304219883026,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTT", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432016_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432054_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554455021110418,
"Nucleotide GTR":0.0005548090514168408,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "A", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432054_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432115_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTK", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432115_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432416_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":4.92243409029617e-05,
"Nucleotide GTR":4.916793777102483e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTA", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432416_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432456_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATT", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432456_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432548_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555101283595483,
"Nucleotide GTR":0.0005548736036141209,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACG", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432548_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432999_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554673217154908,
"Nucleotide GTR":0.0005548308460195536,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATC", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432999_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553591321696304,
"Nucleotide GTR":0.0005547227804414107,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "L", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "TTA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553938478467752,
"Nucleotide GTR":0.0005547574563400054,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "A", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "GCT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433275_Scotland_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005561815802483774,
"Nucleotide GTR":0.0005555442861277023,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTA", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433275_Scotland_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433303_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554239555802157,
"Nucleotide GTR":0.0005547875295748535,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCG", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433303_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433336_Scotland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGW", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433336_Scotland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433348_Scotland_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555328590887829,
"Nucleotide GTR":0.0005548963082976163,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "H", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAT", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433348_Scotland_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433391_Scotland_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "V", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GTT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433391_Scotland_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555512585096459,
"Nucleotide GTR":0.0005548760575360084,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "I", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ATT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001111369272256624,
"Nucleotide GTR":0.001110095822850422,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "S", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "A", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "TCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GCC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433620_Scotland_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556074015750601,
"Nucleotide GTR":0.0005549707653702629,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAA", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433620_Scotland_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433625_Scotland_20200405_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0005557208791440404,
"Nucleotide GTR":0.0005550841129123062,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCA", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433625_Scotland_20200405_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433673_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554166465337554,
"Nucleotide GTR":0.0005547802289033787,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "F", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "TTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGC", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433673_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433687_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555605442840911,
"Nucleotide GTR":0.0005549239617701696,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "L", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "TTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433687_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433696_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555922398411577,
"Nucleotide GTR":0.0005549556210092543,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "V", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "GTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433696_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433771_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555600143000238,
"Nucleotide GTR":0.0005549234323933785,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "F", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "TTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433771_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433804_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "I", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ATT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433804_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433809_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554824092070082,
"Nucleotide GTR":0.0005548459162232453,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGT", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433809_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433853_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555464146510338,
"Nucleotide GTR":0.0005548276744526714,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "V", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GTT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433853_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433888_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554038222406805,
"Nucleotide GTR":0.0005547674193048683,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "S", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AGC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433888_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433904_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555846748469656,
"Nucleotide GTR":0.0005549480646833223,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433904_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433908_England_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000555597120458027,
"Nucleotide GTR":0.0005549604960337264,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "V", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GTT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433908_England_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433922_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555989641152911,
"Nucleotide GTR":0.0005549623375784579,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGT", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433922_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433981_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552753928820761,
"Nucleotide GTR":0.0005546391371055334,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "I", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATT", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433981_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434007_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553932668300698,
"Nucleotide GTR":0.0005547568759890505,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACG", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434007_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434084_Washington_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551610433826316,
"Nucleotide GTR":0.0005545249186321184,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "R", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "F", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CGT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "TTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434084_Washington_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434085_Washington_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553948549909406,
"Nucleotide GTR":0.0005547584623301462,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGT", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434085_Washington_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434119_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554602365011809,
"Nucleotide GTR":0.0005548237689237521,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "S", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "TCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434119_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434170_Washington_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553022837494058,
"Nucleotide GTR":0.0005546659971602798,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTC", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434170_Washington_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001111198675576537,
"Nucleotide GTR":0.001109925421646532,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "F", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "I", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "TTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "ATA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434226_Washington_20200401_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "F", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "TTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434226_Washington_20200401_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434241_Washington_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000555557861494511,
"Nucleotide GTR":0.0005549212820546322,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "I", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "ATA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434241_Washington_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434271_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "V", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GTT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434271_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434322_Washington_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005554969158988804,
"Nucleotide GTR":0.0005548604062927949,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGT", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434322_Washington_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434514_Luxembourg_20200416_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005555735392801096,
"Nucleotide GTR":0.0005549369418760245,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAA", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434514_Luxembourg_20200416_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434517_Louisiana_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555729490773695,
"Nucleotide GTR":0.0005549363523495608,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "K", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434517_Louisiana_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434544_Puerto_Rico_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555560429642426,
"Nucleotide GTR":0.0005549238472598646,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "N", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAT", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434544_Puerto_Rico_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553875683499144,
"Nucleotide GTR":0.0005547511840384317,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTT", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434657_Skane_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553932732851875,
"Nucleotide GTR":0.0005547568824367717,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTG", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434657_Skane_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434711_Kinshasa_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555445561487999,
"Nucleotide GTR":0.0005548091107257612,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAC", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434711_Kinshasa_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434772_Texas_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555600140646779,
"Nucleotide GTR":0.0005549234321583027,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACT", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434772_Texas_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434878_Texas_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555605443029205,
"Nucleotide GTR":0.0005549239617889769,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "L", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CTT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434878_Texas_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434946_Texas_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555600143035138,
"Nucleotide GTR":0.000554923432396865,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "I", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "ATA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434946_Texas_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435017_Texas_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554239487452812,
"Nucleotide GTR":0.0005547875227477512,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGG", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435017_Texas_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435025_Texas_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554455020835067,
"Nucleotide GTR":0.0005548090513893374,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAC", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435025_Texas_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435038_Louisiana_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553932668071,
"Nucleotide GTR":0.0005547568759661082,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "G", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GGT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435038_Louisiana_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435045_Nur_Sultan_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001111986053005099,
"Nucleotide GTR":0.001110711896867931,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "D", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACG", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GAT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435045_Nur_Sultan_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435052_Gujarat_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435052_Gujarat_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500, 501, 502, 503, 504, 505, 506, 507, 508, 509, 510, 511, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 518, 519, 520, 521, 522, 523, 524, 525, 526, 527, 528, 529, 530, 531, 532, 533, 534, 535, 536, 537, 538, 539, 540, 541, 542, 543, 544, 545, 546, 547, 548, 549, 550, 551, 552, 553, 554, 555, 556, 557, 558, 559, 560, 561, 562, 563, 564, 565, 566, 567, 568, 569, 570, 571, 572, 573, 574, 575, 576, 577, 578, 579, 580, 581, 582, 583, 584, 585, 586, 587, 588, 589, 590, 591, 592, 593, 594, 595, 596, 597, 598, 599, 600]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":12739.0439402622,
"Equilibrium frequencies": [
[0.0328951888990883],
[0.01229539663653806],
[0.01087168420025373],
[0.03956921523405863],
[0.02471442145090253],
[0.009237630928753625],
[0.008167984261480733],
[0.0297286714107637],
[0.01802579453208449],
[0.006737589929658692],
[0.005957428796431519],
[0.02168300494619554],
[0.02624144792754201],
[0.009808395129633406],
[0.008672658354412015],
[0.03156551264331027],
[0.01846170668032451],
[0.006900522958489694],
[0.006101495432718596],
[0.02220735826940531],
[0.01387042953302901],
[0.005184418704841962],
[0.004584102862809326],
[0.01668456786385804],
[0.01011658368498879],
[0.00378132526903089],
[0.003343476863623835],
[0.01216911319441556],
[0.01472743980864378],
[0.00550474765302333],
[0.004867340180626171],
[0.01771545490808901],
[0.033799208809764],
[0.012633296607357],
[0.01117045795132589],
[0.04065664958596754],
[0.02539361892081174],
[0.00949149790950528],
[0.008392455396913823],
[0.03054566963368652],
[0.01852117631003212],
[0.006922751214643694],
[0.006121149827641531],
[0.02227889355029423],
[0.02696261087584521],
[0.01007794775376225],
[0.008910998856268617],
[0.03243299062034141],
[0.01223859148489923],
[0.03938640411067278],
[0.02460023998122854],
[0.009194952758930943],
[0.008130247895727539],
[0.02959132393532797],
[0.006706462034483912],
[0.005929905272289714],
[0.02158282872412119],
[0.02612021154348615],
[0.009763080009744013],
[0.008632590377143992],
[0.0314196788987581]
],
"Log Likelihood":-5776.325035975844,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.5932123356632456, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":592
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":13754.32027333594,
"Equilibrium frequencies": [
[0.3033036294608271],
[0.186710447361645],
[0.1946693534757047],
[0.3153165697018231]
],
"Log Likelihood":-5893.061816387009,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2216740639226946,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1475162467694634,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.02118100405621862,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.663250430907636,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.9717146704422311
},
"display order":0,
"estimated parameters":983
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-02/sequences.helicase.compressed.fas",
"number of sequences":489,
"number of sites":601,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"((epi_isl_420328_Alken_20200306_null_1,epi_isl_430037_Utah_20200314_null_69)Node1,(epi_isl_421955_England_20200330_null_1,epi_isl_423675_England_20200320_null_3)Node973,epi_isl_418697_England_20200316_null_1,(epi_isl_423312_England_20200325_null_1,epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_4)Node192,epi_isl_434517_Louisiana_20200323_null_1,epi_isl_429780_Luxembourg_20200326_null_2,epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1,epi_isl_430379_New_York_20200407_null_2,epi_isl_427172_Idaho_20200329_null_1,epi_isl_433771_England_20200405_null_1,epi_isl_425435_England_20200401_null_4,epi_isl_427690_New_South_Wales_20200321_null_1,(epi_isl_426952_Victoria_20200328_null_1,epi_isl_430479_Victoria_20200331_null_1)Node215,epi_isl_428380_Connecticut_20200331_null_32,epi_isl_422372_Wales_20200328_null_1,epi_isl_430601_Victoria_20200408_null_1,(epi_isl_432013_Wales_20200331_null_1,epi_isl_430976_Washington_20200403_null_7)Node229,(epi_isl_423958_England_20200319_null_1,epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_1)Node232,(epi_isl_413523_Kerala_20200131_null_1,epi_isl_417261_England_20200306_null_1)Node731,(epi_isl_423404_England_20200330_null_1,epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_2)Node728,(epi_isl_422932_Zuid_Holland_20200323_null_8,epi_isl_423409_England_20200330_null_1)Node712,(epi_isl_420700_England_20200327_null_3,epi_isl_425693_Scotland_20200316_null_5)Node709,(epi_isl_417530_Luxembourg_20200318_null_1,epi_isl_421575_KZN_20200401_null_4)Node706,epi_isl_431970_Wales_20200301_null_1,epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1,epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1,epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1,epi_isl_430671_Victoria_20200404_null_1,epi_isl_430665_Victoria_20200402_null_1,epi_isl_430613_Victoria_20200410_null_1,epi_isl_430592_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_430577_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1,epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1,epi_isl_429233_Abruzzo_20200324_null_3,epi_isl_429177_Bangkok_20200328_null_1,epi_isl_428836_Singapore_20200408_null_1,epi_isl_427417_Doha_20200323_null_5,epi_isl_426780_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_2,epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_2,epi_isl_424154_England_20200320_null_1,epi_isl_424142_England_20200321_null_1,epi_isl_424131_England_20200321_null_1,epi_isl_424026_England_20200319_null_1,epi_isl_423967_England_20200320_null_1,epi_isl_423814_England_20200323_null_1,epi_isl_423593_England_20200402_null_1,epi_isl_423549_England_20200331_null_1,epi_isl_423531_England_20200326_null_1,epi_isl_423282_England_20200326_null_1,epi_isl_423247_England_20200325_null_1,epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_1,epi_isl_422304_Wales_20200324_null_1,epi_isl_422265_Wales_20200328_null_1,epi_isl_422119_Wales_20200327_null_1,epi_isl_422043_Wales_20200329_null_1,epi_isl_421892_England_20200327_null_1,epi_isl_421860_England_20200327_null_1,epi_isl_421827_England_20200324_null_2,epi_isl_420980_Wales_20200323_null_1,epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1,epi_isl_420917_Wales_20200315_null_1,epi_isl_420634_England_20200320_null_1,epi_isl_420528_England_20200327_null_1,epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1,epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1,epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1,epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1,epi_isl_430477_Victoria_20200331_null_1,(epi_isl_423569_England_20200331_null_1,epi_isl_430403_New_York_20200410_null_7)Node565,epi_isl_423907_England_20200318_null_3,epi_isl_423736_England_20200323_null_1,(epi_isl_423656_England_20200322_null_1,epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_10)Node333,epi_isl_420789_Illinois_20200301_null_1,(epi_isl_423155_England_20200323_null_1,epi_isl_422148_Wales_20200327_null_1,epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1,epi_isl_430366_New_York_20200408_null_117,epi_isl_431950_Wales_20200326_null_1,epi_isl_421866_England_20200327_null_1,epi_isl_432999_England_20200402_null_1,epi_isl_433922_England_20200411_null_1,(epi_isl_433391_Scotland_20200407_null_1,epi_isl_433908_England_20200411_null_2)Node315,epi_isl_433904_England_20200410_null_1)Node299,(epi_isl_432016_Wales_20200401_null_1,epi_isl_431782_Fujian_20200322_null_7)Node320,(epi_isl_419820_Victoria_20200317_null_1,epi_isl_425953_Scotland_20200326_null_2)Node329,(epi_isl_433673_England_20200403_null_2,epi_isl_425231_England_20200330_null_3)Node325,epi_isl_416671_Washington_20200312_null_3,epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_418368_Ontario_20200312_null_1,epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1,(epi_isl_420540_Estonia_20200301_null_1,epi_isl_428271_Wisconsin_20200320_null_1)Node112,epi_isl_420300_New_York_20200318_null_2,epi_isl_428695_Madrid_20200312_null_1,epi_isl_423147_England_20200323_null_1,epi_isl_429785_Luxembourg_20200409_null_13,epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1,epi_isl_433303_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_422178_Wales_20200330_null_2,epi_isl_419473_Wales_20200320_null_1,(epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_2,epi_isl_428848_Singapore_20200415_null_10)Node130,epi_isl_426697_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_428461_Guangdong_20200124_null_4,epi_isl_423304_England_20200325_null_2,epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1,epi_isl_434241_Washington_20200402_null_2,epi_isl_434946_Texas_20200329_null_1,epi_isl_435017_Texas_20200402_null_1,epi_isl_417231_England_20200303_null_1,epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_2,epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1,(epi_isl_417238_England_20200303_null_1,epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1)Node155,epi_isl_420623_ARA_20200324_null_2,epi_isl_428706_Madrid_20200321_null_2,epi_isl_422908_Zuid_Holland_20200317_null_4,epi_isl_429621_Washington_20200328_null_4,epi_isl_420932_Wales_20200321_null_3,epi_isl_424597_Reykjavik_20200327_null_4,epi_isl_428301_Wisconsin_20200325_null_2,epi_isl_430483_Victoria_20200331_null_4,epi_isl_431974_Wales_20200404_null_1,(epi_isl_425190_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2,epi_isl_429708_Luxembourg_20200330_null_28)Node173,epi_isl_419704_New_York_20200318_null_2,epi_isl_429103_Guangzhou_20200209_null_1,epi_isl_413749_China_20200201_null_1,epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_1,((epi_isl_422114_Wales_20200325_null_1,epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1)Node541,epi_isl_415149_England_20200301_null_1)Node540,((epi_isl_423779_England_20200323_null_1,epi_isl_429001_California_20200325_null_1,epi_isl_425163_Wisconsin_20200330_null_1,epi_isl_429799_Luxembourg_20200330_null_49)Node527,epi_isl_423954_England_20200320_null_2)Node526,((epi_isl_435052_Gujarat_20200413_null_1,epi_isl_419496_Wales_20200320_null_2)Node517,epi_isl_424846_Massachusetts_20200306_null_2)Node516,(epi_isl_419848_Victoria_20200317_null_1,((((epi_isl_418830_British_Columbia_20200309_null_1,epi_isl_422968_USA_20200301_null_2,epi_isl_430280_Washington_20200301_null_1)Node507,epi_isl_426869_Victoria_20200326_null_1)Node506,epi_isl_430129_Washington_20200306_null_4,epi_isl_434119_Washington_20200325_null_1,epi_isl_426667_Victoria_20200322_null_2,epi_isl_430153_Washington_20200331_null_4,epi_isl_418333_Ontario_20200310_null_1,(epi_isl_417107_Washington_20200305_null_2,epi_isl_424863_Georgia_20200301_null_1)Node498,epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_1,epi_isl_426120_Washington_20200325_null_1,epi_isl_430152_Washington_20200305_null_1,epi_isl_418883_Washington_20200314_null_1,epi_isl_424851_Illinois_20200307_null_1,epi_isl_430200_Washington_20200304_null_2,epi_isl_415592_Washington_20200309_null_1,epi_isl_430137_Washington_20200321_null_1,epi_isl_416682_USA_20200309_null_1,epi_isl_417368_USA_20200313_null_2,epi_isl_418890_Washington_20200316_null_1,epi_isl_421317_Wisconsin_20200324_null_1,(epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2,epi_isl_417150_Washington_20200228_null_1)Node483,(epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1,epi_isl_429650_Washington_20200402_null_6)Node480,epi_isl_426082_Washington_20200325_null_2,(epi_isl_413931_California_20200305_null_2,epi_isl_426426_Minnesota_20200305_null_5)Node476,epi_isl_434085_Washington_20200403_null_1,epi_isl_430966_Washington_20200402_null_1062,(epi_isl_434084_Washington_20200401_null_1,epi_isl_434226_Washington_20200401_null_9)Node471,epi_isl_429061_California_20200408_null_1,epi_isl_424852_District_of_Columbia_20200306_null_1,epi_isl_416679_Washington_20200311_null_1,epi_isl_426444_Washington_20200319_null_1,epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1,epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_429041_California_20200328_null_1,(epi_isl_417577_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_9)Node461,epi_isl_427204_Washington_20200327_null_1,epi_isl_434170_Washington_20200329_null_1,epi_isl_417117_Washington_20200303_null_1,epi_isl_417324_California_20200304_null_1,epi_isl_430290_Washington_20200302_null_1,epi_isl_423017_Washington_20200319_null_1,epi_isl_416689_Washington_20200314_null_2,epi_isl_424848_Arizona_20200309_null_1,epi_isl_424199_Washington_20200320_null_1,epi_isl_416670_Washington_20200312_null_1,epi_isl_424213_Washington_20200320_null_1,epi_isl_418939_Washington_20200317_null_1,epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1,epi_isl_418342_Ontario_20200311_null_1)Node400,epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_4)Node399,epi_isl_426877_Victoria_20200328_null_18)Node397,(epi_isl_425821_Scotland_20200311_null_2,epi_isl_427725_New_South_Wales_20200319_null_18)Node391,(epi_isl_433853_England_20200408_null_1,epi_isl_420078_Thies_20200320_null_1)Node388,(epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_2,epi_isl_430045_Utah_20200331_null_11)Node385,(epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1,epi_isl_430810_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200407_null_5)Node382,(epi_isl_423061_England_20200323_null_1,epi_isl_433625_Scotland_20200405_null_8,epi_isl_423091_England_20200324_null_1,epi_isl_422606_Netherlands_20200401_null_2,epi_isl_431014_Alaska_20200317_null_486,epi_isl_422003_England_20200331_null_1,epi_isl_423062_England_20200323_null_1,epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_423743_England_20200323_null_1,epi_isl_425255_England_20200331_null_1,epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1,epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1,(epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_7,epi_isl_424548_Reykjavik_20200301_null_2)Node363,epi_isl_421939_England_20200401_null_2)Node350,(epi_isl_419253_Hong_Kong_20200226_null_1,epi_isl_423121_England_20200324_null_1)Node379,epi_isl_434007_England_20200101_null_1,epi_isl_433687_England_20200101_null_1,epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2,epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2,epi_isl_430662_Victoria_20200327_null_7,epi_isl_429696_Minas_gerais_20200317_null_21,epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1,(epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1,epi_isl_429655_Washington_20200402_null_2)Node55,epi_isl_423339_England_20200327_null_1,(epi_isl_426788_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_429257_Montevideo_20200319_null_12)Node48,(epi_isl_423089_England_20200323_null_3,epi_isl_430432_New_York_20200413_null_25)Node51,(epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1,epi_isl_425332_England_20200329_null_4)Node522,epi_isl_423709_England_20200323_null_1,(epi_isl_432456_England_20200405_null_1,epi_isl_425289_England_20200321_null_2)Node536,epi_isl_426322_New_York_20200312_null_11,(epi_isl_433981_England_20200413_null_1,epi_isl_428891_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200325_null_4)Node546,epi_isl_429568_Unknown_20200323_null_7,(((epi_isl_423870_England_20200318_null_1,epi_isl_423888_England_20200318_null_2)Node553,epi_isl_422196_Wales_20200327_null_8)Node552,epi_isl_431951_Wales_20200405_null_1)Node551,(epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1,epi_isl_430385_New_York_20200408_null_1)Node559,epi_isl_422134_Wales_20200325_null_5,epi_isl_419416_Wales_20200317_null_1,epi_isl_418732_England_20200313_null_1,epi_isl_417242_England_20200303_null_1,epi_isl_421915_England_20200327_null_2,epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_418090_Wales_20200312_null_1,epi_isl_432115_Wales_20200407_null_1,(epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1,epi_isl_423426_England_20200330_null_1)Node589,(epi_isl_423453_England_20200329_null_7,epi_isl_424842_South_Carolina_20200307_null_3)Node585,epi_isl_421906_England_20200327_null_1,epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1,epi_isl_433336_Scotland_20200326_null_1,epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1,(epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1,epi_isl_427246_Washington_20200331_null_3)Node607,(epi_isl_426108_Washington_20200325_null_17,epi_isl_415517_Noord_Brabant_20200101_null_2,epi_isl_423385_England_20200328_null_1)Node599,(epi_isl_433804_England_20200406_null_1,epi_isl_422675_Netherlands_20200310_null_4)Node604,epi_isl_430050_Utah_20200331_null_1,epi_isl_418099_Wales_20200313_null_1,((epi_isl_416396_Shanghai_20200210_null_1,epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2)Node616,epi_isl_421880_England_20200326_null_2)Node615,epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1,epi_isl_424343_Rome_20200323_null_7,((epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_3,epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_18)Node65,epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_6)Node64,epi_isl_429702_Minas_gerais_20200322_null_4,(epi_isl_426507_Arizona_20200318_null_3,epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1)Node694,(epi_isl_423362_England_20200328_null_1,epi_isl_426801_Victoria_20200325_null_10)Node691,(epi_isl_418503_Hangzhou_20200122_null_1,epi_isl_422349_Wales_20200324_null_3)Node688,epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1,epi_isl_432548_England_20200329_null_1,epi_isl_429622_Washington_20200327_null_2,epi_isl_433275_Scotland_20200319_null_1,(epi_isl_413695_China_20200101_null_1,epi_isl_424868_Louisiana_20200309_null_1)Node677,epi_isl_418217_Mbour_20200313_null_1,epi_isl_428771_New_York_20200405_null_1,epi_isl_430850_Halland_20200311_null_4,epi_isl_421931_England_20200331_null_1,(epi_isl_434271_Washington_20200324_null_1,epi_isl_429643_USA_20200408_null_1)Node699,(epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_1,epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1)Node702,(epi_isl_422149_Wales_20200325_null_1,epi_isl_424435_Reykjavik_20200319_null_2)Node725,(epi_isl_416315_Hong_Kong_20200219_null_4,epi_isl_423145_England_20200324_null_1)Node722,(epi_isl_423687_England_20200323_null_1,epi_isl_424088_England_20200313_null_6)Node718,epi_isl_429636_Washington_20200407_null_1,epi_isl_429774_Luxembourg_20200323_null_1,epi_isl_422578_Netherlands_20200330_null_1,epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1,(epi_isl_423112_England_20200324_null_2,epi_isl_430423_New_York_20200411_null_3)Node735,(epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_8,epi_isl_430619_Victoria_20200408_null_2)Node738,(epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1,epi_isl_427061_Victoria_20200330_null_1)Node742,(epi_isl_406036_California_20200122_null_1,epi_isl_424146_England_20200321_null_1)Node745,(epi_isl_423346_England_20200327_null_1,epi_isl_430815_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200418_null_1)Node756,epi_isl_423875_England_20200318_null_2,(epi_isl_418731_England_20200313_null_2,epi_isl_429255_Kinshasa_20200405_null_11)Node751,epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_7,epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1,epi_isl_428879_Sverdlovsk_Region_20200319_null_3,epi_isl_418440_Lucerne_20200320_null_2,(epi_isl_431916_Wales_20200331_null_1,epi_isl_432416_Wales_20200331_null_1)Node764,epi_isl_434322_Washington_20200324_null_2,epi_isl_420006_Victoria_20200324_null_1,(epi_isl_423570_England_20200401_null_1,epi_isl_430921_Connecticut_20200406_null_1)Node771,epi_isl_434514_Luxembourg_20200416_null_3,(epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_425920_Scotland_20200323_null_8)Node776,epi_isl_431012_Kinshasa_20200407_null_11861,epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1,epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_1,epi_isl_427683_New_South_Wales_20200323_null_6,epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1,(epi_isl_426712_Victoria_20200326_null_1,epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2)Node783,(epi_isl_426827_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_427601_New_York_20200316_null_5)Node786,epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_5,epi_isl_425505_England_20200318_null_1,epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_423659_England_20200323_null_1,epi_isl_426716_Victoria_20200323_null_3,epi_isl_427724_New_South_Wales_20200319_null_1,epi_isl_428916_Chechen_Republic_20200326_null_33,epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1,epi_isl_426181_South_Korea_20200223_null_2,epi_isl_428405_Connecticut_20200411_null_2,epi_isl_421603_New_York_20200321_null_3,epi_isl_433348_Scotland_20200327_null_1,epi_isl_430475_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_433888_England_20200409_null_1,epi_isl_435045_Nur_Sultan_20200301_null_1,epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_1,epi_isl_429328_Unknown_20200315_null_1,epi_isl_422751_Netherlands_20200326_null_1,epi_isl_427639_New_York_20200406_null_2,epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1,epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4,epi_isl_426299_New_York_20200328_null_1,epi_isl_432054_Wales_20200331_null_1,epi_isl_433696_England_20200401_null_1,epi_isl_417948_Kinshasa_20200319_null_2,epi_isl_419801_Victoria_20200315_null_1,epi_isl_424661_Li_ge_20200405_null_2,epi_isl_427209_Washington_20200327_null_1,epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1,epi_isl_416349_Shanghai_20200130_null_1,epi_isl_434544_Puerto_Rico_20200323_null_1,epi_isl_420761_England_20200325_null_4,epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1,epi_isl_433620_Scotland_20200404_null_1,epi_isl_422987_Washington_20200318_null_16,(epi_isl_418974_New_York_20200317_null_1,epi_isl_427476_New_York_20200401_null_2)Node86,epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1,epi_isl_419887_Victoria_20200319_null_1,epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_2,epi_isl_425930_Scotland_20200325_null_5,epi_isl_417826_Reykjavik_20200316_null_3,epi_isl_434878_Texas_20200324_null_1,epi_isl_425900_Scotland_20200322_null_2,epi_isl_430805_Buenos_Aires_20200401_null_3,epi_isl_423399_England_20200329_null_3,epi_isl_427388_Liege_20200407_null_1,epi_isl_427620_Alaska_20200404_null_5,epi_isl_423598_England_20200321_null_1,epi_isl_429117_Halland_20200311_null_2,epi_isl_430340_New_York_20200330_null_1,epi_isl_424408_Reykjavik_20200319_null_1,epi_isl_427641_New_York_20200406_null_1,epi_isl_418116_Wales_20200313_null_1,epi_isl_424375_Reykjavik_20200301_null_1,epi_isl_430498_Victoria_20200401_null_15,epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1,epi_isl_423649_England_20200322_null_2,epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_430610_Victoria_20200408_null_2,epi_isl_423758_England_20200322_null_1,epi_isl_429674_Minas_gerais_20200311_null_1,epi_isl_430793_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200301_null_1,epi_isl_424148_England_20200320_null_1,epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_2,(epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1,epi_isl_417424_Kasterlee_20200304_null_1)Node897,epi_isl_418863_Komen_20200305_null_2,epi_isl_417518_Taoyuan_20200204_null_1,epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_3,epi_isl_430552_Victoria_20200330_null_2,epi_isl_418768_England_20200318_null_1,epi_isl_424144_England_20200321_null_1,epi_isl_430031_Utah_20200315_null_2,epi_isl_433809_England_20200407_null_1,epi_isl_435025_Texas_20200403_null_1,epi_isl_422297_Wales_20200329_null_7,epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1,epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1,epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_420756_England_20200327_null_2,epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1,epi_isl_425259_England_20200101_null_1,epi_isl_429370_Unknown_20200309_null_1,epi_isl_421665_India_20200310_null_1,epi_isl_430467_West_Bengal_20200403_null_1,epi_isl_434711_Kinshasa_20200408_null_1,epi_isl_422051_Wales_20200330_null_1,epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_2,epi_isl_428923_Sverdlovsk_Region_20200327_null_3,epi_isl_421730_New_York_20200318_null_1,epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_2,epi_isl_418101_Wales_20200315_null_1,epi_isl_421864_England_20200327_null_1,epi_isl_430911_Washington_20200408_null_15,epi_isl_434657_Skane_20200401_null_1,epi_isl_422080_Wales_20200329_null_1,epi_isl_430660_Victoria_20200327_null_2,epi_isl_429011_California_20200408_null_1,epi_isl_422091_Wales_20200328_null_8,epi_isl_426814_Victoria_20200325_null_3,epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1,epi_isl_421618_New_York_20200320_null_2,epi_isl_431092_Cincinnati_20200413_null_1,epi_isl_429206_Switzerland_20200407_null_1,(epi_isl_420026_Virginia_20200327_null_3,epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_5)Node958,epi_isl_425368_England_20200316_null_6,epi_isl_427156_Victoria_20200330_null_1,epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1,epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1,epi_isl_435038_Louisiana_20200413_null_1,epi_isl_420060_Ile_de_France_20200320_null_1,epi_isl_430741_Beijing_20200210_null_10,epi_isl_434772_Texas_20200318_null_2,epi_isl_425990_Scotland_20200330_null_2)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node1":"test",
"Node112":"test",
"Node130":"test",
"Node155":"test",
"Node173":"test",
"Node192":"test",
"Node215":"test",
"Node229":"test",
"Node232":"test",
"Node299":"test",
"Node315":"test",
"Node320":"test",
"Node325":"test",
"Node329":"test",
"Node333":"test",
"Node350":"test",
"Node363":"test",
"Node379":"test",
"Node382":"test",
"Node385":"test",
"Node388":"test",
"Node391":"test",
"Node397":"test",
"Node399":"test",
"Node400":"test",
"Node461":"test",
"Node471":"test",
"Node476":"test",
"Node48":"test",
"Node480":"test",
"Node483":"test",
"Node498":"test",
"Node506":"test",
"Node507":"test",
"Node51":"test",
"Node516":"test",
"Node517":"test",
"Node522":"test",
"Node526":"test",
"Node527":"test",
"Node536":"test",
"Node540":"test",
"Node541":"test",
"Node546":"test",
"Node55":"test",
"Node551":"test",
"Node552":"test",
"Node553":"test",
"Node559":"test",
"Node565":"test",
"Node585":"test",
"Node589":"test",
"Node599":"test",
"Node604":"test",
"Node607":"test",
"Node615":"test",
"Node616":"test",
"Node64":"test",
"Node65":"test",
"Node677":"test",
"Node688":"test",
"Node691":"test",
"Node694":"test",
"Node699":"test",
"Node702":"test",
"Node706":"test",
"Node709":"test",
"Node712":"test",
"Node718":"test",
"Node722":"test",
"Node725":"test",
"Node728":"test",
"Node731":"test",
"Node735":"test",
"Node738":"test",
"Node742":"test",
"Node745":"test",
"Node751":"test",
"Node756":"test",
"Node764":"test",
"Node771":"test",
"Node776":"test",
"Node783":"test",
"Node786":"test",
"Node86":"test",
"Node897":"test",
"Node958":"test",
"Node973":"test",
"epi_isl_406036_California_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_2":"test",
"epi_isl_413523_Kerala_20200131_null_1":"test",
"epi_isl_413695_China_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_413749_China_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_413931_California_20200305_null_2":"test",
"epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1":"test",
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_415149_England_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_415517_Noord_Brabant_20200101_null_2":"test",
"epi_isl_415592_Washington_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416315_Hong_Kong_20200219_null_4":"test",
"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1":"test",
"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4":"test",
"epi_isl_416349_Shanghai_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1":"test",
"epi_isl_416396_Shanghai_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_416670_Washington_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_416671_Washington_20200312_null_3":"test",
"epi_isl_416679_Washington_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_416682_USA_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_416689_Washington_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_417107_Washington_20200305_null_2":"test",
"epi_isl_417117_Washington_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2":"test",
"epi_isl_417150_Washington_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_417231_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417238_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417261_England_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_417324_California_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417368_USA_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_417424_Kasterlee_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417518_Taoyuan_20200204_null_1":"test",
"epi_isl_417530_Luxembourg_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417577_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417826_Reykjavik_20200316_null_3":"test",
"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_417948_Kinshasa_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_418090_Wales_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418099_Wales_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418101_Wales_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418116_Wales_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_7":"test",
"epi_isl_418217_Mbour_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418333_Ontario_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_418342_Ontario_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418368_Ontario_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418440_Lucerne_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_418503_Hangzhou_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_418697_England_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418731_England_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_418732_England_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418768_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418830_British_Columbia_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_418863_Komen_20200305_null_2":"test",
"epi_isl_418883_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418890_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418939_Washington_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418974_New_York_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1":"test",
"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_2":"test",
"epi_isl_419253_Hong_Kong_20200226_null_1":"test",
"epi_isl_419416_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419473_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419496_Wales_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_419704_New_York_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_419801_Victoria_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_419820_Victoria_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419848_Victoria_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419887_Victoria_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420006_Victoria_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420026_Virginia_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_420060_Ile_de_France_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420078_Thies_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_420300_New_York_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_420328_Alken_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_420528_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420540_Estonia_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_420623_ARA_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_420634_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420700_England_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_420756_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_420761_England_20200325_null_4":"test",
"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_420789_Illinois_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_420917_Wales_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_420932_Wales_20200321_null_3":"test",
"epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420980_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":"test",
"epi_isl_421317_Wisconsin_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421575_KZN_20200401_null_4":"test",
"epi_isl_421603_New_York_20200321_null_3":"test",
"epi_isl_421618_New_York_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_421665_India_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_421730_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421827_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_421860_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421864_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421866_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421880_England_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_421892_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421906_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421915_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_421931_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421939_England_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_421955_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422003_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_422043_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422051_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422080_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422091_Wales_20200328_null_8":"test",
"epi_isl_422114_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422119_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422134_Wales_20200325_null_5":"test",
"epi_isl_422148_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422149_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422178_Wales_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_422196_Wales_20200327_null_8":"test",
"epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422265_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422297_Wales_20200329_null_7":"test",
"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422349_Wales_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422372_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422578_Netherlands_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422606_Netherlands_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_422675_Netherlands_20200310_null_4":"test",
"epi_isl_422751_Netherlands_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_422908_Zuid_Holland_20200317_null_4":"test",
"epi_isl_422932_Zuid_Holland_20200323_null_8":"test",
"epi_isl_422968_USA_20200301_null_2":"test",
"epi_isl_422987_Washington_20200318_null_16":"test",
"epi_isl_423017_Washington_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423061_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423062_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423089_England_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_423091_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423112_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_423121_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423145_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423147_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423155_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423247_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423282_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423304_England_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_423312_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423339_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423346_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423362_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423385_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423399_England_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_423404_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423409_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423426_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423453_England_20200329_null_7":"test",
"epi_isl_423531_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423549_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423569_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423570_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_423593_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_423598_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_423649_England_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_423656_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423659_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423675_England_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423709_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423736_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423743_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423758_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423779_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423814_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423870_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423875_England_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_423888_England_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_423907_England_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_423954_England_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_423958_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423967_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424026_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424088_England_20200313_null_6":"test",
"epi_isl_424131_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424142_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424144_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424146_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424148_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424154_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_5":"test",
"epi_isl_424199_Washington_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424213_Washington_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_424343_Rome_20200323_null_7":"test",
"epi_isl_424375_Reykjavik_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_424408_Reykjavik_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424435_Reykjavik_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_9":"test",
"epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_7":"test",
"epi_isl_424548_Reykjavik_20200301_null_2":"test",
"epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_3":"test",
"epi_isl_424597_Reykjavik_20200327_null_4":"test",
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_424661_Li_ge_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_424842_South_Carolina_20200307_null_3":"test",
"epi_isl_424846_Massachusetts_20200306_null_2":"test",
"epi_isl_424848_Arizona_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_424851_Illinois_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_424852_District_of_Columbia_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_424863_Georgia_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_424868_Louisiana_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_2":"test",
"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_425163_Wisconsin_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_425190_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_425231_England_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_425255_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425259_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_425289_England_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_425332_England_20200329_null_4":"test",
"epi_isl_425368_England_20200316_null_6":"test",
"epi_isl_425435_England_20200401_null_4":"test",
"epi_isl_425505_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_425693_Scotland_20200316_null_5":"test",
"epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_425821_Scotland_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_425900_Scotland_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_425920_Scotland_20200323_null_8":"test",
"epi_isl_425930_Scotland_20200325_null_5":"test",
"epi_isl_425953_Scotland_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_425990_Scotland_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_426082_Washington_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_426108_Washington_20200325_null_17":"test",
"epi_isl_426120_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426181_South_Korea_20200223_null_2":"test",
"epi_isl_426299_New_York_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_426322_New_York_20200312_null_11":"test",
"epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_426426_Minnesota_20200305_null_5":"test",
"epi_isl_426444_Washington_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_426507_Arizona_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_426667_Victoria_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_426697_Victoria_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_426712_Victoria_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_426716_Victoria_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_426780_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426788_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426801_Victoria_20200325_null_10":"test",
"epi_isl_426814_Victoria_20200325_null_3":"test",
"epi_isl_426827_Victoria_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_426869_Victoria_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_426877_Victoria_20200328_null_18":"test",
"epi_isl_426952_Victoria_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_4":"test",
"epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427061_Victoria_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_5":"test",
"epi_isl_427156_Victoria_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_427172_Idaho_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_427204_Washington_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427209_Washington_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427246_Washington_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_427388_Liege_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_427417_Doha_20200323_null_5":"test",
"epi_isl_427476_New_York_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_427601_New_York_20200316_null_5":"test",
"epi_isl_427620_Alaska_20200404_null_5":"test",
"epi_isl_427639_New_York_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_427641_New_York_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_427683_New_South_Wales_20200323_null_6":"test",
"epi_isl_427690_New_South_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_427724_New_South_Wales_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_427725_New_South_Wales_20200319_null_18":"test",
"epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_428271_Wisconsin_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_428301_Wisconsin_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_428380_Connecticut_20200331_null_32":"test",
"epi_isl_428405_Connecticut_20200411_null_2":"test",
"epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_428461_Guangdong_20200124_null_4":"test",
"epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_8":"test",
"epi_isl_428695_Madrid_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_428706_Madrid_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_18":"test",
"epi_isl_428771_New_York_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_428836_Singapore_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_428848_Singapore_20200415_null_10":"test",
"epi_isl_428879_Sverdlovsk_Region_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_428891_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200325_null_4":"test",
"epi_isl_428916_Chechen_Republic_20200326_null_33":"test",
"epi_isl_428923_Sverdlovsk_Region_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_429001_California_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_429011_California_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_429041_California_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_429061_California_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_429103_Guangzhou_20200209_null_1":"test",
"epi_isl_429117_Halland_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_429177_Bangkok_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_429206_Switzerland_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_429233_Abruzzo_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_429255_Kinshasa_20200405_null_11":"test",
"epi_isl_429257_Montevideo_20200319_null_12":"test",
"epi_isl_429328_Unknown_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_429370_Unknown_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_429568_Unknown_20200323_null_7":"test",
"epi_isl_429621_Washington_20200328_null_4":"test",
"epi_isl_429622_Washington_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_429636_Washington_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_429643_USA_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_429650_Washington_20200402_null_6":"test",
"epi_isl_429655_Washington_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_429674_Minas_gerais_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_429696_Minas_gerais_20200317_null_21":"test",
"epi_isl_429702_Minas_gerais_20200322_null_4":"test",
"epi_isl_429708_Luxembourg_20200330_null_28":"test",
"epi_isl_429774_Luxembourg_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_429780_Luxembourg_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_429785_Luxembourg_20200409_null_13":"test",
"epi_isl_429799_Luxembourg_20200330_null_49":"test",
"epi_isl_430031_Utah_20200315_null_2":"test",
"epi_isl_430037_Utah_20200314_null_69":"test",
"epi_isl_430045_Utah_20200331_null_11":"test",
"epi_isl_430050_Utah_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430129_Washington_20200306_null_4":"test",
"epi_isl_430137_Washington_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_430152_Washington_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_430153_Washington_20200331_null_4":"test",
"epi_isl_430200_Washington_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_430280_Washington_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_430290_Washington_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_430340_New_York_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_430366_New_York_20200408_null_117":"test",
"epi_isl_430379_New_York_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_430385_New_York_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_6":"test",
"epi_isl_430403_New_York_20200410_null_7":"test",
"epi_isl_430423_New_York_20200411_null_3":"test",
"epi_isl_430432_New_York_20200413_null_25":"test",
"epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_1":"test",
"epi_isl_430467_West_Bengal_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_430475_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430477_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430479_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430483_Victoria_20200331_null_4":"test",
"epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_430498_Victoria_20200401_null_15":"test",
"epi_isl_430552_Victoria_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_430577_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430592_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430601_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430610_Victoria_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_430613_Victoria_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_430619_Victoria_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_430660_Victoria_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_430662_Victoria_20200327_null_7":"test",
"epi_isl_430665_Victoria_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_430671_Victoria_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_4":"test",
"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_10":"test",
"epi_isl_430741_Beijing_20200210_null_10":"test",
"epi_isl_430793_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_430805_Buenos_Aires_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_430810_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200407_null_5":"test",
"epi_isl_430815_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200418_null_1":"test",
"epi_isl_430850_Halland_20200311_null_4":"test",
"epi_isl_430911_Washington_20200408_null_15":"test",
"epi_isl_430921_Connecticut_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430966_Washington_20200402_null_1062":"test",
"epi_isl_430976_Washington_20200403_null_7":"test",
"epi_isl_431012_Kinshasa_20200407_null_11861":"test",
"epi_isl_431014_Alaska_20200317_null_486":"test",
"epi_isl_431092_Cincinnati_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_431782_Fujian_20200322_null_7":"test",
"epi_isl_431916_Wales_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_431950_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_431951_Wales_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_431970_Wales_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_431974_Wales_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_432013_Wales_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_432016_Wales_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_432054_Wales_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_432115_Wales_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_432416_Wales_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_432456_England_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_432548_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_432999_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_433275_Scotland_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_433303_Scotland_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_433336_Scotland_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_433348_Scotland_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_433391_Scotland_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_433620_Scotland_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_433625_Scotland_20200405_null_8":"test",
"epi_isl_433673_England_20200403_null_2":"test",
"epi_isl_433687_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_433696_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_433771_England_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_433804_England_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_433809_England_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_433853_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_433888_England_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_433904_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_433908_England_20200411_null_2":"test",
"epi_isl_433922_England_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_433981_England_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_434007_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_434084_Washington_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_434085_Washington_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_434119_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_434170_Washington_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_434226_Washington_20200401_null_9":"test",
"epi_isl_434241_Washington_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_434271_Washington_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_434322_Washington_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_434514_Luxembourg_20200416_null_3":"test",
"epi_isl_434517_Louisiana_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_434544_Puerto_Rico_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_434657_Skane_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_434711_Kinshasa_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_434772_Texas_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_434878_Texas_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_434946_Texas_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_435017_Texas_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_435025_Texas_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_435038_Louisiana_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_435045_Nur_Sultan_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_435052_Gujarat_20200413_null_1":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":23
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":16
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":40
}
}
}