{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001712522015623402],
[159.9061510227987, 409.3372219335709, 0, 1, 0.2809099914370982, 0, 0.002442973534818889, 0.01295169768179571, 0.7190900085629017, 1, 0.001713043670956473],
[159.8404897388643, 409.4028832175052, 0, 1, 0.2807946430868955, 0, 0.002442581723267263, 0.01294962044899209, 0.7192053569131045, 1, 0.001712291546057094],
[159.8404897388643, 409.4028832175052, 0, 1, 0.2807946430868955, 0, 0.002442581723267263, 0.01294962044899209, 0.7192053569131045, 1, 0.001715105549100956],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001712076786477532],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001712009655497943],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001712291475328213],
[160.0461706938087, 409.3189427750929, 0, 1, 0.2810958502861456, 0, 0.002443082631896337, 0.01295227607216504, 0.7189041497138544, 1, 0.001712393107857954],
[160.096628886353, 409.1467440700166, 1, 0, 0.2812446073019524, 0.006246227712326568, 0, -0.03311507547203356, 1, 0.2812446073019523, 0.001712736874546639],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.00171263089672035],
[160.1711630368383, 409.0722099195312, 1, 0, 0.2813755427752953, 0.006243321088765563, 0, -0.03309966568183306, 1, 0.2813755427752953, 0.001712009667750091],
[160.2066531706851, 408.8903412484339, 0, 1, 0.2815102781103406, 0, 0.002445643487069848, 0.01296585273255102, 0.7184897218896594, 1, 0.001712245415444037],
[159.9743263070435, 409.7311304258532, 0, 1, 0.280801815072041, 0, 0.002440624901897623, 0.01293924614143794, 0.719198184927959, 1, 0.001713221645661742],
[160.2066531706851, 408.8903412484339, 0, 1, 0.2815102781103405, 0, 0.002445643487069848, 0.01296585273255102, 0.7184897218896595, 1, 0.001712630941569044],
[160.2090792603112, 409.0342936960583, 0, 1, 0.2814421508822566, 0, 0.002444782785726693, 0.01296128962802616, 0.7185578491177433, 1, 0.001712153698084413],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001711545720024159],
[159.8404897388643, 409.4028832175052, 0, 1, 0.2807946430868955, 0, 0.002442581723267263, 0.01294962044899209, 0.7192053569131045, 1, 0.001712321493813496],
[159.6488099611335, 409.4909854878288, 0, 6, 0.2805089562138166, 0, 0.0146523372006643, 0.07768100597487713, 0.138724239705285, 1, 0.01042570263316689],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[159.8404897388643, 409.4028832175052, 0, 1, 0.2807946430868955, 0, 0.002442581723267263, 0.01294962044899209, 0.7192053569131045, 1, 0.001712630921549686],
[160.0247844995878, 409.1806722333089, 0, 1, 0.2811371229961354, 0, 0.002443908199627314, 0.01295665291191179, 0.7188628770038646, 1, 0.001712291569105502],
[160.3404897388643, 409.4258600236822, 0, 1, 0.2814144601654471, 0, 0.002442444646613571, 0.01294889372176703, 0.7185855398345529, 1, 0.001712845729442103],
[159.8784059623372, 409.3649669940323, 1, 0, 0.2808612511938568, 0.006254753379487481, 0, -0.03316027525092184, 1, 0.2808612511938569, 0.001712076781062777],
[159.9345182669554, 409.3088546894141, 1, 0, 0.2809598246815494, 0.006252558927465836, 0, -0.03314864111786373, 1, 0.2809598246815495, 0.001712630921549686],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001713043670961661],
[160.0461706938087, 409.3189427750929, 0, 1, 0.2810958502861456, 0, 0.002443082631896337, 0.01295227607216504, 0.7189041497138544, 1, 0.001712813135444603],
[159.8404897388643, 409.3372219335709, 0, 1, 0.280827036022193, 0, 0.002442973534818889, 0.01295169768179571, 0.7191729639778071, 1, 0.001712245411686048],
[160.1711630368383, 409.0722099195312, 1, 0, 0.2813755427752953, 0.006243321088765563, 0, -0.03309966568183306, 1, 0.2813755427752953, 0.001712009659363555],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001712630951834945],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.00171176688869307],
[159.8404897388643, 409.4028832175052, 0, 1, 0.2807946430868955, 0, 0.002442581723267263, 0.01294962044899209, 0.7192053569131045, 1, 0.001727193256436756],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001711991244733803],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001712630932066511],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001712080071166823],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001712845749769113],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001712630921808743],
[159.8784059623372, 409.3649669940324, 1, 0, 0.2808612511938567, 0.006254753379487481, 0, -0.03316027525092184, 1, 0.2808612511938567, 0.00171263097447026],
[159.8404897388643, 409.4028832175052, 0, 1, 0.2807946430868955, 0, 0.002442581723267263, 0.01294962044899209, 0.7192053569131045, 1, 0.001712076795451588],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001713252994748418],
[159.9529401128226, 409.290432843547, 1, 0, 0.2809921866671998, 0.006251838817683822, 0, -0.03314482337523925, 1, 0.2809921866671998, 0.001711991224543465],
[159.8909479314086, 409.352425024961, 0, 1, 0.2808832838949249, 0, 0.002442882804319587, 0.01295121666389652, 0.7191167161050751, 1, 0.001711479049657725],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001712813128950687],
[159.8404897388643, 409.4028832175052, 0, 1, 0.2807946430868955, 0, 0.002442581723267263, 0.01294962044899209, 0.7192053569131045, 1, 0.001713011602503467],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001713043669882153],
[160.2090792603112, 409.0342936960583, 0, 1, 0.2814421508822566, 0, 0.002444782785726693, 0.01296128962802616, 0.7185578491177433, 1, 0.001711991241171585],
[159.744569394158, 409.3145088014881, 1, 0, 0.2807170213340078, 0.006259993712415809, 0, -0.03318805746258821, 1, 0.2807170213340078, 0.001712441945788054],
[159.996417255431, 409.2469557009385, 0, 1, 0.2810685637401249, 0, 0.002443512373322968, 0.01295455439444719, 0.7189314362598751, 1, 0.001713043677164771],
[159.6586210677669, 409.5847518886026, 0, 1, 0.2804751511441912, 0, 0.002441497139209851, 0.01294387040519428, 0.7195248488558088, 1, 0.001712291563247341],
[159.8404897388643, 409.4028832175052, 0, 1, 0.2807946430868955, 0, 0.002442581723267263, 0.01294962044899209, 0.7192053569131045, 1, 0.001712845730621799],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001712441691395773],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001712066452642213],
[160.3311996002906, 409.5008114461903, 1, 1, 0.2813657297101417, 0.006237089240852829, 0.002441997603053354, -0.02012010317219163, 0.9208333261446795, 0.4835647855649629, 0.003452182013438504],
[160.096628886353, 409.0281105932276, 1, 0, 0.2813032324561196, 0.006246227712326568, 0, -0.03311507547203356, 1, 0.2813032324561195, 0.001713043702267259],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001712630899465971],
[160.0461706938087, 409.3739998805988, 0, 1, 0.2810686711929448, 0, 0.002442754059348341, 0.01295053410801867, 0.7189313288070551, 1, 0.00171281316405086],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001712215112727413],
[159.8784059623372, 409.3649669940324, 1, 0, 0.2808612511938567, 0.006254753379487481, 0, -0.03316027525092184, 1, 0.2808612511938567, 0.00171249292705863],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001711991236634095],
[159.5247844995878, 409.7185884567818, 0, 1, 0.2802400380545401, 0, 0.002440699612303489, 0.01293964222701835, 0.7197599619454599, 1, 0.00171229155367692],
[160.0461706938087, 409.659286039088, 0, 1, 0.2809279230211858, 0, 0.002441052928810173, 0.01294151537403175, 0.7190720769788141, 1, 0.001712845765072473],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001712080032670329],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001712630953662003],
[160.0247844995878, 409.1806722333089, 0, 1, 0.2811371229961354, 0, 0.002443908199627314, 0.01295665291191179, 0.7188628770038646, 1, 0.001712630966696035],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001712630965133187],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001712076789831754],
[160.0247844995878, 409.1806722333089, 0, 1, 0.2811371229961354, 0, 0.002443908199627314, 0.01295665291191179, 0.7188628770038646, 1, 0.001712813127332576],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001712630902060832],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001713043697852033],
[160.0966288863529, 409.0281105932275, 1, 0, 0.2813032324561197, 0.006246227712326569, 0, -0.03311507547203357, 1, 0.2813032324561197, 0.001712975680964007],
[160.4868682761149, 408.7565046802546, 1, 0, 0.2819301478076507, 0.006231039403669572, 0, -0.0330345529533818, 1, 0.2819301478076507, 0.001715072950574996],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001712291563609049],
[159.9529401128226, 409.290432843547, 1, 0, 0.2809921866671998, 0.006251838817683822, 0, -0.03314482337523925, 1, 0.2809921866671998, 0.001711877993269372],
[159.6586210677669, 409.5847518886026, 0, 1, 0.2804751511441912, 0, 0.002441497139209851, 0.01294387040519428, 0.7195248488558088, 1, 0.001712630921549686],
[159.9529401128226, 409.409066320336, 1, 0, 0.2809336385384553, 0.006251838817683821, 0, -0.03314482337523924, 1, 0.2809336385384553, 0.001711479082819871],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001715105571283491],
[160.0531517437445, 409.1902212126251, 0, 1, 0.2811682302290271, 0, 0.002443851167890876, 0.01295635055177646, 0.7188317697709729, 1, 0.001711622839910738],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001711991257297624],
[159.8784059623372, 409.3649669940323, 1, 0, 0.2808612511938568, 0.006254753379487481, 0, -0.03316027525092184, 1, 0.2808612511938569, 0.001712291656845684],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.00171912298333362],
[159.9061510227987, 409.3372219335709, 0, 1, 0.2809099914370982, 0, 0.002442973534818889, 0.01295169768179571, 0.7190900085629017, 1, 0.001712076780432674],
[159.8784059623372, 409.3649669940323, 1, 0, 0.2808612511938567, 0.006254753379487481, 0, -0.03316027525092185, 1, 0.2808612511938567, 0.001712630921549686],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001713043698932959],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.00171176693433603],
[160.0461706938087, 409.3189427750929, 0, 1, 0.2810958502861456, 0, 0.002443082631896337, 0.01295227607216504, 0.7189041497138544, 1, 0.001712845744765894],
[159.658621067767, 409.5847518886026, 0, 1, 0.2804751511441912, 0, 0.002441497139209851, 0.01294387040519428, 0.7195248488558088, 1, 0.001712630916580493],
[160.2090792603112, 409.0342936960583, 0, 1, 0.2814421508822566, 0, 0.002444782785726693, 0.01296128962802616, 0.7185578491177433, 1, 0.001711991238723523],
[159.9529401128226, 409.290432843547, 1, 0, 0.2809921866671998, 0.006251838817683822, 0, -0.03314482337523925, 1, 0.2809921866671998, 0.001711766937085225],
[160.0461706938087, 409.659286039088, 0, 1, 0.2809279230211858, 0, 0.002441052928810173, 0.01294151537403175, 0.7190720769788141, 1, 0.001712813147882895],
[159.658621067767, 409.5847518886026, 0, 1, 0.2804751511441912, 0, 0.002441497139209851, 0.01294387040519428, 0.7195248488558088, 1, 0.001713043707533784],
[159.6586210677669, 409.5847518886026, 0, 1, 0.2804751511441912, 0, 0.002441497139209851, 0.01294387040519428, 0.7195248488558088, 1, 0.001712630966696035],
[159.8404897388643, 409.4028832175052, 0, 1, 0.2807946430868955, 0, 0.002442581723267263, 0.01294962044899209, 0.7192053569131045, 1, 0.001712845722094603],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001712076790060475],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001712630921549686],
[160.3404897388643, 409.4258600236822, 0, 1, 0.2814144601654471, 0, 0.002442444646613571, 0.01294889372176703, 0.7185855398345529, 1, 0.001720175425261531],
[159.8404897388643, 409.4028832175052, 0, 1, 0.2807946430868955, 0, 0.002442581723267263, 0.01294962044899209, 0.7192053569131045, 1, 0.001712281320451571],
[160.1586210677669, 409.0847518886026, 0, 1, 0.2813535100742272, 0, 0.002444481236182347, 0.01295969092935882, 0.7186464899257728, 1, 0.00171319403479458],
[159.8404897388643, 409.4028832175052, 0, 1, 0.2807946430868955, 0, 0.002442581723267263, 0.01294962044899209, 0.7192053569131045, 1, 0.001712845754981526],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001711766868940496],
[159.6586210677669, 409.5847518886026, 0, 1, 0.2804751511441912, 0, 0.002441497139209851, 0.01294387040519428, 0.7195248488558088, 1, 0.001712630919303819],
[160.1434179763769, 409.0999549799927, 0, 1, 0.2813268025320539, 0, 0.002444390393660409, 0.01295920931755909, 0.7186731974679461, 1, 0.001711479089859915],
[159.6586210677669, 409.5847518886026, 0, 1, 0.2804751511441912, 0, 0.002441497139209851, 0.01294387040519428, 0.7195248488558088, 1, 0.001713011626513136],
[160.3909479314086, 408.6681302642375, 2, 1, 0.2818528937979005, 0.01246953163999818, 0.002446973291882139, -0.05313571509180522, 0.9776093091163921, 0.193541779459536, 0.005174428425209953],
[159.8404897388643, 409.4028832175052, 0, 1, 0.2807946430868955, 0, 0.002442581723267263, 0.01294962044899209, 0.7192053569131045, 1, 0.00171305104053747]
],
"NAMES": [
["epi_isl_432600_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_429023_California_20200331_null_2"],
["epi_isl_430803_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200401_null_6"],
["epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1"],
["epi_isl_424636_Li_ge_20200403_null_1"],
["epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1"],
["epi_isl_430399_New_York_20200410_null_8"],
["epi_isl_419986_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_421393_New_York_20200318_null_2"],
["epi_isl_434632_Occitanie_20200409_null_1"],
["epi_isl_420640_England_20200323_null_3"],
["epi_isl_424018_England_20200312_null_8"],
["epi_isl_430916_USA_20200407_null_3"],
["epi_isl_427245_Washington_20200401_null_3"],
["epi_isl_430228_Washington_20200323_null_1"],
["epi_isl_423992_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_421789_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1"],
["epi_isl_431011_Kinshasa_20200407_null_14969"],
["epi_isl_418697_England_20200316_null_2"],
["epi_isl_429627_Washington_20200327_null_2"],
["epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1"],
["epi_isl_424348_Mexico_City_20200313_null_1"],
["epi_isl_427674_New_South_Wales_20200322_null_1"],
["epi_isl_418081_Washington_20200315_null_2"],
["epi_isl_423389_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_424325_Washington_20200324_null_3"],
["epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_10"],
["epi_isl_427634_New_York_20200406_null_1"],
["epi_isl_422600_Netherlands_20200401_null_2"],
["epi_isl_428349_Ile_De_France_20200323_null_2"],
["epi_isl_433576_Scotland_20200402_null_2"],
["epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1"],
["epi_isl_422197_Wales_20200329_null_2"],
["epi_isl_430909_USA_20200408_null_1"],
["epi_isl_426025_New_York_20200303_null_1"],
["epi_isl_427305_Santa_Catarina_20200310_null_1"],
["epi_isl_422656_Netherlands_20200318_null_2"],
["epi_isl_426843_Victoria_20200324_null_4"],
["epi_isl_418307_Derbyshire_20200324_null_2"],
["epi_isl_421482_Portugal_20200318_null_1"],
["epi_isl_424090_England_20200313_null_2"],
["epi_isl_428677_Madrid_20200311_null_1"],
["epi_isl_434248_Washington_20200401_null_1"],
["epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_1"],
["epi_isl_430354_New_York_20200403_null_9"],
["epi_isl_420031_Kinshasa_20200321_null_1"],
["epi_isl_420805_Utah_20200314_null_4"],
["epi_isl_432385_Wales_20200401_null_1"],
["epi_isl_420498_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_414008_England_20200227_null_1"],
["epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1"],
["epi_isl_434249_Washington_20200402_null_1"],
["epi_isl_420701_England_20200327_null_3"],
["epi_isl_423898_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_426787_Victoria_20200323_null_2"],
["epi_isl_433057_England_20200404_null_1"],
["epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_430482_Victoria_20200331_null_3"],
["epi_isl_417554_Reykjavik_20200316_null_2"],
["epi_isl_420388_Vilvoorde_20200324_null_1"],
["epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_3"],
["epi_isl_426028_New_York_20200304_null_2"],
["epi_isl_427387_Liege_20200407_null_2"],
["epi_isl_422717_Netherlands_20200322_null_5"],
["epi_isl_428720_Ankara_20200321_null_1"],
["epi_isl_429013_California_20200328_null_2"],
["epi_isl_427480_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_422958_Zuid_Holland_20200329_null_13"],
["epi_isl_428704_Madrid_20200311_null_3"],
["epi_isl_421731_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_420318_Arbre_20200307_null_1"],
["epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1"],
["epi_isl_429694_Minas_gerais_20200318_null_1"],
["epi_isl_433296_Scotland_20200323_null_1"],
["epi_isl_421177_Madrid_20200327_null_1"],
["epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1"],
["epi_isl_430593_Victoria_20200408_null_3"],
["epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1"],
["epi_isl_424210_Washington_20200320_null_1"],
["epi_isl_434385_Antwerp_20200411_null_1"],
["epi_isl_427481_New_York_20200401_null_2"],
["epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2"],
["epi_isl_429470_Unknown_20200323_null_1"],
["epi_isl_428918_Novosibirsk_Region_20200327_null_5"],
["epi_isl_430849_Halland_20200311_null_1"],
["epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1"],
["epi_isl_427091_Victoria_20200403_null_2"],
["epi_isl_433360_Scotland_20200328_null_1"],
["epi_isl_427002_Victoria_20200327_null_2"],
["epi_isl_422115_Wales_20200330_null_2"],
["epi_isl_424485_Reykjavik_20200320_null_5"],
["epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1"],
["epi_isl_415537_Wales_20200308_null_1"],
["epi_isl_423085_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_430132_Washington_20200317_null_20"],
["epi_isl_434666_Vasterbotten_20200408_null_1"],
["epi_isl_425440_England_20200101_null_2"],
["epi_isl_425707_Scotland_20200317_null_6"],
["epi_isl_429571_Unknown_20200326_null_1"],
["epi_isl_421980_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_424171_Washington_20200319_null_1"],
["epi_isl_426867_Victoria_20200326_null_1"]
],
"RESOLVED": [
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001712522015623402],
[159.9061510227987, 409.3372219335709, 0, 1, 0.2809099914370982, 0, 0.002442973534818889, 0.01295169768179571, 0.7190900085629017, 1, 0.001713043670956473],
[159.8404897388643, 409.4028832175052, 0, 1, 0.2807946430868955, 0, 0.002442581723267263, 0.01294962044899209, 0.7192053569131045, 1, 0.001712291546057094],
[159.8404897388643, 409.4028832175052, 0, 1, 0.2807946430868955, 0, 0.002442581723267263, 0.01294962044899209, 0.7192053569131045, 1, 0.001715105549100956],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001712076786477532],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001712009655497943],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001712291475328213],
[160.0461706938087, 409.3189427750929, 0, 1, 0.2810958502861456, 0, 0.002443082631896337, 0.01295227607216504, 0.7189041497138544, 1, 0.001712393107857954],
[160.096628886353, 409.1467440700166, 1, 0, 0.2812446073019524, 0.006246227712326568, 0, -0.03311507547203356, 1, 0.2812446073019523, 0.001712736874546639],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.00171263089672035],
[160.1711630368383, 409.0722099195312, 1, 0, 0.2813755427752953, 0.006243321088765563, 0, -0.03309966568183306, 1, 0.2813755427752953, 0.001712009667750091],
[160.2066531706851, 408.8903412484339, 0, 1, 0.2815102781103406, 0, 0.002445643487069848, 0.01296585273255102, 0.7184897218896594, 1, 0.001712245415444037],
[159.9743263070435, 409.7311304258532, 0, 1, 0.280801815072041, 0, 0.002440624901897623, 0.01293924614143794, 0.719198184927959, 1, 0.001713221645661742],
[160.2066531706851, 408.8903412484339, 0, 1, 0.2815102781103405, 0, 0.002445643487069848, 0.01296585273255102, 0.7184897218896595, 1, 0.001712630941569044],
[160.2090792603112, 409.0342936960583, 0, 1, 0.2814421508822566, 0, 0.002444782785726693, 0.01296128962802616, 0.7185578491177433, 1, 0.001712153698084413],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001711545720024159],
[159.8404897388643, 409.4028832175052, 0, 1, 0.2807946430868955, 0, 0.002442581723267263, 0.01294962044899209, 0.7192053569131045, 1, 0.001712321493813496],
[159.6488099611335, 409.4909854878288, 0, 6, 0.2805089562138166, 0, 0.0146523372006643, 0.07768100597487713, 0.138724239705285, 1, 0.01042570263316689],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[159.8404897388643, 409.4028832175052, 0, 1, 0.2807946430868955, 0, 0.002442581723267263, 0.01294962044899209, 0.7192053569131045, 1, 0.001712630921549686],
[160.0247844995878, 409.1806722333089, 0, 1, 0.2811371229961354, 0, 0.002443908199627314, 0.01295665291191179, 0.7188628770038646, 1, 0.001712291569105502],
[160.3404897388643, 409.4258600236822, 0, 1, 0.2814144601654471, 0, 0.002442444646613571, 0.01294889372176703, 0.7185855398345529, 1, 0.001712845729442103],
[159.8784059623372, 409.3649669940323, 1, 0, 0.2808612511938568, 0.006254753379487481, 0, -0.03316027525092184, 1, 0.2808612511938569, 0.001712076781062777],
[159.9345182669554, 409.3088546894141, 1, 0, 0.2809598246815494, 0.006252558927465836, 0, -0.03314864111786373, 1, 0.2809598246815495, 0.001712630921549686],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001713043670961661],
[160.0461706938087, 409.3189427750929, 0, 1, 0.2810958502861456, 0, 0.002443082631896337, 0.01295227607216504, 0.7189041497138544, 1, 0.001712813135444603],
[159.8404897388643, 409.3372219335709, 0, 1, 0.280827036022193, 0, 0.002442973534818889, 0.01295169768179571, 0.7191729639778071, 1, 0.001712245411686048],
[160.1711630368383, 409.0722099195312, 1, 0, 0.2813755427752953, 0.006243321088765563, 0, -0.03309966568183306, 1, 0.2813755427752953, 0.001712009659363555],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001712630951834945],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.00171176688869307],
[159.8404897388643, 409.4028832175052, 0, 1, 0.2807946430868955, 0, 0.002442581723267263, 0.01294962044899209, 0.7192053569131045, 1, 0.001727193256436756],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001711991244733803],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001712630932066511],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001712080071166823],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001712845749769113],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001712630921808743],
[159.8784059623372, 409.3649669940324, 1, 0, 0.2808612511938567, 0.006254753379487481, 0, -0.03316027525092184, 1, 0.2808612511938567, 0.00171263097447026],
[159.8404897388643, 409.4028832175052, 0, 1, 0.2807946430868955, 0, 0.002442581723267263, 0.01294962044899209, 0.7192053569131045, 1, 0.001712076795451588],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001713252994748418],
[159.9529401128226, 409.290432843547, 1, 0, 0.2809921866671998, 0.006251838817683822, 0, -0.03314482337523925, 1, 0.2809921866671998, 0.001711991224543465],
[159.8909479314086, 409.352425024961, 0, 1, 0.2808832838949249, 0, 0.002442882804319587, 0.01295121666389652, 0.7191167161050751, 1, 0.001711479049657725],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001712813128950687],
[159.8404897388643, 409.4028832175052, 0, 1, 0.2807946430868955, 0, 0.002442581723267263, 0.01294962044899209, 0.7192053569131045, 1, 0.001713011602503467],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001713043669882153],
[160.2090792603112, 409.0342936960583, 0, 1, 0.2814421508822566, 0, 0.002444782785726693, 0.01296128962802616, 0.7185578491177433, 1, 0.001711991241171585],
[159.744569394158, 409.3145088014881, 1, 0, 0.2807170213340078, 0.006259993712415809, 0, -0.03318805746258821, 1, 0.2807170213340078, 0.001712441945788054],
[159.996417255431, 409.2469557009385, 0, 1, 0.2810685637401249, 0, 0.002443512373322968, 0.01295455439444719, 0.7189314362598751, 1, 0.001713043677164771],
[159.6586210677669, 409.5847518886026, 0, 1, 0.2804751511441912, 0, 0.002441497139209851, 0.01294387040519428, 0.7195248488558088, 1, 0.001712291563247341],
[159.8404897388643, 409.4028832175052, 0, 1, 0.2807946430868955, 0, 0.002442581723267263, 0.01294962044899209, 0.7192053569131045, 1, 0.001712845730621799],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001712441691395773],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001712066452642213],
[160.3311996002906, 409.5008114461903, 1, 1, 0.2813657297101417, 0.006237089240852829, 0.002441997603053354, -0.02012010317219163, 0.9208333261446795, 0.4835647855649629, 0.003452182013438504],
[160.096628886353, 409.0281105932276, 1, 0, 0.2813032324561196, 0.006246227712326568, 0, -0.03311507547203356, 1, 0.2813032324561195, 0.001713043702267259],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001712630899465971],
[160.0461706938087, 409.3739998805988, 0, 1, 0.2810686711929448, 0, 0.002442754059348341, 0.01295053410801867, 0.7189313288070551, 1, 0.00171281316405086],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001712215112727413],
[159.8784059623372, 409.3649669940324, 1, 0, 0.2808612511938567, 0.006254753379487481, 0, -0.03316027525092184, 1, 0.2808612511938567, 0.00171249292705863],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001711991236634095],
[159.5247844995878, 409.7185884567818, 0, 1, 0.2802400380545401, 0, 0.002440699612303489, 0.01293964222701835, 0.7197599619454599, 1, 0.00171229155367692],
[160.0461706938087, 409.659286039088, 0, 1, 0.2809279230211858, 0, 0.002441052928810173, 0.01294151537403175, 0.7190720769788141, 1, 0.001712845765072473],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001712080032670329],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001712630953662003],
[160.0247844995878, 409.1806722333089, 0, 1, 0.2811371229961354, 0, 0.002443908199627314, 0.01295665291191179, 0.7188628770038646, 1, 0.001712630966696035],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001712630965133187],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001712076789831754],
[160.0247844995878, 409.1806722333089, 0, 1, 0.2811371229961354, 0, 0.002443908199627314, 0.01295665291191179, 0.7188628770038646, 1, 0.001712813127332576],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001712630902060832],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001713043697852033],
[160.0966288863529, 409.0281105932275, 1, 0, 0.2813032324561197, 0.006246227712326569, 0, -0.03311507547203357, 1, 0.2813032324561197, 0.001712975680964007],
[160.4868682761149, 408.7565046802546, 1, 0, 0.2819301478076507, 0.006231039403669572, 0, -0.0330345529533818, 1, 0.2819301478076507, 0.001715072950574996],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001712291563609049],
[159.9529401128226, 409.290432843547, 1, 0, 0.2809921866671998, 0.006251838817683822, 0, -0.03314482337523925, 1, 0.2809921866671998, 0.001711877993269372],
[159.6586210677669, 409.5847518886026, 0, 1, 0.2804751511441912, 0, 0.002441497139209851, 0.01294387040519428, 0.7195248488558088, 1, 0.001712630921549686],
[159.9529401128226, 409.409066320336, 1, 0, 0.2809336385384553, 0.006251838817683821, 0, -0.03314482337523924, 1, 0.2809336385384553, 0.001711479082819871],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001715105571283491],
[160.0531517437445, 409.1902212126251, 0, 1, 0.2811682302290271, 0, 0.002443851167890876, 0.01295635055177646, 0.7188317697709729, 1, 0.001711622839910738],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001711991257297624],
[159.8784059623372, 409.3649669940323, 1, 0, 0.2808612511938568, 0.006254753379487481, 0, -0.03316027525092184, 1, 0.2808612511938569, 0.001712291656845684],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.00171912298333362],
[159.9061510227987, 409.3372219335709, 0, 1, 0.2809099914370982, 0, 0.002442973534818889, 0.01295169768179571, 0.7190900085629017, 1, 0.001712076780432674],
[159.8784059623372, 409.3649669940323, 1, 0, 0.2808612511938567, 0.006254753379487481, 0, -0.03316027525092185, 1, 0.2808612511938567, 0.001712630921549686],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001713043698932959],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.00171176693433603],
[160.0461706938087, 409.3189427750929, 0, 1, 0.2810958502861456, 0, 0.002443082631896337, 0.01295227607216504, 0.7189041497138544, 1, 0.001712845744765894],
[159.658621067767, 409.5847518886026, 0, 1, 0.2804751511441912, 0, 0.002441497139209851, 0.01294387040519428, 0.7195248488558088, 1, 0.001712630916580493],
[160.2090792603112, 409.0342936960583, 0, 1, 0.2814421508822566, 0, 0.002444782785726693, 0.01296128962802616, 0.7185578491177433, 1, 0.001711991238723523],
[159.9529401128226, 409.290432843547, 1, 0, 0.2809921866671998, 0.006251838817683822, 0, -0.03314482337523925, 1, 0.2809921866671998, 0.001711766937085225],
[160.0461706938087, 409.659286039088, 0, 1, 0.2809279230211858, 0, 0.002441052928810173, 0.01294151537403175, 0.7190720769788141, 1, 0.001712813147882895],
[159.658621067767, 409.5847518886026, 0, 1, 0.2804751511441912, 0, 0.002441497139209851, 0.01294387040519428, 0.7195248488558088, 1, 0.001713043707533784],
[159.6586210677669, 409.5847518886026, 0, 1, 0.2804751511441912, 0, 0.002441497139209851, 0.01294387040519428, 0.7195248488558088, 1, 0.001712630966696035],
[159.8404897388643, 409.4028832175052, 0, 1, 0.2807946430868955, 0, 0.002442581723267263, 0.01294962044899209, 0.7192053569131045, 1, 0.001712845722094603],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001712076790060475],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 1, 0, 0.2811183969845761, 0.006249032005430233, 0, -0.03312994274585874, 1, 0.2811183969845761, 0.001712630921549686],
[160.3404897388643, 409.4258600236822, 0, 1, 0.2814144601654471, 0, 0.002442444646613571, 0.01294889372176703, 0.7185855398345529, 1, 0.001720175425261531],
[159.8404897388643, 409.4028832175052, 0, 1, 0.2807946430868955, 0, 0.002442581723267263, 0.01294962044899209, 0.7192053569131045, 1, 0.001712281320451571],
[160.1586210677669, 409.0847518886026, 0, 1, 0.2813535100742272, 0, 0.002444481236182347, 0.01295969092935882, 0.7186464899257728, 1, 0.00171319403479458],
[159.8404897388643, 409.4028832175052, 0, 1, 0.2807946430868955, 0, 0.002442581723267263, 0.01294962044899209, 0.7192053569131045, 1, 0.001712845754981526],
[160.0247844995878, 409.2185884567818, 0, 1, 0.2811183969845761, 0, 0.002443681758864215, 0.01295545241085655, 0.7188816030154239, 1, 0.001711766868940496],
[159.6586210677669, 409.5847518886026, 0, 1, 0.2804751511441912, 0, 0.002441497139209851, 0.01294387040519428, 0.7195248488558088, 1, 0.001712630919303819],
[160.1434179763769, 409.0999549799927, 0, 1, 0.2813268025320539, 0, 0.002444390393660409, 0.01295920931755909, 0.7186731974679461, 1, 0.001711479089859915],
[159.6586210677669, 409.5847518886026, 0, 1, 0.2804751511441912, 0, 0.002441497139209851, 0.01294387040519428, 0.7195248488558088, 1, 0.001713011626513136],
[160.3909479314086, 408.6681302642375, 2, 1, 0.2818528937979005, 0.01246953163999818, 0.002446973291882139, -0.05313571509180522, 0.9776093091163921, 0.193541779459536, 0.005174428425209953],
[159.8404897388643, 409.4028832175052, 0, 1, 0.2807946430868955, 0, 0.002442581723267263, 0.01294962044899209, 0.7192053569131045, 1, 0.00171305104053747]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.2664587571705756, 2.733541242829425, 0, 1, 0.08881958572352519, 0, 0.3658258321959406, 1.939466602999613, 0.9111804142764748, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -5.301611948389727, 1, 0.3333333333333334, 0.1886218775977621],
[1.001651313821017, 1.921187165345969, 0, 1, 0.3426981411940661, 0, 0.520511493121452, 2.759549951206866, 0.6573018588059339, 1, 0.1886218775977621],
[0.5886380901112909, 2.057766673812902, 0, 0, 0.2224293494841036, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6344117872722107, 2.365588212727789, 1, 2, 0.2114705957574036, 1.57626327262883, 0.8454556838080349, -3.874458244866214, 0.8847544123295797, 0.5097092741320137, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 1, 0.3333333333333334, 1, 0.5000000000000001, -2.650805974194864, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.1886218775977621],
[0.998326658021252, 2.001673341978748, 0, 1, 0.3327755526737506, 0, 0.4995820142218876, 2.648589975799365, 0.6672244473262494, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 1.999655731883878, 1, 1, 0.333371589736389, 1, 0.500086081846648, -2.650349601648136, 0.8888633831566328, 0.5556065626294107, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 1.924167553054224, 0, 0, 0.3419776677829298, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2, 0, 0, 0.2399513430912105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 1, 0.3333333333333334, 1, 0.5000000000000001, -2.650805974194864, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.1886218775977621],
[0.6414553709803021, 2.353488905576322, 0, 1, 0.2141794009328956, 0, 0.4249010894551553, 2.252660692739263, 0.7858205990671043, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 1, 0.3333333333333334, 1, 0.5000000000000001, -2.650805974194864, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.1886218775977621],
[0.9983124297564412, 2.001687570243559, 0, 1, 0.3327708099188137, 0, 0.4995784631256532, 2.648571149265139, 0.6672291900811862, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7318685601363942, 1.348160918130125, 0, 1, 0.3518548981076595, 0, 0.7417512157131672, 3.932477107957532, 0.6481451018923405, 1, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 1.91407790028256, 0, 0, 0.2767251909551848, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 2.650805974194864, 0.6666666666666666, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2, 0, 0, 0.2399513430912105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.5886380901112909, 2.057766673812902, 0, 0, 0.2224293494841036, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.5886380901112909, 1.487194356834485, 0, 0, 0.2835672459872033, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9989225834820152, 2.001077416517985, 0, 1, 0.3329741944940051, 0, 0.4997307908956717, 2.649378731990741, 0.667025805505995, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 2.650805974194864, 0.6666666666666666, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 1.91407790028256, 0, 0, 0.2767251909551848, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9983264481483808, 2.001673551851619, 0, 1, 0.332775482716127, 0, 0.4995819618413625, 2.648589698098148, 0.667224517283873, 1, 0.1886218775977621],
[0.9983264481400492, 2.00167355185995, 0, 1, 0.3327754827133498, 0, 0.4995819618392831, 2.648589698087124, 0.6672245172866502, 1, 0.1886218775977621],
[0.9983269996022581, 2.001673000397742, 0, 1, 0.332775666534086, 0, 0.4995820994744373, 2.648590427775301, 0.667224333465914, 1, 0.1886218775977621],
[0.7316748669196939, 2.02484410801633, 1, 0, 0.2654343661598322, 1.366727279030286, 0, -7.245857672697144, 1, 0.2654343661598322, 0.1886218775977621],
[0.5888322910960613, 2.16879216933102, 0, 1, 0.2135288178452214, 0, 0.4610861354725646, 2.444499765058192, 0.7864711821547785, 1, 0.1886218775977621],
[1.220048568664392, 1.648628863466898, 0, 0, 0.4253000197927289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.5886380901112909, 2.167880884824732, 0, 0, 0.2135440007718259, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.5886380901112909, 2.167880884824732, 0, 0, 0.2135440007718259, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9983269896112351, 2.001673010388764, 0, 1, 0.3327756632037451, 0, 0.4995820969808552, 2.648590414555297, 0.6672243367962549, 1, 0.1886218775977621],
[1.220048568664392, 1.648628863466898, 0, 0, 0.4253000197927289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 2.02419211129439, 0, 0, 0.2656708951762721, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9983269603505011, 2.001673039649499, 0, 1, 0.3327756534501671, 0, 0.4995820896778947, 2.648590375837834, 0.6672243465498329, 1, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 1.91407790028256, 0, 0, 0.2767251909551848, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9241675530542243, 2.075832446945775, 0, 0, 0.3080558510180748, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9983270346872517, 2.001076914453888, 1, 2, 0.3328418084443466, 1.001675768815849, 0.9994618325532072, -0.01173743094299666, 0.741395865425172, 0.7030478538728708, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 1.999655695266475, 0, 2, 0.3333715938059233, 0, 1.000172182008303, 5.302524790582241, 0.4443934319448548, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 1.343505583304142, 0, 0, 0.3527870781281621, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9983262475400856, 2.001673752459914, 0, 2, 0.3327754158466952, 0, 0.9991638235462411, 5.297178865311515, 0.4451886456985506, 1, 0.1886218775977621],
[0.5886380901112909, 2.167880884824732, 0, 0, 0.2135440007718259, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[1.220701051694774, 1.646898963898838, 1, 0, 0.4256873500686186, 0.8192013913739473, 0, -4.343087884645607, 1, 0.4256873500686186, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 1.91407790028256, 0, 0, 0.2767251909551848, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.5894846096352327, 2.168139579697242, 1, 1, 0.2137653897567262, 1.696397130060427, 0.4612249180653025, -6.54840375743232, 0.9543043581421549, 0.3818351376556074, 0.1886218775977621],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -5.301611948389727, 1, 0.3333333333333334, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 1.343505583304142, 0, 0, 0.3527870781281621, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 1.343505583304142, 0, 0, 0.3527870781281621, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2, 0, 0, 0.2399513430912105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7316748246193863, 2.024844150316637, 1, 0, 0.2654343508142794, 1.366727358044874, 0, -7.245858091601825, 1, 0.2654343508142794, 0.1886218775977621],
[0.5886380901112909, 1.487194356834485, 0, 0, 0.2835672459872033, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 1, 5.301611948389727, 0.4444444444444444, 1, 0.1886218775977621],
[0.7565189749360232, 2, 0, 0, 0.2744472219544876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9898134702261274, 2.006557231680088, 0, 1, 0.3303374544399439, 0, 0.4983660491770281, 2.642143400988714, 0.669662545560056, 1, 0.1886218775977621],
[0.5888322910993047, 2.05917791378118, 0, 1, 0.2223678330295109, 0, 0.4856306943209889, 2.574625491516954, 0.7776321669704891, 1, 0.1886218775977621],
[0.9228384791825224, 2.077161520817477, 1, 0, 0.3076128263941742, 1.083613246042612, 0, -5.744896932652885, 1, 0.3076128263941742, 0.1886218775977621],
[0.5888322947933486, 2.168792186680472, 0, 1, 0.2135288175562778, 0, 0.4610861317840638, 2.444499745503192, 0.7864711824437222, 1, 0.1886218775977621],
[0.6128302014056805, 2.387169798594318, 0, 0, 0.2042767338018936, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 1.997904255455753, 1, 1, 0.333566356624013, 1, 0.5005244857301154, -2.648025354381324, 0.8887334857285818, 0.5558661989766078, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 2.02419211129439, 0, 0, 0.2656708951762721, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 2.650805974194864, 0.6666666666666666, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6208157565152126, 2.379184243484787, 0, 2, 0.2069385855050709, 0, 0.840624262486962, 4.456663634107179, 0.6289464071606978, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 2.650805974194864, 0.6666666666666666, 1, 0.1886218775977621],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.5886380901112909, 1.487194356834485, 0, 0, 0.2835672459872033, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9966760030010223, 2.003323996998977, 0, 1, 0.3322253343336742, 0, 0.499170379578152, 2.646407648653765, 0.6677746656663258, 1, 0.1886218775977621],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1886218775977621],
[1.004201566626917, 1.995798433373083, 1, 0, 0.3347338555423057, 0.995816012674597, 0, -5.279430071193458, 1, 0.3347338555423056, 0.1886218775977621],
[0.9241675530542243, 2.075832446945775, 0, 0, 0.3080558510180748, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -5.301611948389727, 1, 0.3333333333333334, 0.1886218775977621],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9983271994353126, 2.001672800564687, 0, 1, 0.3327757331451042, 0, 0.4995821493492305, 2.648590692192101, 0.6672242668548958, 1, 0.1886218775977621],
[0.7565189749360232, 2, 0, 0, 0.2744472219544876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.5886380901112909, 2.167880884824732, 0, 0, 0.2135440007718259, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[1.220048568664392, 1.648628863466898, 0, 0, 0.4253000197927289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 1, 0.2104701595177006, 0, 0.4221921911522816, 2.238299165129775, 0.7895298404822993, 1, 0.1886218775977621],
[0.6330831955237919, 2.366916804476208, 0, 1, 0.211027731841264, 0, 0.4224905573820104, 2.239880987098301, 0.788972268158736, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 2.650805974194864, 0.6666666666666666, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -5.301611948389727, 1, 0.3333333333333334, 0.1886218775977621],
[0.9228384791414539, 2.077161520858545, 1, 0, 0.3076128263804847, 1.083613246090835, 0, -5.744896932908546, 1, 0.3076128263804847, 0.1886218775977621],
[0.9228389092189262, 2.077161090781073, 1, 0, 0.3076129697396421, 1.083612741086504, 0, -5.744894255571552, 1, 0.3076129697396421, 0.1886218775977621],
[0.7627330464218107, 2.237266953578189, 0, 0, 0.2542443488072703, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9427033355512758, 2.057296664448724, 1, 1, 0.3142344451837586, 1.060779104398966, 0.4860747685448473, -3.046859373755575, 0.9012567134600553, 0.5297256038275727, 0.1886218775977621],
[0.9228387424662504, 2.077161257533749, 1, 0, 0.3076129141554169, 1.083612936890295, 0, -5.744895293647269, 1, 0.3076129141554169, 0.1886218775977621],
[0.632739070305637, 2.367260929694363, 1, 0, 0.2109130234352123, 1.58043030204688, 0, -8.378828172928923, 1, 0.2109130234352123, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7565189749360232, 2, 0, 0, 0.2744472219544876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.237266953578189, 0, 0, 0.2201050809968529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -5.301611948389727, 1, 0.3333333333333334, 0.1886218775977621],
[1.220048568664392, 1.648628863466898, 0, 0, 0.4253000197927289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9241675530542243, 2.075832446945775, 0, 0, 0.3080558510180748, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.2676731363583664, 2.732326863641634, 0, 0, 0.08922437878612212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.2676731363583664, 2.732326863641634, 0, 0, 0.08922437878612212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 1, 0.3333333333333334, 1, 0.5000000000000001, -2.650805974194864, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9966753442195374, 2.003324655780462, 0, 1, 0.3322251147398458, 0, 0.4991702154289199, 2.646406778398235, 0.6677748852601542, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -5.301611948389727, 1, 0.3333333333333334, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 2.02419211129439, 0, 0, 0.2656708951762721, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[1.921623563425382, 1.076703279236396, 1, 0, 0.6408986292233079, 0.5203932856742525, 0, -2.758923261192405, 1, 0.6408986292233079, 0.1886218775977621],
[0.001215596054721254, 2.998784403945278, 0, 1, 0.0004051986849070847, 0, 0.3334684543124788, 1.767920341794091, 0.9995948013150929, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.999742371728772, 2.000257628271227, 0, 1, 0.333247457242924, 0, 0.4999356012276653, 2.650464556893992, 0.666752542757076, 1, 0.1886218775977621],
[0.2676731363583664, 2.732326863641634, 0, 0, 0.08922437878612212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 1.999655800108599, 1, 1, 0.3333715821541245, 1, 0.5000860647845949, -2.65034969210452, 0.8888633882120558, 0.5556065525203049, 0.1886218775977621],
[0.9228385862720712, 2.077161413727928, 1, 0, 0.3076128620906905, 1.083613120296186, 0, -5.744896265994132, 1, 0.3076128620906905, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2, 0, 0, 0.2399513430912105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9241675530542243, 2.075832446945775, 0, 0, 0.3080558510180748, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2, 0, 0, 0.2399513430912105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 2.02419211129439, 0, 0, 0.2656708951762721, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9954610473199498, 2.00453895268005, 1, 1, 0.3318203491066499, 1.004559648709782, 0.4988678312601555, -2.680981781593854, 0.889895255918741, 0.5535359541320408, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.237266953578189, 0, 0, 0.2201050809968529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9983262860733837, 2.001673713926616, 0, 1, 0.332775428691128, 0, 0.4995819213903417, 2.648589483642533, 0.667224571308872, 1, 0.1886218775977621],
[0.9966753442238973, 2.003324655776102, 0, 1, 0.3322251147412991, 0, 0.4991702154300062, 2.646406778403994, 0.6677748852587009, 1, 0.1886218775977621],
[0.9966753441318967, 2.003324655868103, 1, 1, 0.3322251147106323, 1.003335746075869, 0.4991702154070824, -2.672890001359886, 0.8896264731555072, 0.5540767025767719, 0.1886218775977621],
[0.6330833542562222, 2.366916645743777, 0, 1, 0.2110277847520741, 0, 0.4224905857154767, 2.239881137311345, 0.7889722152479259, 1, 0.1886218775977621],
[0.9989231916065126, 2.001076808393487, 0, 1, 0.3329743972021709, 0, 0.4997309427631737, 2.649379537133304, 0.6670256027978291, 1, 0.1886218775977621],
[0.643182080219774, 2.037286684546785, 0, 0, 0.2399513430912106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1851696955843236],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 1.924167553054224, 0, 0, 0.3419776677829298, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 2, 0.3333333333333334, 1, 1, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.1886218775977621],
[1.220701025786068, 1.646899032589452, 1, 0, 0.425687334682783, 0.8192014087610452, 0, -4.343087976825253, 1, 0.425687334682783, 0.1886218775977621],
[0.008487186714024741, 1.829779356497236, 0, 2, 0.004616951086537487, 0, 1.093027961485268, 5.794810100534365, 0.9907874140642605, 1, 0.1886218775977621],
[0.7316747814906063, 1.914729982433587, 1, 0, 0.2764787879257178, 1.36672743860701, 0, -7.245858518711009, 1, 0.2764787879257178, 0.1886218775977621],
[0.943265511686539, 2.056734488313461, 0, 0, 0.3144218372288464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7390669342747648, 1.355870721027545, 0, 0, 0.3527870781281621, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1869017021725006],
[0.588832294795651, 1.491196262642784, 0, 1, 0.2830885627458888, 0, 0.6706025390834484, 3.555274433825298, 0.7169114372541112, 1, 0.1886218775977621],
[0.9983264481162484, 2.001673551883751, 0, 1, 0.3327754827054161, 0, 0.4995819618333428, 2.64858969805563, 0.6672245172945839, 1, 0.1886218775977621],
[0.996674605173581, 2.003325394826418, 1, 1, 0.3322248683911937, 1.003336489972913, 0.4991700312802388, -2.672894921382419, 0.8896266368224539, 0.5540763736048415, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 2.02419211129439, 0, 0, 0.2656708951762721, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7627330464218107, 2.237266953578189, 0, 0, 0.2542443488072703, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 1.343505583304142, 0, 0, 0.3527870781281621, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9983242401633755, 2.001675759836624, 1, 1, 0.3327747467211252, 1.001678572721374, 0.4995814107683551, -2.661924313062694, 0.889260967944691, 0.5548104613869413, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 1.91407790028256, 0, 0, 0.2767251909551848, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7638094788986144, 2.236190521101385, 0, 1, 0.2546031596328715, 0, 0.4471890881227207, 2.370823012780922, 0.7453968403671285, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9241675530542243, 2.075832446945775, 0, 0, 0.3080558510180748, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 1, 0.2104701595177006, 0, 0.4221921911522816, 2.238299165129775, 0.7895298404822993, 1, 0.1886218775977621],
[1.001650942097838, 1.921187836253691, 0, 1, 0.3426979789363427, 0, 0.5205113113510005, 2.759548987530469, 0.6573020210636573, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[1.363737342194736, 1.267673136358367, 0, 0, 0.5182533676557355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.002866869833681231, 1.824606020414594, 0, 1, 0.001568761894624738, 0, 0.5480635210075521, 2.905620111450182, 0.9984312381053753, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7627330464218107, 2.237266953578189, 0, 0, 0.2542443488072703, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9966745428960936, 2.003325457103906, 0, 1, 0.3322248476320313, 0, 0.4991700157625128, 2.646405719844426, 0.6677751523679687, 1, 0.1886218775977621],
[0.9966753442291839, 2.003324655770816, 0, 1, 0.3322251147430614, 0, 0.4991702154313235, 2.646406778410978, 0.6677748852569386, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[1.363085455113912, 1.269401455911566, 1, 0, 0.5177938205143539, 0.7336297194341572, 0, -3.88942008624593, 1, 0.5177938205143539, 0.1886218775977621],
[0.6128302014056805, 2.387169798594318, 0, 0, 0.2042767338018936, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -5.301611948389727, 1, 0.3333333333333334, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 1, 0.2104701595177006, 0, 0.4221921911522816, 2.238299165129775, 0.7895298404822993, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 2.650805974194864, 0.6666666666666666, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -5.301611948389727, 1, 0.3333333333333334, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 2.02419211129439, 0, 0, 0.2656708951762721, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[1.363737342194736, 1.267673136358367, 0, 0, 0.5182533676557355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.5888322910974716, 1.491196186435736, 0, 1, 0.2830885718429165, 0, 0.6706025733543516, 3.555274615516328, 0.7169114281570835, 1, 0.1886218775977621]
],
"RESOLVED": [
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.2664587571705756, 2.733541242829425, 0, 1, 0.08881958572352519, 0, 0.3658258321959406, 1.939466602999613, 0.9111804142764748, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -5.301611948389727, 1, 0.3333333333333334, 0.1886218775977621],
[1.001651313821017, 1.921187165345969, 0, 1, 0.3426981411940661, 0, 0.520511493121452, 2.759549951206866, 0.6573018588059339, 1, 0.1886218775977621],
[0.5886380901112909, 2.057766673812902, 0, 0, 0.2224293494841036, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6344117872722107, 2.365588212727789, 1, 2, 0.2114705957574036, 1.57626327262883, 0.8454556838080349, -3.874458244866214, 0.8847544123295797, 0.5097092741320137, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 1, 0.3333333333333334, 1, 0.5000000000000001, -2.650805974194864, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.1886218775977621],
[0.998326658021252, 2.001673341978748, 0, 1, 0.3327755526737506, 0, 0.4995820142218876, 2.648589975799365, 0.6672244473262494, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 1.999655731883878, 1, 1, 0.333371589736389, 1, 0.500086081846648, -2.650349601648136, 0.8888633831566328, 0.5556065626294107, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 1.924167553054224, 0, 0, 0.3419776677829298, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2, 0, 0, 0.2399513430912105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 1, 0.3333333333333334, 1, 0.5000000000000001, -2.650805974194864, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.1886218775977621],
[0.6414553709803021, 2.353488905576322, 0, 1, 0.2141794009328956, 0, 0.4249010894551553, 2.252660692739263, 0.7858205990671043, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 1, 0.3333333333333334, 1, 0.5000000000000001, -2.650805974194864, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.1886218775977621],
[0.9983124297564412, 2.001687570243559, 0, 1, 0.3327708099188137, 0, 0.4995784631256532, 2.648571149265139, 0.6672291900811862, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7318685601363942, 1.348160918130125, 0, 1, 0.3518548981076595, 0, 0.7417512157131672, 3.932477107957532, 0.6481451018923405, 1, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 1.91407790028256, 0, 0, 0.2767251909551848, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 2.650805974194864, 0.6666666666666666, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2, 0, 0, 0.2399513430912105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.5886380901112909, 2.057766673812902, 0, 0, 0.2224293494841036, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.5886380901112909, 1.487194356834485, 0, 0, 0.2835672459872033, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9989225834820152, 2.001077416517985, 0, 1, 0.3329741944940051, 0, 0.4997307908956717, 2.649378731990741, 0.667025805505995, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 2.650805974194864, 0.6666666666666666, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 1.91407790028256, 0, 0, 0.2767251909551848, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9983264481483808, 2.001673551851619, 0, 1, 0.332775482716127, 0, 0.4995819618413625, 2.648589698098148, 0.667224517283873, 1, 0.1886218775977621],
[0.9983264481400492, 2.00167355185995, 0, 1, 0.3327754827133498, 0, 0.4995819618392831, 2.648589698087124, 0.6672245172866502, 1, 0.1886218775977621],
[0.9983269996022581, 2.001673000397742, 0, 1, 0.332775666534086, 0, 0.4995820994744373, 2.648590427775301, 0.667224333465914, 1, 0.1886218775977621],
[0.7316748669196939, 2.02484410801633, 1, 0, 0.2654343661598322, 1.366727279030286, 0, -7.245857672697144, 1, 0.2654343661598322, 0.1886218775977621],
[0.5888322910960613, 2.16879216933102, 0, 1, 0.2135288178452214, 0, 0.4610861354725646, 2.444499765058192, 0.7864711821547785, 1, 0.1886218775977621],
[1.220048568664392, 1.648628863466898, 0, 0, 0.4253000197927289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.5886380901112909, 2.167880884824732, 0, 0, 0.2135440007718259, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.5886380901112909, 2.167880884824732, 0, 0, 0.2135440007718259, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9983269896112351, 2.001673010388764, 0, 1, 0.3327756632037451, 0, 0.4995820969808552, 2.648590414555297, 0.6672243367962549, 1, 0.1886218775977621],
[1.220048568664392, 1.648628863466898, 0, 0, 0.4253000197927289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 2.02419211129439, 0, 0, 0.2656708951762721, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9983269603505011, 2.001673039649499, 0, 1, 0.3327756534501671, 0, 0.4995820896778947, 2.648590375837834, 0.6672243465498329, 1, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 1.91407790028256, 0, 0, 0.2767251909551848, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9241675530542243, 2.075832446945775, 0, 0, 0.3080558510180748, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9983270346872517, 2.001076914453888, 1, 2, 0.3328418084443466, 1.001675768815849, 0.9994618325532072, -0.01173743094299666, 0.741395865425172, 0.7030478538728708, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 1.999655695266475, 0, 2, 0.3333715938059233, 0, 1.000172182008303, 5.302524790582241, 0.4443934319448548, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 1.343505583304142, 0, 0, 0.3527870781281621, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9983262475400856, 2.001673752459914, 0, 2, 0.3327754158466952, 0, 0.9991638235462411, 5.297178865311515, 0.4451886456985506, 1, 0.1886218775977621],
[0.5886380901112909, 2.167880884824732, 0, 0, 0.2135440007718259, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[1.220701051694774, 1.646898963898838, 1, 0, 0.4256873500686186, 0.8192013913739473, 0, -4.343087884645607, 1, 0.4256873500686186, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 1.91407790028256, 0, 0, 0.2767251909551848, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.5894846096352327, 2.168139579697242, 1, 1, 0.2137653897567262, 1.696397130060427, 0.4612249180653025, -6.54840375743232, 0.9543043581421549, 0.3818351376556074, 0.1886218775977621],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -5.301611948389727, 1, 0.3333333333333334, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 1.343505583304142, 0, 0, 0.3527870781281621, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 1.343505583304142, 0, 0, 0.3527870781281621, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2, 0, 0, 0.2399513430912105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7316748246193863, 2.024844150316637, 1, 0, 0.2654343508142794, 1.366727358044874, 0, -7.245858091601825, 1, 0.2654343508142794, 0.1886218775977621],
[0.5886380901112909, 1.487194356834485, 0, 0, 0.2835672459872033, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 1, 5.301611948389727, 0.4444444444444444, 1, 0.1886218775977621],
[0.7565189749360232, 2, 0, 0, 0.2744472219544876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9898134702261274, 2.006557231680088, 0, 1, 0.3303374544399439, 0, 0.4983660491770281, 2.642143400988714, 0.669662545560056, 1, 0.1886218775977621],
[0.5888322910993047, 2.05917791378118, 0, 1, 0.2223678330295109, 0, 0.4856306943209889, 2.574625491516954, 0.7776321669704891, 1, 0.1886218775977621],
[0.9228384791825224, 2.077161520817477, 1, 0, 0.3076128263941742, 1.083613246042612, 0, -5.744896932652885, 1, 0.3076128263941742, 0.1886218775977621],
[0.5888322947933486, 2.168792186680472, 0, 1, 0.2135288175562778, 0, 0.4610861317840638, 2.444499745503192, 0.7864711824437222, 1, 0.1886218775977621],
[0.6128302014056805, 2.387169798594318, 0, 0, 0.2042767338018936, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 1.997904255455753, 1, 1, 0.333566356624013, 1, 0.5005244857301154, -2.648025354381324, 0.8887334857285818, 0.5558661989766078, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 2.02419211129439, 0, 0, 0.2656708951762721, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 2.650805974194864, 0.6666666666666666, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6208157565152126, 2.379184243484787, 0, 2, 0.2069385855050709, 0, 0.840624262486962, 4.456663634107179, 0.6289464071606978, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 2.650805974194864, 0.6666666666666666, 1, 0.1886218775977621],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.5886380901112909, 1.487194356834485, 0, 0, 0.2835672459872033, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9966760030010223, 2.003323996998977, 0, 1, 0.3322253343336742, 0, 0.499170379578152, 2.646407648653765, 0.6677746656663258, 1, 0.1886218775977621],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1886218775977621],
[1.004201566626917, 1.995798433373083, 1, 0, 0.3347338555423057, 0.995816012674597, 0, -5.279430071193458, 1, 0.3347338555423056, 0.1886218775977621],
[0.9241675530542243, 2.075832446945775, 0, 0, 0.3080558510180748, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -5.301611948389727, 1, 0.3333333333333334, 0.1886218775977621],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9983271994353126, 2.001672800564687, 0, 1, 0.3327757331451042, 0, 0.4995821493492305, 2.648590692192101, 0.6672242668548958, 1, 0.1886218775977621],
[0.7565189749360232, 2, 0, 0, 0.2744472219544876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.5886380901112909, 2.167880884824732, 0, 0, 0.2135440007718259, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[1.220048568664392, 1.648628863466898, 0, 0, 0.4253000197927289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 1, 0.2104701595177006, 0, 0.4221921911522816, 2.238299165129775, 0.7895298404822993, 1, 0.1886218775977621],
[0.6330831955237919, 2.366916804476208, 0, 1, 0.211027731841264, 0, 0.4224905573820104, 2.239880987098301, 0.788972268158736, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 2.650805974194864, 0.6666666666666666, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -5.301611948389727, 1, 0.3333333333333334, 0.1886218775977621],
[0.9228384791414539, 2.077161520858545, 1, 0, 0.3076128263804847, 1.083613246090835, 0, -5.744896932908546, 1, 0.3076128263804847, 0.1886218775977621],
[0.9228389092189262, 2.077161090781073, 1, 0, 0.3076129697396421, 1.083612741086504, 0, -5.744894255571552, 1, 0.3076129697396421, 0.1886218775977621],
[0.7627330464218107, 2.237266953578189, 0, 0, 0.2542443488072703, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9427033355512758, 2.057296664448724, 1, 1, 0.3142344451837586, 1.060779104398966, 0.4860747685448473, -3.046859373755575, 0.9012567134600553, 0.5297256038275727, 0.1886218775977621],
[0.9228387424662504, 2.077161257533749, 1, 0, 0.3076129141554169, 1.083612936890295, 0, -5.744895293647269, 1, 0.3076129141554169, 0.1886218775977621],
[0.632739070305637, 2.367260929694363, 1, 0, 0.2109130234352123, 1.58043030204688, 0, -8.378828172928923, 1, 0.2109130234352123, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7565189749360232, 2, 0, 0, 0.2744472219544876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.237266953578189, 0, 0, 0.2201050809968529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -5.301611948389727, 1, 0.3333333333333334, 0.1886218775977621],
[1.220048568664392, 1.648628863466898, 0, 0, 0.4253000197927289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9241675530542243, 2.075832446945775, 0, 0, 0.3080558510180748, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.2676731363583664, 2.732326863641634, 0, 0, 0.08922437878612212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.2676731363583664, 2.732326863641634, 0, 0, 0.08922437878612212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 1, 0.3333333333333334, 1, 0.5000000000000001, -2.650805974194864, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9966753442195374, 2.003324655780462, 0, 1, 0.3322251147398458, 0, 0.4991702154289199, 2.646406778398235, 0.6677748852601542, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -5.301611948389727, 1, 0.3333333333333334, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 2.02419211129439, 0, 0, 0.2656708951762721, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[1.921623563425382, 1.076703279236396, 1, 0, 0.6408986292233079, 0.5203932856742525, 0, -2.758923261192405, 1, 0.6408986292233079, 0.1886218775977621],
[0.001215596054721254, 2.998784403945278, 0, 1, 0.0004051986849070847, 0, 0.3334684543124788, 1.767920341794091, 0.9995948013150929, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.999742371728772, 2.000257628271227, 0, 1, 0.333247457242924, 0, 0.4999356012276653, 2.650464556893992, 0.666752542757076, 1, 0.1886218775977621],
[0.2676731363583664, 2.732326863641634, 0, 0, 0.08922437878612212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 1.999655800108599, 1, 1, 0.3333715821541245, 1, 0.5000860647845949, -2.65034969210452, 0.8888633882120558, 0.5556065525203049, 0.1886218775977621],
[0.9228385862720712, 2.077161413727928, 1, 0, 0.3076128620906905, 1.083613120296186, 0, -5.744896265994132, 1, 0.3076128620906905, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2, 0, 0, 0.2399513430912105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9241675530542243, 2.075832446945775, 0, 0, 0.3080558510180748, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2, 0, 0, 0.2399513430912105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 2.02419211129439, 0, 0, 0.2656708951762721, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9954610473199498, 2.00453895268005, 1, 1, 0.3318203491066499, 1.004559648709782, 0.4988678312601555, -2.680981781593854, 0.889895255918741, 0.5535359541320408, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.237266953578189, 0, 0, 0.2201050809968529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9983262860733837, 2.001673713926616, 0, 1, 0.332775428691128, 0, 0.4995819213903417, 2.648589483642533, 0.667224571308872, 1, 0.1886218775977621],
[0.9966753442238973, 2.003324655776102, 0, 1, 0.3322251147412991, 0, 0.4991702154300062, 2.646406778403994, 0.6677748852587009, 1, 0.1886218775977621],
[0.9966753441318967, 2.003324655868103, 1, 1, 0.3322251147106323, 1.003335746075869, 0.4991702154070824, -2.672890001359886, 0.8896264731555072, 0.5540767025767719, 0.1886218775977621],
[0.6330833542562222, 2.366916645743777, 0, 1, 0.2110277847520741, 0, 0.4224905857154767, 2.239881137311345, 0.7889722152479259, 1, 0.1886218775977621],
[0.9989231916065126, 2.001076808393487, 0, 1, 0.3329743972021709, 0, 0.4997309427631737, 2.649379537133304, 0.6670256027978291, 1, 0.1886218775977621],
[0.643182080219774, 2.037286684546785, 0, 0, 0.2399513430912106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1851696955843236],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 1.924167553054224, 0, 0, 0.3419776677829298, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 2, 0.3333333333333334, 1, 1, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.1886218775977621],
[1.220701025786068, 1.646899032589452, 1, 0, 0.425687334682783, 0.8192014087610452, 0, -4.343087976825253, 1, 0.425687334682783, 0.1886218775977621],
[0.008487186714024741, 1.829779356497236, 0, 2, 0.004616951086537487, 0, 1.093027961485268, 5.794810100534365, 0.9907874140642605, 1, 0.1886218775977621],
[0.7316747814906063, 1.914729982433587, 1, 0, 0.2764787879257178, 1.36672743860701, 0, -7.245858518711009, 1, 0.2764787879257178, 0.1886218775977621],
[0.943265511686539, 2.056734488313461, 0, 0, 0.3144218372288464, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7390669342747648, 1.355870721027545, 0, 0, 0.3527870781281621, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1869017021725006],
[0.588832294795651, 1.491196262642784, 0, 1, 0.2830885627458888, 0, 0.6706025390834484, 3.555274433825298, 0.7169114372541112, 1, 0.1886218775977621],
[0.9983264481162484, 2.001673551883751, 0, 1, 0.3327754827054161, 0, 0.4995819618333428, 2.64858969805563, 0.6672245172945839, 1, 0.1886218775977621],
[0.996674605173581, 2.003325394826418, 1, 1, 0.3322248683911937, 1.003336489972913, 0.4991700312802388, -2.672894921382419, 0.8896266368224539, 0.5540763736048415, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 2.02419211129439, 0, 0, 0.2656708951762721, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7627330464218107, 2.237266953578189, 0, 0, 0.2542443488072703, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 1.343505583304142, 0, 0, 0.3527870781281621, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9983242401633755, 2.001675759836624, 1, 1, 0.3327747467211252, 1.001678572721374, 0.4995814107683551, -2.661924313062694, 0.889260967944691, 0.5548104613869413, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 1.91407790028256, 0, 0, 0.2767251909551848, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7638094788986144, 2.236190521101385, 0, 1, 0.2546031596328715, 0, 0.4471890881227207, 2.370823012780922, 0.7453968403671285, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9241675530542243, 2.075832446945775, 0, 0, 0.3080558510180748, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 1, 0.2104701595177006, 0, 0.4221921911522816, 2.238299165129775, 0.7895298404822993, 1, 0.1886218775977621],
[1.001650942097838, 1.921187836253691, 0, 1, 0.3426979789363427, 0, 0.5205113113510005, 2.759548987530469, 0.6573020210636573, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 0, 0.2104701595177006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[1.363737342194736, 1.267673136358367, 0, 0, 0.5182533676557355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.002866869833681231, 1.824606020414594, 0, 1, 0.001568761894624738, 0, 0.5480635210075521, 2.905620111450182, 0.9984312381053753, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.7627330464218107, 2.237266953578189, 0, 0, 0.2542443488072703, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9966745428960936, 2.003325457103906, 0, 1, 0.3322248476320313, 0, 0.4991700157625128, 2.646405719844426, 0.6677751523679687, 1, 0.1886218775977621],
[0.9966753442291839, 2.003324655770816, 0, 1, 0.3322251147430614, 0, 0.4991702154313235, 2.646406778410978, 0.6677748852569386, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[1.363085455113912, 1.269401455911566, 1, 0, 0.5177938205143539, 0.7336297194341572, 0, -3.88942008624593, 1, 0.5177938205143539, 0.1886218775977621],
[0.6128302014056805, 2.387169798594318, 0, 0, 0.2042767338018936, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -5.301611948389727, 1, 0.3333333333333334, 0.1886218775977621],
[0.6314104785531018, 2.368589521446898, 0, 1, 0.2104701595177006, 0, 0.4221921911522816, 2.238299165129775, 0.7895298404822993, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 2.650805974194864, 0.6666666666666666, 1, 0.1886218775977621],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -5.301611948389727, 1, 0.3333333333333334, 0.1886218775977621],
[0.7323268636416331, 2.02419211129439, 0, 0, 0.2656708951762721, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[1.363737342194736, 1.267673136358367, 0, 0, 0.5182533676557355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1886218775977621],
[0.5888322910974716, 1.491196186435736, 0, 1, 0.2830885718429165, 0, 0.6706025733543516, 3.555274615516328, 0.7169114281570835, 1, 0.1886218775977621]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node103":{
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001715105549100956,
"Nucleotide GTR":0.001687880197520435,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "H", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CAT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1":{
"Global MG94xREV":0.01042570263316689,
"Nucleotide GTR":0.01026020645142418,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "S", "R", "C", "E", "D", "K", "R", "S", "K", "L", "T", "M", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "TCT", "AGA", "TGT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "TCA", "AAA", "CTT", "ACT", "ATG", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712630921549686,
"Nucleotide GTR":0.001685444851869426,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCT", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001711991236634095,
"Nucleotide GTR":0.001684815321224942,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "S", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AGT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414008_England_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712066452642213,
"Nucleotide GTR":0.001684889343264406,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "V", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GTA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414008_England_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415537_Wales_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001720175425261531,
"Nucleotide GTR":0.001692869595158266,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "C", "E", "I", "-", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGT", "GAA", "ATC", "---", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415537_Wales_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003452182013438504,
"Nucleotide GTR":0.003397382546965385,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "-", "A", "S", "A", "L", "R", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "---", "GCA", "TCA", "GCT", "TTG", "AGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417554_Reykjavik_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001712845765072473,
"Nucleotide GTR":0.001685656284995428,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "H", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAT", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417554_Reykjavik_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712009655497943,
"Nucleotide GTR":0.001684833447710259,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "P", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "CCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418081_Washington_20200315_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001713043670961661,
"Nucleotide GTR":0.001685851049353527,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "N", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AAT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418081_Washington_20200315_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418307_Derbyshire_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001711991224543465,
"Nucleotide GTR":0.001684815309326239,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAG", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418307_Derbyshire_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001711991257297624,
"Nucleotide GTR":0.001684815341560461,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCG", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418697_England_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001712630921549686,
"Nucleotide GTR":0.001685444851869426,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "F", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "TTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418697_England_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712845729442103,
"Nucleotide GTR":0.001685656249930653,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "C", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGT", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712630921549686,
"Nucleotide GTR":0.001685444851869426,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "I", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ATA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419986_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712393107857954,
"Nucleotide GTR":0.001685210813199801,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "N", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAT", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419986_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420031_Kinshasa_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001713043677164771,
"Nucleotide GTR":0.001685851055458166,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "I", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "ATC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420031_Kinshasa_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420318_Arbre_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001711877993269372,
"Nucleotide GTR":0.001684703875469947,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAG", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420318_Arbre_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00171912298333362,
"Nucleotide GTR":0.001691833859549989,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "G", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "GGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420388_Vilvoorde_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712080032670329,
"Nucleotide GTR":0.001684902707725008,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGC", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420388_Vilvoorde_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420498_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712441691395773,
"Nucleotide GTR":0.001685258625529165,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "V", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GTT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420498_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420640_England_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001712009667750091,
"Nucleotide GTR":0.001684833459767918,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAC", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420640_England_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420701_England_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001712630899465971,
"Nucleotide GTR":0.001685444830136264,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCT", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420701_England_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420805_Utah_20200314_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001712291563247341,
"Nucleotide GTR":0.001685110880494488,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "I", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ATA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420805_Utah_20200314_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421177_Madrid_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001711622839910738,
"Nucleotide GTR":0.001684452772380933,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "V", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "GTC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421177_Madrid_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001712736874546639,
"Nucleotide GTR":0.001685549122982956,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAA", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421482_Portugal_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001711479049657725,
"Nucleotide GTR":0.001684311264634788,
"amino-acid": [
["A", "M", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATG", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421482_Portugal_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421731_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712291563609049,
"Nucleotide GTR":0.001685110880850455,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTT", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421731_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421789_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712321493813496,
"Nucleotide GTR":0.001685140335946919,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "F", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TTT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421789_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421980_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001713011626513136,
"Nucleotide GTR":0.001685819513574204,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "I", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "ATA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421980_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422115_Wales_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001712845722094603,
"Nucleotide GTR":0.001685656242699786,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "F", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "TTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422115_Wales_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422197_Wales_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001712080071166823,
"Nucleotide GTR":0.001684902745610414,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCC", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422197_Wales_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00171176693433603,
"Nucleotide GTR":0.001684594579470967,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACG", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422600_Netherlands_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00171176688869307,
"Nucleotide GTR":0.001684594534552538,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCG", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422600_Netherlands_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422656_Netherlands_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001712076795451588,
"Nucleotide GTR":0.001684899521893436,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "F", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "TTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422656_Netherlands_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422717_Netherlands_20200322_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001712076789831754,
"Nucleotide GTR":0.00168489951636281,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "V", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GTT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422717_Netherlands_20200322_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422958_Zuid_Holland_20200329_null_13":{
"Global MG94xREV":0.001712975680964007,
"Nucleotide GTR":0.001685784138619823,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTA", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422958_Zuid_Holland_20200329_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001711766937085225,
"Nucleotide GTR":0.001684594582176526,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAG", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423085_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712281320451571,
"Nucleotide GTR":0.001685100800291464,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "F", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "TTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423085_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423389_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712813135444603,
"Nucleotide GTR":0.001685624173325825,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "N", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAT", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423389_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423898_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00171281316405086,
"Nucleotide GTR":0.001685624201477991,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "D", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAT", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423898_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423992_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001711545720024159,
"Nucleotide GTR":0.001684376876684914,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "S", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AGT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423992_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424018_England_20200312_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001712245415444037,
"Nucleotide GTR":0.00168506546523512,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "L", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TTA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424018_England_20200312_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424090_England_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001712813128950687,
"Nucleotide GTR":0.001685624166934991,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACT", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424090_England_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424171_Washington_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.005174428425209953,
"Nucleotide GTR":0.005092290254076159,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "L", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCA", "TTA", "GCA", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424171_Washington_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424210_Washington_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712076780432674,
"Nucleotide GTR":0.001684899507112928,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "I", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ATT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424210_Washington_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424325_Washington_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001712245411686048,
"Nucleotide GTR":0.001685065461536785,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "C", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "TGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424325_Washington_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424348_Mexico_City_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712076781062777,
"Nucleotide GTR":0.001684899507733029,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAT", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424348_Mexico_City_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424485_Reykjavik_20200320_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001712076790060475,
"Nucleotide GTR":0.001684899516587901,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "V", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GTT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424485_Reykjavik_20200320_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424636_Li_ge_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712076786477532,
"Nucleotide GTR":0.001684899513061833,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "S", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "TCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424636_Li_ge_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425440_England_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001711766868940496,
"Nucleotide GTR":0.001684594515113513,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "S", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AGT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425440_England_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425707_Scotland_20200317_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001712630919303819,
"Nucleotide GTR":0.001685444849659206,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "I", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ATA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425707_Scotland_20200317_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426025_New_York_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712630921808743,
"Nucleotide GTR":0.001685444852124368,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "V", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GTA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426025_New_York_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426028_New_York_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001712630966696035,
"Nucleotide GTR":0.001685444896299128,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "S", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "TCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426028_New_York_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426787_Victoria_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001712215112727413,
"Nucleotide GTR":0.001685035643539688,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426787_Victoria_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426843_Victoria_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001713252994748418,
"Nucleotide GTR":0.001686057050363036,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCT", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426843_Victoria_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426867_Victoria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00171305104053747,
"Nucleotide GTR":0.001685858301945693,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "H", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CAT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426867_Victoria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427002_Victoria_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001712630966696035,
"Nucleotide GTR":0.001685444896299128,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "I", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ATA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427002_Victoria_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712630932066511,
"Nucleotide GTR":0.001685444862219307,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "V", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GTA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427091_Victoria_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001712813147882895,
"Nucleotide GTR":0.001685624185566673,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "H"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"original name":"epi_isl_427091_Victoria_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001712009659363555,
"Nucleotide GTR":0.001684833451514509,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGC", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427245_Washington_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001712630941569044,
"Nucleotide GTR":0.001685444871570997,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "L", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TTA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427245_Washington_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427305_Santa_Catarina_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00171263097447026,
"Nucleotide GTR":0.001685444903949946,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAT", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427305_Santa_Catarina_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427387_Liege_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001712630965133187,
"Nucleotide GTR":0.001685444894761085,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCT", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427387_Liege_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427480_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001713043697852033,
"Nucleotide GTR":0.001685851075817042,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "T", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "ACA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427480_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427481_New_York_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001713043698932959,
"Nucleotide GTR":0.00168585107688081,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "T", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "ACT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427481_New_York_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427634_New_York_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712630951834945,
"Nucleotide GTR":0.001685444881673941,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "V", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GTT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427634_New_York_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427674_New_South_Wales_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712630921549686,
"Nucleotide GTR":0.001685444851869426,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATT", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427674_New_South_Wales_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001712630953662003,
"Nucleotide GTR":0.001685444883471996,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCT", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428349_Ile_De_France_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001727193256436756,
"Nucleotide GTR":0.001699776026238505,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "N", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "AAT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428349_Ile_De_France_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428677_Madrid_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001713011602503467,
"Nucleotide GTR":0.001685819489945662,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "D", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GAT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428677_Madrid_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428704_Madrid_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001715072950574996,
"Nucleotide GTR":0.001687848116459031,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTA", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428704_Madrid_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428720_Ankara_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712813127332576,
"Nucleotide GTR":0.001685624165342565,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "S", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "TCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428720_Ankara_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001711991241171585,
"Nucleotide GTR":0.001684815325690406,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "G", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "GGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428918_Novosibirsk_Region_20200327_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001712630916580493,
"Nucleotide GTR":0.001685444846979112,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "I", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ATA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428918_Novosibirsk_Region_20200327_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429013_California_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001712630902060832,
"Nucleotide GTR":0.001685444832689935,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCT", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429013_California_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429023_California_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001713043670956473,
"Nucleotide GTR":0.001685851049348418,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "I", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "ATT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429023_California_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429470_Unknown_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712845744765894,
"Nucleotide GTR":0.001685656265011196,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "N", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAT", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429470_Unknown_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429571_Unknown_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001711479089859915,
"Nucleotide GTR":0.001684311304198812,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "V", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "GTT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429571_Unknown_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429627_Washington_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001712291569105502,
"Nucleotide GTR":0.001685110886259658,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "S", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "TCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429627_Washington_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429694_Minas_gerais_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001711479082819871,
"Nucleotide GTR":0.001684311297270518,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTG", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429694_Minas_gerais_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430132_Washington_20200317_null_20":{
"Global MG94xREV":0.00171319403479458,
"Nucleotide GTR":0.001685999026331464,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "I", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATA", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430132_Washington_20200317_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430228_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712153698084413,
"Nucleotide GTR":0.001684975203784356,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "L", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "CTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430228_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430354_New_York_20200403_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001712441945788054,
"Nucleotide GTR":0.001685258875883262,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "TTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430354_New_York_20200403_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430399_New_York_20200410_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001712291475328213,
"Nucleotide GTR":0.001685110793970976,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTT", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430399_New_York_20200410_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430482_Victoria_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00171229155367692,
"Nucleotide GTR":0.001685110871075989,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "M", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ATG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430482_Victoria_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430593_Victoria_20200408_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001712291656845684,
"Nucleotide GTR":0.001685110972607065,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAT", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430593_Victoria_20200408_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430803_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200401_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001712291546057094,
"Nucleotide GTR":0.001685110863577117,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "F", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TTT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430803_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200401_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430849_Halland_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001711991238723523,
"Nucleotide GTR":0.001684815323281204,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "G", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GGT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430849_Halland_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430909_USA_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712845749769113,
"Nucleotide GTR":0.001685656269934994,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "L", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CTT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430909_USA_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430916_USA_20200407_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001713221645661742,
"Nucleotide GTR":0.001686026198907489,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "H", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAT", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430916_USA_20200407_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431011_Kinshasa_20200407_null_14969":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431011_Kinshasa_20200407_null_14969",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432385_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712845730621799,
"Nucleotide GTR":0.001685656251091623,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "F", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "TTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432385_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432600_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712522015623402,
"Nucleotide GTR":0.001685337674700962,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCC", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432600_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433057_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00171249292705863,
"Nucleotide GTR":0.0016853090478841,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAT", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433057_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433296_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001715105571283491,
"Nucleotide GTR":0.001687880219350849,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACA", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433296_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433360_Scotland_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001713043707533784,
"Nucleotide GTR":0.001685851085345105,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "I", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "ATA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433360_Scotland_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433576_Scotland_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001711991244733803,
"Nucleotide GTR":0.001684815329196078,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTG", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433576_Scotland_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434248_Washington_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001713043669882153,
"Nucleotide GTR":0.001685851048291153,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "T", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "ACT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434248_Washington_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434249_Washington_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001713043702267259,
"Nucleotide GTR":0.001685851080162184,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTA", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434249_Washington_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434385_Antwerp_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712630921549686,
"Nucleotide GTR":0.001685444851869426,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAT", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434385_Antwerp_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434632_Occitanie_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00171263089672035,
"Nucleotide GTR":0.001685444827434227,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "V", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GTT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434632_Occitanie_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434666_Vasterbotten_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001712845754981526,
"Nucleotide GTR":0.001685656275064667,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "F", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "TTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434666_Vasterbotten_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":3469.631651292931,
"Equilibrium frequencies": [
[0.03814058990655009],
[0.01352490888731432],
[0.02397989236844064],
[0.0518808280793833],
[0.02905844503129594],
[0.0103043194250075],
[0.01826973274278217],
[0.03952681892484233],
[0.01036507372269113],
[0.003675524632764485],
[0.006516767382729971],
[0.01409911616874917],
[0.02824324510284562],
[0.01001524406502356],
[0.01775719723688423],
[0.03841794128446285],
[0.01520569029585032],
[0.005392039722615216],
[0.009560177689326007],
[0.02068357636838433],
[0.01158486842252523],
[0.004108072011211085],
[0.007283681205648915],
[0.01575834480861265],
[0.004132293215890474],
[0.001465338878541772],
[0.002598070632747958],
[0.005620961669247749],
[0.01125986879164416],
[0.003992824963201418],
[0.007079346238953171],
[0.01531626328819264],
[0.03588452323313355],
[0.01272489251954375],
[0.02256144980797925],
[0.04881200802426797],
[0.02733959931923329],
[0.009694805211830481],
[0.01718905372669439],
[0.0371887549593662],
[0.009751965811917755],
[0.003458112457136927],
[0.006131291915606685],
[0.01326513467578121],
[0.02657261955190933],
[0.009422829044265002],
[0.01670683537836094],
[0.03614546890777669],
[0.008286094055218293],
[0.03178501420675705],
[0.01780278230587929],
[0.006312985961089139],
[0.01119303095730172],
[0.02421627694823334],
[0.002251826098283306],
[0.003992525784770883],
[0.008637884635162468],
[0.01730334653612839],
[0.006135882688761761],
[0.01087902385796425],
[0.02353691825528636]
],
"Log Likelihood":-1616.123248581114,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.6697095014590789, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":118
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":3752.464784103299,
"Equilibrium frequencies": [
[0.3249476919053223],
[0.1795802275402119],
[0.2035111808552373],
[0.2919608996992284]
],
"Log Likelihood":-1664.498719753798,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.03743678653123737,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.2317521313848301,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.1775758652042667,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.016281171695308,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.6685698799074486
},
"display order":0,
"estimated parameters":211
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-01/sequences.nsp8.compressed.fas",
"number of sequences":103,
"number of sites":198,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_432600_England_20200329_null_1,epi_isl_429023_California_20200331_null_2,epi_isl_430803_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200401_null_6,epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1,epi_isl_424636_Li_ge_20200403_null_1,epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1,epi_isl_430399_New_York_20200410_null_8,epi_isl_419986_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_421393_New_York_20200318_null_2,epi_isl_434632_Occitanie_20200409_null_1,epi_isl_420640_England_20200323_null_3,epi_isl_424018_England_20200312_null_8,epi_isl_430916_USA_20200407_null_3,epi_isl_427245_Washington_20200401_null_3,epi_isl_430228_Washington_20200323_null_1,epi_isl_423992_England_20200321_null_1,epi_isl_421789_England_20200325_null_1,epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1,epi_isl_431011_Kinshasa_20200407_null_14969,epi_isl_418697_England_20200316_null_2,epi_isl_429627_Washington_20200327_null_2,epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1,epi_isl_424348_Mexico_City_20200313_null_1,epi_isl_427674_New_South_Wales_20200322_null_1,epi_isl_418081_Washington_20200315_null_2,epi_isl_423389_England_20200330_null_1,epi_isl_424325_Washington_20200324_null_3,epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_10,epi_isl_427634_New_York_20200406_null_1,epi_isl_422600_Netherlands_20200401_null_2,epi_isl_428349_Ile_De_France_20200323_null_2,epi_isl_433576_Scotland_20200402_null_2,epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1,epi_isl_422197_Wales_20200329_null_2,epi_isl_430909_USA_20200408_null_1,epi_isl_426025_New_York_20200303_null_1,epi_isl_427305_Santa_Catarina_20200310_null_1,epi_isl_422656_Netherlands_20200318_null_2,epi_isl_426843_Victoria_20200324_null_4,epi_isl_418307_Derbyshire_20200324_null_2,epi_isl_421482_Portugal_20200318_null_1,epi_isl_424090_England_20200313_null_2,epi_isl_428677_Madrid_20200311_null_1,epi_isl_434248_Washington_20200401_null_1,epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_1,epi_isl_430354_New_York_20200403_null_9,epi_isl_420031_Kinshasa_20200321_null_1,epi_isl_420805_Utah_20200314_null_4,epi_isl_432385_Wales_20200401_null_1,epi_isl_420498_England_20200322_null_1,epi_isl_414008_England_20200227_null_1,epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1,epi_isl_434249_Washington_20200402_null_1,epi_isl_420701_England_20200327_null_3,epi_isl_423898_England_20200318_null_1,epi_isl_426787_Victoria_20200323_null_2,epi_isl_433057_England_20200404_null_1,epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_430482_Victoria_20200331_null_3,epi_isl_417554_Reykjavik_20200316_null_2,epi_isl_420388_Vilvoorde_20200324_null_1,epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_3,epi_isl_426028_New_York_20200304_null_2,epi_isl_427387_Liege_20200407_null_2,epi_isl_422717_Netherlands_20200322_null_5,epi_isl_428720_Ankara_20200321_null_1,epi_isl_429013_California_20200328_null_2,epi_isl_427480_New_York_20200401_null_1,epi_isl_422958_Zuid_Holland_20200329_null_13,epi_isl_428704_Madrid_20200311_null_3,epi_isl_421731_New_York_20200318_null_1,epi_isl_420318_Arbre_20200307_null_1,epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1,epi_isl_429694_Minas_gerais_20200318_null_1,epi_isl_433296_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_421177_Madrid_20200327_null_1,epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1,epi_isl_430593_Victoria_20200408_null_3,epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1,epi_isl_424210_Washington_20200320_null_1,epi_isl_434385_Antwerp_20200411_null_1,epi_isl_427481_New_York_20200401_null_2,epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2,epi_isl_429470_Unknown_20200323_null_1,epi_isl_428918_Novosibirsk_Region_20200327_null_5,epi_isl_430849_Halland_20200311_null_1,epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1,epi_isl_427091_Victoria_20200403_null_2,epi_isl_433360_Scotland_20200328_null_1,epi_isl_427002_Victoria_20200327_null_2,epi_isl_422115_Wales_20200330_null_2,epi_isl_424485_Reykjavik_20200320_null_5,epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1,epi_isl_415537_Wales_20200308_null_1,epi_isl_423085_England_20200325_null_1,epi_isl_430132_Washington_20200317_null_20,epi_isl_434666_Vasterbotten_20200408_null_1,epi_isl_425440_England_20200101_null_2,epi_isl_425707_Scotland_20200317_null_6,epi_isl_429571_Unknown_20200326_null_1,epi_isl_421980_England_20200331_null_1,epi_isl_424171_Washington_20200319_null_1,epi_isl_426867_Victoria_20200326_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":"test",
"epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1":"test",
"epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_414008_England_20200227_null_1":"test",
"epi_isl_415537_Wales_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1":"test",
"epi_isl_417554_Reykjavik_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418081_Washington_20200315_null_2":"test",
"epi_isl_418307_Derbyshire_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418697_England_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1":"test",
"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_419986_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420031_Kinshasa_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420318_Arbre_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_420388_Vilvoorde_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420498_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420640_England_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_420701_England_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_420805_Utah_20200314_null_4":"test",
"epi_isl_421177_Madrid_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_421482_Portugal_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421731_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421789_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_421980_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_422115_Wales_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_422197_Wales_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_422600_Netherlands_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_422656_Netherlands_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_422717_Netherlands_20200322_null_5":"test",
"epi_isl_422958_Zuid_Holland_20200329_null_13":"test",
"epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423085_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423389_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423898_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423992_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424018_England_20200312_null_8":"test",
"epi_isl_424090_England_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_424171_Washington_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424210_Washington_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424325_Washington_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_424348_Mexico_City_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_424485_Reykjavik_20200320_null_5":"test",
"epi_isl_424636_Li_ge_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_425440_England_20200101_null_2":"test",
"epi_isl_425707_Scotland_20200317_null_6":"test",
"epi_isl_426025_New_York_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_426028_New_York_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_426787_Victoria_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_426843_Victoria_20200324_null_4":"test",
"epi_isl_426867_Victoria_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_427002_Victoria_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_427091_Victoria_20200403_null_2":"test",
"epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_10":"test",
"epi_isl_427245_Washington_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_427305_Santa_Catarina_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_427387_Liege_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_427480_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_427481_New_York_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_427634_New_York_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_427674_New_South_Wales_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_428349_Ile_De_France_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_428677_Madrid_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_428704_Madrid_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_428720_Ankara_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_428918_Novosibirsk_Region_20200327_null_5":"test",
"epi_isl_429013_California_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_429023_California_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_429470_Unknown_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_429571_Unknown_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_429627_Washington_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_429694_Minas_gerais_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_430132_Washington_20200317_null_20":"test",
"epi_isl_430228_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_430354_New_York_20200403_null_9":"test",
"epi_isl_430399_New_York_20200410_null_8":"test",
"epi_isl_430482_Victoria_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_430593_Victoria_20200408_null_3":"test",
"epi_isl_430803_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200401_null_6":"test",
"epi_isl_430849_Halland_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_430909_USA_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430916_USA_20200407_null_3":"test",
"epi_isl_431011_Kinshasa_20200407_null_14969":"test",
"epi_isl_432385_Wales_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_432600_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_433057_England_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_433296_Scotland_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_433360_Scotland_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_433576_Scotland_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_434248_Washington_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_434249_Washington_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_434385_Antwerp_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_434632_Occitanie_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_434666_Vasterbotten_20200408_null_1":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":2
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":2
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":4
}
}
}